Evolúciós kártyajáték fiúknak és lányoknak: everyday i’m shuffling

Az állatvilágban (ha és amennyiben kétivarú fajokról beszélünk) a nemek kialakításáért felelős folyamatoknak (szexdetermináció) megdöbbentően széles spektrumával találjuk szembe magunkat. Csak a „magasabbrendű” magzatburkos gerincesekre szorítkozva eddig három egészen különböző logikájú rendszert írtak le: az emlősöknél és a madaraknál egyaránt az ivari kromoszómák játszák a fő szerepet, de míg előbbi esetben a hímek (XY), addig utóbbi esetben a nőstények (ZW) a különböző nemi kromoszómákat hordozó, ún. heterogametikus egyedek. A hüllők szerteágazó rokonságában szintén találkozhatunk kromoszomális szexdeterminációval, de a harmadik nagy kategóriát is a hüllők képviselői közt lelhetjük fel: sokuknál környezeti faktoroktól, pl. a fészekalj hőmérsékletétől függ a kifejlett példányok neme (nagyon sok hüllőfajt éppen ezért a klímaváltozás az ivararányok drasztikus eltolódása révén különösen érzékenyen érint). És persze előfordulhatnak előzőek furcsa kombinációi, mint a szakállas agámák esetén.

Adja magát a kérdés, hogy az egymással közelebbi, vagy távolabbi rokonságban álló magzatburkos csoportok milyen evolúciós utat járhattak be, ami végül az egyes csoportok eltérő ivarmeghatározó rendszereinek megjelenéséhez vezetett? Egy másik érdekes kérdés, hogy a sokféle szexdeterminációs rendszer közül melyik hasonlíthat legjobban a magzatburkosok utolsó közös ősében működő rendszerhez. A kérdés megvizsgálására a modern genetikai eszközök és új tudományágként az összehasonlító genomika kiváló lehetőségeket kínál.

Vegyük rögtön (nem minden nárcizmustól mentesen) a saját példánkat! Ha kíváncsiak vagyunk rá, hogy honnan származik a Homo sapiens ivarmeghatározása, akkor először körbe kell nézni a méhlepényes emlősök (Placentalia) között, majd vetni kell egy pillantást az erszényesek (Marsupialia) szexkromoszómáira, végül meg kell nézni az emlősök osztályának legkorábban (kb. 160-180 millió éve) leágazott rendjét, a kacsacsőrű emlőst (Ornithorhynchus anatinus) és a 4 recens hangyászsünfajt magába foglaló Monotremata csoportot.

Ahogy az emlősök családfájának ágain ugrálva távolodunk saját fajunktól, úgy végigkövethetjük az X és az Y kromoszóma változásait is, de ha leérünk a fa legalsó ágához, ott nagy meglepetések fogadnak. A Monotremata csoportnak ugyanis nem pusztán 1, hanem rögtön 5 pár szexkromoszómája van. Ez az öt pár kromoszóma ráadásul egy nagyon különleges multikromoszómás komplexet alkot a sejtosztódások során, megelőzendő a homológok véletlenszerű kiosztását a leánysejtek között. Különösen fontos ez az ivarsejteket képző számfelező osztódás (meiózis) során, hisz egy ivarsejtbe (gaméta) vagy csak X, vagy csak Y kromoszómák kerülhetnek.

A Monotremata, Marsupialia és a méhlepényeseket is magába foglaló Eutheria csoportok viszonyait mutató, néhány fontos evolúciós újítást is feltüntető törzsfa (Warren és mtsai. 2008)

A Monotremata szexkromoszómák (miként más állatoknál is) tartalmaznak nem rekombinálódó, a nemek kialakítását szabályozó régiókat (SDR – sex determination region), illetve olyan régiókat, amelyek lehetővé teszik a kromoszómapárok egymásra találását – ezek a régiók ugyanúgy működnek, mint a nem-kromoszómák, azaz automszómák (nevük is ennen ered: pszeudoautoszómális régiók – PAR). A trükk, ami a különleges multikromoszómás komplex kialakulását eredményezi abban áll, hogy nem csak a kromoszómapárokon, de a sorban egymást követő X és Y kromoszómákon is találhatók egymáshoz illeszkedő PAR-ok. Így tehát a kacsacsőrű emlős X1-es kromoszómája nőstény egyedekben kapcsolódhat egy másik X1-hez és X2-höz is, míg hímekben az egyik X1 helyett Y1 áll. Az Y1 X2-höz, az X2 Y2-höz és X3-hoz, X3 Y3-hoz és X4-hez, ami Y4-hez és X5-höz, ami végül Y5-höz illeszkedik meióziskor.

További érdekesség, hogy a szekvenciaelemzések az így kialakuló kromoszómaláncok két végén is feltártak egy-egy, mostanra már erősen mutálódott PAR elemet, amelyek a mai Monotrematák őseinél elvileg lehetővé tehették, hogy a láncszerű multikromoszómás komplex gyűrűvé záródjon. Ha ez a hipotetikus őskromoszóma-komplex valóban képes volt a saját farkába harapni, az már csak azért is izgalmas, mert eddig az egész élővilágban csak egy növényél, pontosabban egy ligetszépe fajnál figyeltek meg gyűrűbe záródó meiotikus kromoszómaláncot. Ritka kuriózum hát az ilyen!

A kacsacsőrű emlős és a hangyászsün genomok feltérképezésének korai szakaszában, Rens és munkatársai közöltek egy izgalmas összehasonlító tanulmányt, amelyben akkor főleg in situ hibridizációs (FISH) módszerek segítségével vetették össze egymással a kacsacsőrű emlős és a hangyászsünök, valamint a méhlepényesek és a madarak ivari kromoszómáit. Ami már az elején feltűnő volt, hogy a Monotremata fajok szexkromoszómái néhány apróbb különbséget leszámítva erősen konzerváltak. Az egy már korábban megfigyelt különbség, hogy a hangyászsünök Y5-ös kromoszómája hiányzik. Ez a kromoszóma a kacsacsőrű emlősnél is meglehetősen apró, így korábban elfogadható magyarázatnak számított, hogy a hangyászsünök egyszerűen elveszítették azt valamikor az evolúciójuk során. Rensék kutatásai annyival árnyalták ezt a képet, hogy a hangyászsün Y3-as kromoszómáján találtak olyan régiókat, amelyek az elveszettnek hitt Y5-nek felelnek meg. Az újabb értelmezés szerint tehát ez a kromoszóma nem eltűnt, csak integrálódott a hármas sorszámú Y kromoszómába, hasonlóan ahhoz, amikor két kártyapaklit egybekeverünk.

A rövidcsőrű hangyászsün (Tachyglossus aculeatus) és szexkromoszómái, amint láncszerű komplexet alkotnak (Rens és mtsai. 2007).

Visszatérve eredeti kérdésünkhöz, hogy honnét származik a méhlepényesek, illetve az ember X és Y kromoszómája, egy dolgot már biztosan elmondhatunk: nem a legelső emlősöktől örököltük őket. A Monotremata szexkromoszómák ugyanis nem mutatnak semmilyen homológiát a Placentalia szexkromoszómákkal. A mi magányos és aprócska Y kromoszómánkon található SRY lókusz pedig, ami a méhlepényeseknél kulcsszerepet tölt be a herék fejlődésének kezdetén, s így végső soron a hím nemi jellegek megjelenésének forrása, mind a kacsacsőrű emlős, mind pedig a hangyászsünök genomjából hiányzik.

A méhlepényesek X kromoszómájának hosszú karján található egy, a dóziskompenzációban fontos lókusz, az XIST. Ennek a szakasznak a megfelelőjét kimutatták ugyan a kacsacsőrű emlős genomjában, de nem az egyik ivari kromoszómán, hanem a 6-os autoszómán, arra pedig egyelőre semmi nem utal, hogy ez a lókusz bármiféle szerepet is betöltene a kacsacsőrű emlősök szexdeterminációjában. Jelenleg úgy tűnik tehát, hogy a Monotremata és a többi emlős szexdeterminációs rendszere egymástól függetlenül jelent meg a két csoport elválását követően, és semmiféle közös eredettel nem bír.

Nagyfokú homológia mutatható ki azonban a kacsacsőrű emlős X5-ös, a hangyászsünök X4-es szexkromoszómája, valamint a madarak Z kromoszómája között. A madarak szexdeterminációjában fontos szerepet játszó, dózisfüggő transzkripciós faktorok, a DMRT-1, -2 és -3 mind megtalálható a kacsacsőrű emlős X5-ös szexkromoszómáján, de találtak olyan Z kromoszómára térképezett géneket is, amelyek ortológjai a kacsacsőrű emlős X2 és X3 ivari kromoszómáján helyezkednek el. Ugyanezek a Monotremata kromoszómarégiók nagyfokú egyezést mutattak a humán 9-es autoszómával is, ami többé-kevésbé megfeleltethető a madarak Z kromoszómájának, illetve a humán 5-ös és 18-as kromoszómáknak azon részleteivel, amelyek a madarak 2-es autoszómájával hibridizáltathatók.

Azt jelentené ez, hogy a Monotremata és a madár szexdetermináció (az XY és a ZW rendszerek eltérő logikája ellenére) azonos gyökerekre vezetnek vissza? A hüllőket és madarakat magába foglaló Sauropsida, valamint az összes mai emlőst, és egy seregnyi emlősszerű őshüllőt tartalmazó Synapsida csoportok több mint 300 millió éve, a késő Karbonban válhattak el egymástól. Ha tehát elfogadjuk az iménti felvetést, azzal azt is feltételezzük, hogy a legkorábbi magzatburkosok nemmeghatározása szempontjából a DMRT gének fontosak lehettek.

Árnyalja a képet egy idén januárban a Nature hasábjain megjelent cikk, amelynek szerzői már elég részletes genomi információk birtokában kísérelnek meg rendet tenni az emlős kromoszómák háza táján. A kísérlet nem volt sikeres, hisz a rendcsinálás közben a kupleráj, amelybe a fenti sorok olvasása közben betekintést nyerhettünk, csak sokszorosára duzzadt.

A fali gyík, a házityúk, a kacsacsőrű emlős, a tasmán ördög, egy oposszum faj és az ember genomjának konzervált kromoszómális régióit és e régiók egymáshoz viszonyított pozícióját elemezték, s megállapították, hogy e régiók igencsak össze lettek keverve az elröppent év-százmilliók alatt. A szerzők ötszáznál is több független kromoszómaátrendeződési eseményt azonosítottak (transzlokációk, kromoszómafúziók és fragmentálódások).

Most képzeljük el, hogy valaki egyszer az aztalon felejtett néhány pakli kártyát, amiket minden arra járó ember keverget egy kicsit. Nekünk pedig egyszer csak a mániánkká válik, hogy lépésről-lépésre megértsük a paklik összekeveredésének történetét. Szerencsénkre a kártyaasztal a rajta lévő paklikkal együtt, valami rejtélyes módon párszor lemásolta saját magát, így az egyes másolatokból kinyerhetünk némi információt arra vonatkozóan, hogy a másolatkészítés pillanatában hogyan néztek ki az „ősasztal” „őskártyapaklijai”. De jaj! Valaki aljas módon tovább keverte az összes másolat-kártyapaklit is! Ön hogy állna neki az eredeti kártyapaklik rekonstrukciójának?

A rekonstruált emlős-őskromoszómák (MAC), és a kromoszómaátrendeződési események az egyes leszármazás ágakon, színkódolva. Az ágakon a beazonosított események száma, az elágazási pontoknál pedig az ott jelölt közös ős diploid kromoszómaszerelvénye látható (Zhou és mtsai. 2021).

A megoldás kulcsát az asztalmásolatok jelentik. Ha ezeket összehasonlítva az egyes paklik kártyasorrendjében hasonlóságot találunk, akkor az a másolatkészítés előtt alakult ki, ha pedig különbségeket, akkor azok olyan kevergetésből származnak, amelyek a másolatkészítést követően történtek. A kártyás allegóriát feloldva: a kártyalapok kromoszómarégiókat, a paklik kromoszómákat, az asztalok pedig fajokat jelölnek, amelyek összehasonlítása révén nyílik lehetőségünk a keverés történetének és végső soron az „őskártyapaklik” rekonstrukciójára. Zhou és munkatársai elvégezték hát ezt a heroikus rekonstrukciót, és egyebek mellett megállapították, hogy az emlősök közös ősének valószínűleg 30 pár kromoszómája volt. A szerzők azon túl, hogy mind a 30 őskromoszómáról (Mammalian Ancestral Chromosome – MAC) leírták a konzervált régiók relatív sorrendjét, fontos megállapításokat tettek a szexkromoszómákkal kapcsolatban is.

Úgy tűnik, hogy a Monotremata 5 pár ivari kromoszómájának mindegyike több, különböző kártyapakli lapjaiból tevődött össze. Az a hasonlóság tehát, amit anno Rens és szerzőtársai a madarak és a Monotremata szexkromoszómák között megfigyeltek szinte biztosan nem arra vezethető vissza, hogy a madár Z és a kacsacsőrű emlős X5 kromoszómája egy közös őskromoszóma két távoli leszármazottja lenne.

Az új tanulmányok fényében az a fentebb megfogalmazott elmélet is megingott kissé, hogy DMRT gének ivari determinációban betöltött szerepe egy ősi magzatburkos vonás lenne. Hiszen egy ilyen viharos sorsú kártyaasztalnál nem elképzelhetetlen az sem, hogy két független kiosztásban kap egy gén hasonló szerepet, s kerül mondjuk szexkromoszómára. Tartsuk szem előtt, hogy a madarak és az emlősök utolsó közös őse több mint 300 millió éve élt a Földön, és hogy ismerünk olyan állatokat is, ahol egy fajon belül kettő, vagy több tök különböző szexdeterminációs rendszer is működik!

Na és mit tudunk meg végre a saját ivari kromoszómáinkról?

Korábban említettük az Y kromoszómánkon található SRY lókuszt, amely a Theria (tehát erszényes és méhlepényes) közös ősben már jelen volt és a maihoz hasonló szerepet tölthetett be, de a Monotremataban még nyomát sem látni. Az X kromoszómánk szintén a Monotremata-Theria elvállást követően jelenhetett meg, de a méhlepényeseknél fontos dóziskompenzációs gén, az XIST csak a méhlepényes-erszényes elvállást követően bukkant fel az X kromoszóma történetében. Fontos különbség még a kenguruk és az ember X kromoszómája között, hogy a méhlepényesek X kromoszómája az ősidőkben fuzionált egy ősi Theria autoszómával, míg az erszényeseknél ilyen fúziós esemény nem történt.

Szövevényes történetek játszódhattak a kártyaasztalok körül, és egyenlőre csak a legfontosabb események vázlatát látjuk. Ugyanakkor nem tudunk semmit azokról a játékosokról, akiknek a lapjárása olyan szerencsétlenül alakult, hogy kihajították őket az evolúció kaszinójából, és azok se buktak még le, akik cinkelt kártyával játszottak. Egyszer majd talán ezekre a történetekre is fény derül.

__________

Nicole Valenzuela és mtsai. (2019) Extreme thermal fluctuations from climate change unexpectedly accelerate demographic collapse of vertebrates with temperature-dependent sex determination” Scientific Reports

Craig A Smith és mtsai. (2009) The avian Z-linked gene DMRT1 is required for male sex determination in the chicken Nature

Hieronim Golczyk és mtsai. (2014) Translocations of Chromosome End-Segments and Facultative Heterochromatin Promote Meiotic Ring Formation in Evening Primroses. Plant Cell

Willem Rens és mtsai. (2007) The multiple sex chromosomes of platypus and echidna are not completely identical and several share homology with the avian Z. Genome Biology

Yang Zhou és mtsai. (2021) Platypus and echidna genomes reveal mammalian biology and evolution. Nature

Horizontális méregtelenítés

“"A dohánymolytetű (Bemisia tabaci) elég bosszantó mezőgazdasági kártevő, ami a leveleken él és a növényi nedvek szivogatásával táplálkozik és eközben növényi vírusokat is terjeszt. Ráadásul, bosszantó módon, eléggé ellenálló mindenféle vegyszeres beavatkozásokkal szemben, vagyis igen csak bonyolult megszabadulni tőle.

Persze kártevőik ellen maguk a növények is igyekeztek mindenféle specifikus méreganyagokat kifejleszteni az évmilliós, evolúciós fegyverkezési versenyben, amelyek ellen a kártevők vagy kitaláltak frappáns molekuláris riposztokat, vagy kénytelenek voltak más táplálék után nézni.

A fenolos glikozidok termelése az egyik szép példája ennek az evolúciós versenynek, mert ezáltal a növények nagyon sok kártevőjük viselkedését és fejlődését befolyásolni tudják. A nagyon sok persze nem minden és pont a dohánymolytetű köszöni szépen, de remekül elvan a fenolos glikozidok jelenlétében is.

Hogy miért, arra kerestek a rovar genomjában választ és ha nem is páratlan, de nem mindennapi válaszra bukkantak. Ugyanis, a jelek szerint a dohánymolytetű azért képes a toxikus vegyület elemésztésére, mert rendelkezik egy olyan enzimmel, amit a növények is arra használnak, hogy detoxifikálják ezeket a glikozidokat. Mármint, nem egy hasonló enzimmel, hanem konkrétan egy növényi enzimmel (ami BtPMaT1 nevű fenolos glikozid malonil-transzferáz, az érdeklődők kedvéért)!

Különböző dohánymolytetű populációk genomjában és transzkriptomjában jelen levő BtPMaT1 gén. (Forrás: Cell)

Azaz a bonyolultabb testfelépítésű eukariótákban nagyon-nagyon ritka horizontális géntranszfer (HGT) jelenségével állunk szemben, amely révén két nagyon távoli csoportból nem szaporodás útján kerül át egy gén. Nevezhetjük ezt “természetes GMO-nak” is, annál is inkább, hogy pontosan az.

A jelenséget egyébként nem könnyű jól dokumentálni, néha egészen egyszerűen szekvenálási-szennyeződést vélnek HGT-nek (az egyik legutóbbi nagyon kínos baki 2016-ban a medveállatkákhoz kapcsolódik), de azért már van annyi konkrétumunk is, hogy ne tartsuk elképzelhetetlennek a dolgot: a levéltetvek karotenoid szintézisében részt vevő génekről már kiderült, hogy gomba-eredetű, a kullancsok pedig a táplálkozásuk során a nyálukban egy olyan anyagot választanak ki, aminek a génje a gerincesekből került át. (Egyébb HGT-re itt vannak még példák.)

Számos különböző populáció megszekvenálása és mindenféle egyéb kontrollok alapján most is szinte biztosra vehető, hogy a dohánymolytetű esetében nem kísérleti műtermékről van szó, hanem a BtPMaT1 valóban benne van a genomukban, annál is inkább, mert a gén mesterséges csendesítése befolyásolja a rovar fitneszét. Alább olyan állatokat hasonlítottak össze, ahol nem csendesítették a gént (dsEGFP) olyanokkal, amelyekben igen (dsBtPMaT1) és jól látható, hogy több olyan fenolos glikozid is van, amelyen 96 órán át táplálkozva azok az állatok, akikben nem működik a gén nagyobb mortalitást mutatnak.

BtPMaT1 csendesített (dsBtPMaT1) és kontroll (dsEGFP) állatok mortalitása 96 órás fenolos glikozid kúra után. (Forrás: Cell)

Mindez persze egy lehetőséget is nyújt arra, hogy ez a kártevőt egy kicsit kordában tartsuk, hiszen, ahogy az elején is utaltam rá, a klasszikus növényvédő szerekre eléggé ellenálló. A biológiai védekezés ebben az esetben azt jelentette, hogy olyan transzgénikus paradicsomokat hoztak létre, amelyek egy olyan kettős szálú RNS-t tartalmaztak, ami a dohánymolytetű BtPMaT1 génjével azonos szekvenciát tartalmazott (ez bejutva az állatba csendesíti a szóbanforgó gén expresszióját és így nem tud ez a kulcsfontosságú enzim termelődni).

A transzgénikus növényekkel pedig nem boldogultak már a normális dohánymolytetűk sem. A mortalitásbeli különbség a kontroll és a GMO növényeken (alul balra, illetve jobbra) táplálkozó rovarok esetében már egy nap után jelentős volt, de 3 nap után már igazán látványos lett. Ráadásul, ez elég rovar-specifikus hatásnak bizonyult, hiszen például a zöld őszibarack levéltetű (Myzus persicae) esetében nem lehetett ilyen különbséget tapasztalni.

Kontroll (balra) és transzgénikus (jobbra) paradicsomokon táplálkozó dohánymolytetvek (fent) és zöld őszibarack levéltetvek (lent). (Forrás: Cell)

Összességében nem csak az eukarióták közt is ritka, de látványos HGT egy újabb szép példáját láthatjuk itt, de az is megfigyelhető, hogyan dolgozható ki, pont a dohánymolytetvek látszólagos előnyére építve, egy nagyon is szűk-spektrumú, specifikus növényvédelmi rendszer.

(A borítókép a Wikimedia-ról származik.)


Xia J, Guo Z, Yang Z, Han H, Wang S, et al. (2021)Whitefly hijacks a plant detoxification gene that neutralizes plant toxins. Cell https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.02.014.

“Dobj egy dNTP-t sebzésre!” – Véletlenszámok DNS-sel

Mire jó egy véletlenszám?

A véletlenszámok generálása mindig is a hétköznapok szerves részét képezte. Már az ókori Egyiptomból és Mezopotámiából (i.e. 3000 környéke) is maradtak fenn olyan népszerű társasok, ahol a fej-vagy-írás a játék központi mechanizmusa. Sokkal később már volt életművész, aki a fizikai Nobel-díjat a makao nevű kártyajátékon nyerte el Noah Bertinus professzortól. Az én gimnazista éveimnek pedig legizgalmasabb pillanatai közé sorolható, mikor d10-esekkel (10 oldalú dobókocka) egész orkhordákat tettünk el láb alól, ha a sors nekünk kedvezett. Akkor még ciki volt szerepjátékozni, aztán jött a Trónok Harca és a Stranger Things…

Manapság azonban a kocka és érme már nem elég hatékony. Számítógépes szimulációk során például másodpercenként több ezer random számra is szükség lehet. De talán ennél is fontosabb ipar napjainkban a kriptográfia (meg vannak véletlensevendéglátóegység kaszinók). Legyen szó banki átutalásról vagy bármilyen kommunikációról a digitális térben, a bizalmas információk titkosítása hatalmas nagyságrendben igényel véletlenszámokat.

Pszeudo és valódi random számok

Léteznek úgynevezett pszeudo (nem valódi) random számok. Könnyen lehet ilyeneket generálni egyszerűbb matematikai szabályokkal is, amik egy kezdeti értékből kiindulva randomnak tűnő számsorozatokat eredményeznek. A legtöbb területen (modellezés, számítógépes játékok) ezek is megállják a helyük. Azonban még a komolyabb pszeudorandom generátorok is rejtenek magukban hátrányokat. Legnagyobb veszélyük, hogy determinisztikusak, azaz ha valaki ismeri az algoritmust és generátor belső állapotát, akkor meg tudja jósolni, hogy az egyes lépésekben milyen számok keletkeznek. Virtuális lottósorsolásokon hasonló manőverrel már nyert valaki körülbelül 7,5 milliárd forintnak megfelelő dollárt (majd 25 év letöltendőt), illetve az Amerikai Nemzetbiztonsági Ügynökséggel (NSA) kapcsolatban is felmerült, hogy egyes titkosításra használt számgenerátorokba ilyen kiskapukat épít.

Pont ezért olyan izgalmas piac a valódi random számok területe. Ezek a számgenerátorok szoftveres és algoritmikus megoldások helyett ténylegesen véletlenszerű fizikai folyamatok valós idejű mérésére építkeznek. Az eképpen keletkezett adatok teljesen jósolhatatlanok, így biztonságosabbak is kriptográfiai szempontból. Ilyen véletlen forrása lehet, a teljesség igénye nélkül, a radioaktív bomlás, atmoszférikus rádiózajok, áramkörökben fellépő fluktuációk és egyéb kvantummechanikai események (ezek közül a kedvencem a kaotikus félvezető lézer, ami úgy hangzik, mint a hatodik Halálcsillagra tervezett szuperfegyver).

D&D: DNS és Digitalizációja

Egy ilyen, valódi véletlenszám-generátorokkal kapcsolatos felvetés, hogy kémiai folyamatokat molekuláris szinten figyeljünk meg, és ezt használjuk ki valamilyen módon. Itt jön a képbe a DNS, mint egy lehetséges rendszer, melyet mostanság sikerült megvalósítani Meisernek és munkatársainak.

Hogy zajlik ez gyakorlatban? Vegyük e nukleinsav építőköveit, a négyféle dNTP-t (leánykori nevükön dezoxiribonukleotid-trifoszfátokat): dATP, dTTP, dCTP és dGTP. Ezek elegyéből indulunk ki egy véletlenszerű DNS szintézise során. Nem egy meglévő DNS-t másolunk; minden egyes polimerizációs lépés olyan, mintha dobnánk egy négyoldalú dobókockával: először mondjuk egy G-t, aztán A-t, T-t, újra T-t satöbbi. Így jutunk egy random DNS-szálhoz (1. ábra). Sőt, nem is kell nekünk szenvedni a laborban! Random DNS-ek már kereskedelmi forgalomban is kaphatóak, ha valaki szeretne egyet otthonra. Pont olyan izgalmas a tartásuk, mint egy cserép petúniának.

1. ábra: Random DNS-ek szintézise (forrás: Meiser és mtsai., 2020)

Ami ezek után még hátravan, az a generált random DNS-ek beolvasása (szekvenálás) és random számokká alakítása. A szekvenálás manapság elterjedt újgenerációs technológiákkal könnyen és gyorsan megoldható. A DNS-ek random számmá való átdolgozása sem kihívás. A digitális világ amúgy is bináris értékekkel operál. Rendeljünk mindegyik bázishoz nullát vagy egyet a következőképpen: A→0, C→0, T→1, G→1. Így lesz mondjuk a GATTACA szekvenciából 1011000, mint random bitek sorozata.

Az olvasóban felmerülhet, hogy megduplázhatnánk a hatékonyságot, ha kettesével osztanánk ki a biteket, pl.: A→00, C→01, T→10, G→11. Ennek hiánya a jelenlegi technológia egyik gyermekbetegségének, pontosabban annak megoldásának tudható be. A random DNS szintézis ugyanis nem teljesen random, G és T sokkal gyakrabban épül be a jelenlegi eljárások során. Ez azt is jelenti, hogy bizonyos véletlenszámok nagyobb valószínűséggel ütnék fel a fejüket. A probléma más számgenerátorok esetében is ismert, megoldására létezik is algoritmus, melyet von Neumann korrektor-nak hívnak (Neumann János után). Ez a korrekció azonban nem működne, ha kettesével generálnánk a biteket.

Ami ennél is fájdalmasabb, hogy a korrektor is további veszteségekkel dolgozik, az eredeti nemannyiravéletlen bittengerből így csak negyedannyi igazánvalódi random számot lehet kitermelni. Összességében tehát nyolcszoros veszteségről beszélhetünk. Mégis, az ilyen csiszolatlanságai ellenére is elfogadhatóan teljesít a DNS ha más generátorokkal vetjük össze (1. táblázat). Különösen igaz ez akkor, ha azt az ismertebb valódi véletlenszám technológiák teljesítményéhez mérjük.

RendszerTípusProdukciós ráta (MB/s)
Mersenne Twister algoritmuspszeudo15000
Kaotikus félvezető lézer (Reidler és mtsai., 2009)valódi1560
Intel® DRNGhibrid (valódi + pszeudo)800
DNS (Meiser és mtsai., 2020)valódi0,3
Atmoszférikus zörej (Random.org)valódi0,0015
Radioaktív bomlás (HotBits)valódi0,0001
1. táblázat: DNS és más véletlenszám-generátorok teljesítménye, Meiser és mtsai. (2020) nyomán, módosítva

A DNS-alapú rendszer komoly előnye a könnyű hordozhatósága: egy 1ml-nyi DNS körülbelül 1019 bit információt tud raktározni (ez merevlemeznek sem utolsó, de a mi esetünkben ez mind értékes random bit lehetne). Szekvenátorokból is vannak már egész kompakt típusok. A rendszer jelenlegi korlátját és fő költségét is ez utóbbi, a szekvenálás jelenti, ami viszont továbbra is egy fejlődő terület. Javulásra tehát még számíthatunk a későbbiekben, s így semmi jövőbeli akadálya nincs annak, hogy a holnap társasjátékait már sufnituning dNTP random számokkal játszhassuk.

(A borítókép a Wikipedia oldaláról származik)


Meiser, L.C., Koch, J., Antkowiak, P.L. et al. DNA synthesis for true random number generation. Nat Commun 11, 5869 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-19757-y

Reidler, I., Aviad, Y., Rosenbluh, M. & Kanter, I. Ultrahigh-speed random number generation based on a chaotic semiconductor laser. Phys. Rev. Lett.103, 1–4 (2009). https://doi.org/10.1103/PhysRevLett.103.024102

Zhirnov, V., Zadegan, R., Sandhu, G. et al. Nucleic acid memory. Nature Mater 15, 366–370 (2016). https://doi.org/10.1038/nmat4594

Az mRNS-alapú oltások jelene és jövője

A Budapest Science Meetup égisze alatt kisebb-nagyobb rendszerességgel rendelkező Karanténnaplókban egyébként is igyekszünk a lehető legnaprakészebb információkat összeszedni, de a friss Karanténnaplónk vendége, Pardi Norbert maga is részt vett Karikó Katalin oldalán az mRNS vakcinák kifejlesztésében, így talán a CriticalBiomass olvasóinak is érdekesebb lehet a beszélgetés (a beágyazott videó a teljes Karanténnapló kb. közepén indul, az interjú elején).

Mitől zsiráf a zsiráf?

Amikor öt évvel ezelőtt, az első zsiráf (és első okapi) genom(vázlat) publikálásának apropóján írtam posztot, az azzal a szomorú felütéssel ért véget, hogy hiányérzetem van, mert a két faj genomjának összehasonlítása megrekedt a fehérjekódoló szekvenciák összehasonlításának szintjén, pedig

eddigi ismereteink mind-mind azt sugallják, hogy a legizgalmasabb dolgok, nem a fehérjék szintjén történhettek, hanem a meglevő fehérjék felhasználásának terén: hogy hol és mennyi ideig fejeződik ki egy-egy gén, az legalább annyira fontossá válhat, mint egy-két aminosavnyi változás.

Mint azt a napokban a Science Advances lapban publikált sokkal jobb minőségű (vagyis teljesebb) genomot bemutató cikkből látni, ez nem nagyon változott öt év alatt, de legalább addig eljutottunk, hogy egy nagyon érdekes gén esetében valódi funkcionális vizsgálatok történtek, vagyis túlléphettünk a korrelációkba belelátott okozati kapcsolatokon.

De mielőtt még ezt gyorsan bemutatom, egy gyors ábrában, hogy ezek az új, gyakorlatilag kormoszómákba összerakott genomok milyen típusú elemzéseket tesznek lehetővé. A zsiráf esetében 15 pár kromoszómával találkozuk, a legtöbb szavasmarha esetében azonban 30 párral. Vagyis a zsiráfokhoz vezető (genom)evolúciós útvonal számos kromoszómafúziót tartalmazott, ezek azonban nem nagyon befolyásolták a gének sorrendjét a DNS-en, amit szakzsargonban szinténiának nevezünk. Az alábbi ábra is jól mutatja ezt, az esetleges inverziókkal, illetve kromoszóma-transzlokációkkal megspékelve.

A zsiráf és szarvasmarha genomok közti hasonlóság. A szarvasmarha egyes kromoszómáit (chr) különböző színek jelzik. A függőlegesen futó vonalak az egymásnak megfeleltethető DNS szakaszokat kötik össze. (Forrás: Science Advances)

A kutatók végül egy konkrét gént vizsgáltak meg jobban, ez egy FGF-jelátvitelhez kapcsolt fehérjét kódol (fibroblast growth factor (FGF) receptor–like protein 1 – FGFRL1). Azért pont erre esett a választásuk, mert egyrészt számos ponton ez a gén olyan mutációkat hordoz, amelyek csak a zsiráf genomban fordulnak elő és az érintett aminosavak minden más emlősben meglehetősen konzerváltak. A másik fontos ok, hogy az FGFRL1 funkcióvesztéssel járó mutációi emberben és egérben is érrendszeri, valamint vázrendszeri problémákhoz vezetnek (vagyis ezeknek a szöveteknek a fejlődésében lehet fontos ez a fehérje).

A zsiráfok esetében élettani érdekesség, hogy viszonylag magas vérnyomásuk van (ez azért szükséges, mert a vért valahogy el kell juttatni a hosszú erek végébe is), de ez mégsem károsítja a keringési rendszerüket (ellentétben mondjuk az emberi magas vérnyomással). Hogy megnézzék, lehet-e köze a zsiráf-specifikus mutációknak ehhez a vérnyomás-rezisztenciához, azokat bevitték egy egér FGFR1L génjébe, mintegy “zsirafizálva” azt. Az így létrehozott egerek elég hétköznapian néztek ki (vagyis a vázrendszer zsiráfokra jellemző megnyúlása nem, vagy nem csak ettől függ), de természetesen a külalak nem minden.

A normális (WT) és “zsirafizált” (giraffe) FGFRL1 génnel ellátott egerek kinézete, illetve szívük keresztmetsztei képe kontroll állapot (vehicle) és mesterségesen kiváltott magas vérnyomás (AngII) után. (Forrás: Science Advances)

Kontroll és “zsirafizált” egerekben az erek összehúzódását váltották ki egy angiotenzin II (Ang II) molekula felhasználásával (apró trivia: a SARS-CoV-2 vírus által receptorként használt ACE2 molekula valódi feladata ennek a molekulának a lebontása lenne), s ezzel kvázi magas vérnyomásos szindrómát hoztak létre. Az eredmények azt mutatják, hogy a mutáns FGRF1L gyakorlatilag megvédte az egerek szívét a magas vérnyomás okozta problémáktól.

Ez persze egy fontos, de azért apróbb lépés annak megértése felé, hogy mitől lesz a zsiráf olyan, amilyen. Egyelőre megerősödhet az a sejtés, hogy számos fontos jelleget szabályozórégiók változásai hozhatnak létre. Hogy ezek hol és hogyan hatnak, és milyen géneket érintenek, továbbra is fogas kérdés marad. De talán az olyan természetes mutánsok, mint amilyeneket nemrég írtak le Namíbiában és Ugandában, segíthetnek majd ennek a kérdésnek a megfejtésében is.

Az említett két fiatal hím zsiráf gyakorlatilag törpe, vagyis olyan vázrendszeri rendellenességet mutat, ami miatt a lábaik (és egyikük esetében valamennyire a nyak is) rövidebbek a fajtársaikban tapasztalhatónál. (A kicsit különböző törpeség, illetve a földrajzi távolság miatt elképzelhető, hogy két különböző mutációról van szó.)

Balra (a) egy normális hím zsiráf, jobbra (b és c) pedig a két “törpe” zsiráf. (Forrás: BMC Research Notes)

Nem tudjuk, hogy mi lehet az oka a furcsa rendellenességnek (sajnos arról nem szól a cikk, hogy bármilyen módon DNS-mintát vettek volna ezekből az egyedekből), de ha már előkerült az FGF-jelátvitel, akkor talán érdemes megemlíteni, hogy mindez analóg változásnak tűnik mindazzal, ami a tacskók esetében is bekövetkezett. És ott, mint azt pár éve tudjuk, egy FGF gén funkciónyerése (pontosabban kópiaszám növekedése) áll a fenotípus hátterében.

Ha tippelni lehetne, csak (rövid) idő kérdése lesz, hogy kicsit jobban megértsük, mi is okozza ezeknek a zsiráfoknak a törpeségét.

(A borítókép a Piqsels oldaláról származik.)


Liu C, Gao J, Cui X, Li Z, Chen L, et al. (2021) A towering genome: Experimentally validated adaptations to high blood pressure and extreme stature in the giraffe. Sci Adv 7(12): eabe9459. doi: 10.1126/sciadv.abe9459.

Brown, M.B., Wells, E. (2020) Skeletal dysplasia-like syndromes in wild giraffe. BMC Res Notes 13, 569 (2020). doi: 10.1186/s13104-020-05403-9

Hulló könnyek (organoid) zápora

Az organoidok, vagyis miniatűr, in vitro (lásd még “Petri csészében”) létrehozott szövetdarabok kutatása az utóbbi években mindenképpen a leggyorsabban fejlődő biológiai tudományterületet jelenti és manapság már tényleg (hogy elpuffantsuk az idekívánkozó nagy közhelyet) nem múlik el hét 1-2 fajsúlyosabb organoidos publikáció nélkül.

Madártávlatból nézve, két nagy csoport különíthető el organoidok esetében: azok, amelyek nagyon széles differenciációs potenciállal rendelkező “pluripotens” (akár klasszikus, embrionális, akár újgenerációs indukált) őssejtekből jönnek létre és azok, amelyek szűkebb potenciállal rendelkező, “multipotens” őssejtekből alakulnak ki. Utóbbiak döntően a felnőtt, kifejlett egyedek egyes szöveteiben jelen levő őssejtek felhasználásával létrehozott organoidok és ennek a területnek az egyik legfontosabb úttörője a pár éve Breakthrough Prize-al is kitüntetett Hans Celvers.

Clevers csoportja a holland Hubrecht Institute-ban még a 2010-es évek elején ért el komoly áttöréseket a bél-organoidok létrehozásával és kutatásával, azóta pedig, talán csak minimális túlzással, nincs olyan hámszövettel (epitéliummal) borított szerv, amelyből ne készítettek volna organoidokat. Az utóbbi években különböző mirigyekre kezdtek koncentrálni, ehhez kapcsolódott egy tavalyi publikációjuk, ahol például méreg-termelésre képes kígyó méregmirigy-organoidokat csináltak. Most pedig, a jól bejáratott metodológiájukkal a könnymirigyet vették górcső alá.

Az emberi könnytermelésben szerepet játszó mirigy és csatorna. (Forrás: Wikimedia Commons)

Az ilyen organoid-készítős tanulmányoknak a kezdeti lépései mindig nagyon hasonlóak: a vizsgált szervet szétszedik sejtekre, amelyeket utána egy in vitro közegben próbálnak meg tenyészteni. Ha a sejtek között vannak őssejtek is, akkor a megfelelő közeg kikísérletezése után előbb-utóbb megjelennek a labda alakú organoidok. Most is ez történt, előbb emberi, majd egér könnymirigyből kiindulva hozták létre ezeket az organoidokat (alább csak az egér esetet mutatom), amelyek kb. 10 nap alatt ∼200 μm átmérőjű gömbökké nőtték ki magukat és a szövettenyészetek fenntartására klasszikusan használt “passzálások” (újabb tenyészet indítása a sejtekből) után is megmaradt ez a jelleg (az ábra B paneljén a “pX” azt jelenti, hogy X db. passzálás után; a “0” azt jelenti, hogy a frissen létrehozott szövetet jellemzik.) Az organoidok több olyan fehérjét kifejeztek, ami a könnymirigyre is jellemző, sőt a belsejükben, hasonlóan a valódi könnymirigyek belsejéhez az antimikrobiális hatású Lactotransferrin (Ltf) is megjelenik.

Könnymirigy-organoidok létrehozása (A), fenntartása (B) és jellemzése (C). (Forrás: Cell Stem Cell)

Ha pedig van egy olyan organoid-rendszerünk, amely gyakorlatilag szinte korlátlan mennyiségben (viszonylag olcsón) tudja biztosítani egy valódi szerv miniatűr vázát, hirtelen a lehetőségek elég széles tárháza nyílik meg. Nagyon részletesen lehet vizsgálni a szerv kialakulásának folyamatát, az egyes gének szerepét (ezáltal genetikai-eredetű betegségek kialakulását), vagy azt is, hogy az organoidot visszaültetve, mennyire lesz működőképes (ez potenciális terápia lehet a jövőben pl. Sjögren-szindróma típusú autoimmun betegségekre). Én csak egy aspektust emelnék ki ebből a tanulmányból, mégpedig azt, hogy az organoidok miképp tehetik lehetővé a könnyezést befolyásoló szerek gyors keresését.

Könnymirigy-organoid “duzzadási vizsgálatok menete (A), konkrét anyagokkal való tesztelés (B), ennek a kvantifikációja (C) és a noradrenalin (NorEpi) feltételezett szerepe a könnyképzésben. (Forrás: Cell Stem Cell)

A munka ezen részéhez már emberi könnymirigyből származó organoidokat használtak és lényegében arról van szó, hogy különböző anyagokat tettek az organoidok közegéhez. Normális könnymirigynél a könny az elvezetődik, de az organoid egy zárt rendszer, így a megtermelődő, az organoid belsejébe ürülő könny lufiként “felfújja” az organoidokat. Ezt a méretváltozást pedig elég könnyen lehet automatizálva is detektálni, s ahogy az a fenti ábrán is látható, elég gyorsan lehet szűrni azokat az anyagokat, amelyek könnyezést tudnak indukálni.

Miért lehet ez hasonló, miért akarnák elérni, hogy valaki könnyezzen (és miért nem hámoztatunk vele hagymát)? A helyzet az, hogy bár egy könnymirigy anatómiailag elég egyszerű rendszer, még nem értjük teljesen, miképp működik. Ha pedig olyan anyagokkal, amelyeket korábban már pontosan jellemeztek (tudjuk pl. milyen molekulákhoz kapcsolódnak és befolyásolnak) sikerül befolyásolnunk, közelebb kerülhetünk ahhoz, hogy megértsük, a valóságban hogyan történhet a könnymirigy működésének szabályozása.

(A borítókép a Pixabay-ről származik.)


Korving J, Trani Bustos M, Gehart H, Begthel H, Bar-Ephraim YE, et al. (2021) Exploring the human lacrimal gland using organoids and single-cell sequencing. Cell Stem Cell doi: 10.1016/j.stem.2021.02.024.

Hát ez ragyogó!

Az élővilág megszámlálhatatlan csodái közül talán az egyik legmisztikusabb a biolumineszcencia és a fluoreszcencia. E két jelenség alapvetően eltérő okokra vezethető vissza, és hogy itt együtt említem őket, annak csupán az az oka, hogy mindkét esetben valamiféle fényjelenséggel van dolgunk. A fény forrása előbbi esetben mindig egy kémiai reakció, aminek végbemenetelét különböző enzimek – biológiai katalizátorok – segít(het)ik, míg utóbbi esetben kémiai változás nem történik, a fény eredeti forrása pedig kevésbé hangsúlyos. A fluoreszcencia lényege abban áll, hogy meghatározott hullámhossztartományba eső fotonok kölcsönhatásba lépnek egyes molekulák gerjeszthető elektronjaival (abszorpció). Az elektronok a kölcsönhatást követően magasabb energiaállapotba kerülnek, majd pár röpke nanoszekundum elteltével apró rezgések és mozgások révén veszíteni kezdenek energiájukból (belső konverzió), majd visszazuhannak a gerjesztés előtti alapállapotba, miközben egy foton lép ki a molekulából (emisszió). A kibocsájtott foton energiája, minthogy a gerjesztett állapotú elektron energiája egy részét mindenféle zizegésekre és mocorgásokra pazarolja, mindig kisebb, mint az elnyelt fotoné. A fluoreszkáló felületekről származó fény tehát mindig alacsonyabb energiájú és nagyobb hullámhosszú, mint a gerjesztéshez használt fény; más szavakkal élve: a szivárvány pirosabbik oldala felé tolódik el.

Az elektronok energiaszintjének változásait és a fluoreszencia alapjait sematikusan ábrázoló Jablonski-féle diagram (kép forrása: Wikipédia)

A biolumineszcenciára kiváló példát szolgáltatnak a szentjánosbogarak, számtalan mélytengeri ketyere, köztük egy Swima bombiviridis nevű gyűrűsféreg, akiről korábban itt írtunk, valamint korallok, medúzák, algák és baktériumok egész sora. Az is előfordul, hogy egy állat egyszerre villantja fel a biolumineszcencia és a fluoreszcencia területén szerzett jártasságát is, mint a zöld fluoreszcens fehérjéről (GFP) méltán világhírű Aequorea victoria nevű medúzafaj.

Fluoreszkáló állatoknak is komoly sokaságát lehetne felsorolni. Az ízeltlábúak testét borító kitines kutikula, vagy egyes kétéltűek (pl. a Hypsiboas punctatus nevű Dél-amerikai levelibéka faj) bőrében termelődő mirigyváladék egyaránt bírhat fluoreszcens sajátságokkal. A szárazföldi gerincesek körében nem gondolnánk, hogy a fluoreszcencia gyakori jelenség lenne, pedig elég egy pörgősebb party-ba ellátogatnunk, hogy erről első kézből szerezzünk tapasztalatokat: fogaink (és kevésbe feltűnő módon csontjaink is) kékesen világítanak az UV fényben (a csontszövet emissziós maximuma a 430 nm körüli hullámhossztartományban van, de remélhetőleg a party sose durvul el annyira, hogy ezt módunkba álljon saját magunkon megfigyelni).

A csontszövet immanens fluoreszcenciáját több, elsősorban éjszaka aktív állatfaj is felhasználja. Példa erre a Délkelet-Brazíliában honos nyergesbékafélék (Brachycephalus) nemzetsége, amelyek két fajánál is leírták, hogy a fej és a hát területén a bőrben, szinte közvetlenül a felhám alatt erőteljes csontosodási folyamatok mennek végbe. Minthogy ezek a bőr eredetű, ún. dermális csontok a testfelszínhez rendkívül közel helyezkednek el, az UV fény képes a testfalon át elérni azokat, s a kibocsájtott kék fény is gond nélkül lép ki a csontlemezeket fedő vékony szövetek borításán keresztül. Hasonló módon nyűgözik le egymást a Calumma és Bradypodion nemzetségbe tartozó kaméleonok is. Ezeknél a hüllőknél a koponya apró csontkinövései kerülnek a testfelszín közvetlen közelébe, a fajra jellemző mintázatban.

Néhány kaméleonfaj, fluoreszkáló csontkinövésekkel:
A) Calumma crypticum, hím; B) C. crypticum, nőstény; C) C. cucullatum, hím; D) C. cucullatum, nőstény és E) Brookesia superciliaris, hím példányok 365 nm-es UV-fénnyel megvilágítva, valamint F) Bradypodion transvaalense és (G) Furcifer pardalis, hím példányok (gyenge, látható fényben, 365 nm-es UV fénnyel megvilágítva) (Prötzel és mtsai, 2018)

Jelen poszt apropóját egy idén januárban megjelent cikk adja, ugyan azoknak a szerzőknek a tollából, akik a fenti képen látható kaméleonokat is zaklatták UV-lámpáikkal. A szerzők megfigyelték, hogy a Namib-sivatagban élő Pachydactylus rangei nevű kis gekkó testének két oldalán, illetve a szemei körül van egy halványsárga sáv, amely 450-480 nm-es (kék) fénnyel megvilágítva 510-540 nm-es tartományban, zölden fluoreszkál. Ez a felfedezés nem pusztán azért számít kuriózumnak, mert a hüllők körében eddig leírt kékes színű fluoreszcenciától eltérően itt a kibocsájtott fény zöld, hanem azért is, mert ennek a forrása (eddigi ismereteink alapján egyedülálló módon) nem a csontszövet!

Pachydactylus rangei látható és UV fényben, felül-, oldal- és alulnézetből. Az E) képen egy tojásból frissen kikelt egyed látható, akinek testfala még olyan vékonyka, hogy azon még átüt a csontok kékes fluoreszcenciája. Ez egyébként több gekkófaj újszülöttjeinél is megfigyelhető jelenség (Prötzel et al. 2021).

A gekkók bőrének szövettani elemzése során a fluoreszkáló területeken olyan sejtekre (ún. iridofórákra) lettek figyelmesek a kutatók, amelyekben guanin kristályok halmozódtak fel. Ilyen sejteket más hüllőknél, kétéltűeknél és halaknál is találhatunk a bőr irharétegében, ott azonban csak egy ezüstös csillogást adnak az állat bőrének, esetleg a fényt megtörve és visszaverve interferencia színeket hoznak létre. A Pachydactylus rangei esetében azonban nyilvánvaló, hogy a zöldes fluoreszcencia forrása ez a sejttípus. A gekkó iridofóráinak alaposabb vizsgálata révén felismerték, hogy ezek valójában két csoportra oszthatók: egy nem fluoreszkáló, a bőr mélyebb rétegeiben található, és egy fluoreszkáló, a felhámhoz közelebb elhelyezkedő típusra. Mi a különbség e két sejttípus között, ami miatt csak az egyik képes fluoreszkálni? Nos a választ még nem ismerjük, de a cikk szerzői úgy vélik, hogy a guanin kristályok szerkezete jelentheti a kulcsot. A guanin egyébként önmagában is egy fluoreszcens molekula, de normálisan csak 170 és 290 nm-es távoli UV-vel gerjeszthető, és 350 nm körül emittál szabad szemmel még láthatatlan UV sugarakat.  Elképzelhető, hogy a P. rangei zölden fluoreszkáló sejtjeinek guaninkristályaiban olyan molekuláris elrendeződés jön létre, ami kiterjedtebb π-elektron rendszer kialakulását, s ezáltal a spektrális sajátosságok megváltozását eredményezi? Talán igen. Az minden esetre biztos, hogy a bőr mélyebb rétegeiben lévő, nem fluoreszkáló iridofórák egyfajta tükörként funkcionálnak, ami a fluoreszkáló sejtek mellett elhaladó, azokkal kölcsönhatásba nem lépő fényt képes visszaverni, s ezáltal fokozni azok gerjesztő fénynek való kitettségét. Akárhogy is vesszük, ez egy ritka elegáns megoldás az anyatermészettől.

Na jó, de minek ez az egész?

A P. rangei egy éjszaka aktív sivatagi faj. Nem túl meglepő módon, a holdfényben jelen vannak olyan hullámhosszú fénykomponensek is, amelyek képesek előidézni a fent leírt zöldes fénytüneményt. Ez azonban (és itt vessünk egy pillantást a fenti képekre) nem az állat háti oldalán jelentkezik, a sötétben ólálkodó sakáloknak, vagy a magasból orvul lecsapó baglyoknak jelezve az uzsonna pontos térbeli helyzetét, hanem a test ventro-laterális részén. A mi kis gekkónk háti oldala terepmintás, felülnézetből az állat éjjel és nappal egyaránt alig észrevehető. A zöld fény a sivatag homokjából nézve, gekkó-szemszögből látható!
Hogy pontosan mit üzen ez a fényjelzés, azt az etológia és a viselkedés-ökológia szakértőinek kell majd kikutatniuk, de hogy kiknek szól, az egyértelmű: a sivatag sötétjében szaladgáló fajtársaknak.

_____________

David Prötzel et al. Neon-green fluorescence in the desert gecko Pachydactylus rangei caused by iridophores. Scientific Reports (2021).

Sandra Goutte et al. Intense bone fluorescence reveals hidden patterns in pumpkin toadlets. Scientific Reports (2019).

David Prötzel et al. Widespread bone-based fluorescence in chameleons. Scientific Reports (2018).

Carlos Taboada et al. Naturally occurring fluorescence in frogs. PNAS (2017).

Fejből tudja

A napokban nagyot futott a hazai sajtóban is az Elysia chlorotica nevű tengeri csiga fantasztikus regenerációs képessége, amelynek csak a feje képes létrehozni a testet. Ugyan sokat nem tudok a sztorihoz (egyelőre) hozzáfűzni, de mivel az Elysia régi kedvencünk, azért egy rövid posztot megér a dolog.

A lenyűgöző regenerációs képesség nem az egyetlen dolog, ami miatt az Elysia híres. Ott van rögtön a kleptoplasztia, vagyis az a képesség, hogy az elfogyasztott, fotoszintetizáló algák kloroplasztiszait (színtestjeit) a bélrendszerük sejtjeivel felvegyék és tovább működtessék. Ez részben a zöld színűket is magyarázza, meg persze azt is, hogy egy fantasztikus új energiaforráshoz jutnak (kvázi “napenergiával” is működnek.)

Ehhez kapcsolódik, a másik különcségük: az algában a plasztiszok működéséhez szükség van olyan génekre ia, amit nem a sejtszervecske saját DNS-ében van jelen, hanem az alga sejtmagjában. Ezek nélkül problémás lenen a hosszadalmas fenntartásuk, de az Elysia chlorotica erre is talált megoldást. A csiga ugyanis az egyike azoknak a kevés eukarióta fajoknak, ahol bizonyítottan lezajlott horizontális gén transzfer egy másik euakrióta organizmussal és az alga legalább egy, a plasztisz fenntartásához szükséges génje átkerült a genomba.

Ezek mellett a fiatal Elysia-k fantasztikus regenerációs képessége már csak hab a tortán. Azért hangsúlyozom ezt egyébként, mert az egy évnél idősebb állatok esetében mindez már nem megfigyelhető, ott a fej levállása után nem táplálkozik és tíz nap múlva elpusztul. Maga a test akár hónapokig is életben marad (fotoszintetizál, ugye), reagál is valamennyire ingerekre, de sosem növeszti vissza a fejet.

A furcsa szokás (szakzsargonban autotómia) minden bizonnyal azért jött létre, hogy a csiga meg tudjon parazitáitól szabadulni (ezek többnyire evezőlábú rákok, a cikk szerint), hiszen azok így a régi testben maradnak és a fejből regenerálódó állat tiszta lappal indul.

Az Elysia 22 nap alatt felismerhető mértékben képes regenerálni a testét. (Mitoh és Yusa, 2021 Curr Bio)

A puhatestűek esetében egyébként nem szokatlan regeneráció jelensége: a fejlábúak esetében komoly, évszázados tudományos irodalma van a különböző csápok regenerációjának. Magyarán az alap “regenerációs eszköztár”, amire az Elysia is támaszkodhatott.

Épp ezért szokatlan, hogy a cikk megáll a jelenség puszta leírásánál. Furcsa helyzet ez, mert én magam sem szeretem azt az iskolát, ahol minden létező jelenség leírásához “fiziológiai relevanciát”, meg molekuláris adatokat követelnek a bírálók: néha egy-egy megfigyelés, részletesen leírva, önmagában is nagyon fontos. Viszont itt tényleg csak a felszínt kapirgálták meg és azért a Current Biology esetében, így 2021 magasságában, ennél több szokott kelleni a publikációhoz.

Hiszen még csak azt sem lehet mondani, hogy nem ismerjük a faj genomját és ezért nehéz mondani bármit is arról, hogy milyen gének aktiválódnak a regeneráció. Két évvel ezelőtt kijött az Elysia chlorotica genom is, így egy egyszerű transzkriptóma-elemzés most azért belefért volna. Nincs kétségem, hogy hamarosan megcsinálja azt is valaki (ha tippelhetnék, már folyamatban is van), de most még várnunk kell rá.


Mitoh S., Yusa Y. (2021) Extreme autotomy and whole-body regeneration in photosynthetic sea slugs. Curr Biol 31(5): R233-R234. doi: 10.1016/j.cub.2021.01.014.

Cai, H., Li, Q., Fang, X. et al.  (2019) A draft genome assembly of the solar-powered sea slug Elysia chloroticaSci Data 6, 190022. https://doi.org/10.1038/sdata.2019.22

Hogyan duplázhatnánk meg a magyar GDP -t?

Tegyük fel a szándékosan provokatív kérdést, hogyan lehetne megduplázni az ország bruttó nemzeti össztermékét (GDP)? Ez jelenleg 163,5 milliárd USD, ha úgy tetszik az egy főre jutó GDP 16470 USD, ezzel a világon az ötvenegyedikek vagyunk. Ha megkétszereznénk a bruttó nemzeti összterméket, akkor körülbelül Olaszország szintjére jutnánk. De hogyan lehetne ezt megtenni? Nyilván ha olajat, uránt, lítiumot vagy aranyat találnának nagy mennyiségben mondjuk az Alföldön, az segítene, de erre nem sok esélyt látok. Így mindenképpen valamilyen ipari teljesítménnyel kellene ezt megtenni. Erre tennék egy meglepő javaslatot: Gyárthatnánk fehérjéket.

Egy kattintás ide a folytatáshoz….

Miért egyenlőtlen a Lyme-kór fertőzések eloszlása?

Az Amerikai Egyesült Államok leggyakoribb ízeltlábú köztigazda által terjesztett betegsége a Lyme-kór, évente háromszázezer embert fertőz meg. A betegséget kullancsok terjesztik, Amerikában főleg a feketelábú kullancs (Ixodes scapularis). Azonban az emberi megbetegedések rejtélyes eloszlást mutatnak, mivel eddig sehogyan sem sikerült őket fedésbe hozni a kullancsok eloszlásával. Bár a köztigazdaként működő kullancsfaj az USA északkeleti és északi részétől egészen a Mexikói-öbölig elterjedt, Texasban és Floridában is, ám a Lyme-kór emberi áldozatai az északi területeken sűrűsödnek, a déli államokban a betegség kifejezetten ritka. Sokáig nem találtak meggyőző választ a kérdésre, hogy miért különbözik a Lyme-kór eloszlása északon és délen, ha a feketelábú kullancs egyformán elterjedt mindkét területen?

Egy kattintás ide a folytatáshoz….