Érzi a ritmust, átveszi az ütemet

Snowball, a táncoló kakdu számos YouTube klippjének valamelyikével, ha jól sejtem, már mindenki találkozott, és ha csak egy pillanatig is, talán elmélázott rajta, hogy akkor most ez a madár csak bohóckodik, és véletlenszerűen headbangel, vagy valóban a zene ütemére bólogat.

A kérdés esetleges tudományos megvizsgálása tipikusan olyasminek tűnhet, amivel az unatkozó kutatók Ig Nobel díjra pályáznak és amit a Annals of Improbable Research-ben publikálnak, már ha egyáltalán.

Pedig a kérdés valójában nem ennyire (csak) megmosolyogni való, ugyanis a ritmusérzék egyike azon tulajdonságnak, amiket nagyon is emberinek tartunk. Hozzánk egész közel álló főemlősök sem rendelkeznek ilyesmivel, így mégiscsak magyarázatra szorulna, hogy akkor egy papagáj miért.

Nos, a válasz: igen, Snowball valóban a hallgatott zene ütemét követi. Kedvenc számait kicsit megbuherálva (a BPM-et állítgatták), ez világosan látható volt. Kicsit jobban megkaparva a felszínt az is kiderült, hogy ilyen képességeivel Snowball nem is unikum: Alex a beszélő papagáj is képes volt hasonlóra, de számos más papagájfaj egyedei is, nameg, non-humán-emlősként, egy elefánt is belefér az egyelőre elég rövidke listába. (A vizsgálat jelentős részét a YouTube-ra feltöltött állat-videók adták; asszem ez az első alkalom, amikor egy videó megosztó komoly kutatási célt szolgált ;-).)

Mi a közös ezekben a fajokban, na meg bennünk emberekben? Első blikkre nem sok, de egy fontos dolog mégis az: mindannyian jó hangutánzók vagyunk. (Igen, az elefántok is.) És mivel ezekben a fajokban, a hangutánzás egymástól függetlenül, konvergens evolúcióval alakult ki, a vizsgálat azt az elméletet támasztja alá, hogy a ritmusérzék egy (feltehetően szükséges) velejárója a magas szintű hangutánzásnak és nem valamilyen külön úton alakult ki.     


Patel AD, Iversen JR, Bregman MR, Schulz I. (2009) Experimental Evidence for Synchronization to a Musical Beat in a Nonhuman Animal. Curr Biol doi:10.1016/j.cub.2009.03.038
Schachner A, Brady TF, Pepperberg IM, Hauser MD (2009) Spontaneous Motor Entrainment to Music in Multiple Vocal Mimicking Species. Curr Biol doi:10.1016/j.cub.2009.03.061

A fizikus szemszöge

(Pár hete az ELTE lágymányosi campusán Jeszenszky Ferenc, az ÉRTEM tiszeteltbeli elnöke tartott előadást, "Az evolúció egy fizikus szemszögéből" címmel. Ezt kérdezz-felelek szeánsz követett, amin törtlenetesen néhány olvasónk is jelen volt. Következzen a beígért beszámoló shadow82-től.) 

Az
alábbiakban a találkozón elhangzott érveket
és ellenérveket próbáltam visszaadni. Az
előadás utáni vita részről
hangfelvétel készült, amit kicsit szerkesztve, de
az értelmét nem változtatva adok közre. A
felvétel leiratozása óriási meló,
még mindig hátra van kb negyed óra belőle.
Mivel nem tudom, hogy mikor lesz időm befejezni, ezért
most közre adom azt, ami már készen van. Elnézést
a hosszas késlekedésért.

Egy kattintás ide a folytatáshoz….

Hadroszaurusz kollagén

Amikor két éve kijött a Science-ben a Mary Schweitzer nevével fémjelzett, T. rex kollagén (rész)szekvenciáját leíró cikk, csak kevesen sejthették, hogy milyen vihart kavar majd. Pedig csak talán a “hobbit háború” intenzitásához hasonlítható az a vádaskodás, cáfolat, ill. ellen-cáfolat sorozat, ami kezdetét vette.

Sokan annyira valószerűtlennek tartották, hogy egy 68 millió éves csontból érdemi fehérje mintát lehetne izolálni, hogy készpénznek vették, hogy szennyeződésről van szó, és spontán véletlen a szekvencia egyezés. Mások azon keltek ki, hogy nem lett a teljes tömegspektrometriai adatsor nyílvánossá téve, és kevéssé elegánsan azt sejtették, hogy Schweitzerék azért nem tették meg ezt, mert takargatnivalójuk van. Végül publikus lett az adatsor, és bár nem sikerült minden kritikus kielégíteni, az eredeti tanulmányon nem sikerült tartós fogást lelni.

Egy kattintás ide a folytatáshoz….

Puijila darwini

"Egy szigorúan szárazföldi állat, amely kezdetben táplálékáért vadászva csak alkalomadtán merészkedett sekély vízbe, majd patakokba és tavakba, végül egy teljesen vízi élőlénnyé alakult, amely nem riadt vissza a nyílt óceántól sem."

Ezekkel a szavakkal írta le Darwin a fókák (az ő korában még csak feltételezett) kialakulását, és az idő fényesen visszaigazolta. Legutóbb a kanadai Nunavut inuitok lakta szigetvilágából került elő egy kb. 22 millió éve élt, 110 cm hosszú ragadozó maradványa, amely minden jel szerint az úszólábúak egyik legősibb (ismert) képviselője lehet.

A keresztségben Puijila darwini nevet kapó lény ("puijila" inuitul "fiatal tengeri emlőst" jelent) leginkább egy vidrára emlékeztetett és valószínűleg, ahogy azt Darwin megjósolta, azokhoz igen hasonló életmódot folytatott, a helyi patakokban és tavakban keresve "kenyerét". Ugyanakkor a koponya, és különösen a fogazat, jellegzetességei eygértelművé teszik, hogy nem egy különös ősi vidrával állunk szemben, hanem nagyon is egy "fókával".

Egy kattintás ide a folytatáshoz….

Bad Science

A “Bad Science” nagy valószínűséggel az elmúlt évek egyik legjobb könyve mindazok számára, akiknek elege van abból, hogy lassan már a csapból is az “ezós gondolkodásmód” folyik, és látszólag komoly emberek is marokszámra tömik magukba és családjukba a multivitamin tablettákat, ill. halolajkapszulákat. A könyv szerzője, Ben Goldacre, foglalkozására nézve orvos, szombatonként pedig a The Guardian kolumnistája. Azonos című, szombatonként jelentkező rovata menetrendszerű pontosággal szedi le a keresztvizet a védőoltásokkal ijesztgető kóklerekről, a sületlen “milyenazideálisfagyi” típusú egyenleteket tudományrovatban leközlő újságokról, a homeopatákról, táplálkozási gurukról – mindazokról, akiknek tevékenysége tudományosnak nem nevezhető, mégis előszeretettel bújnak a tudományosság álcája mögé.

A könyv eredeti kiadása is ezeket a problémákat vette végig, igencsak olvasmányos stílusban. Egy kivétellel: Goldacre blogjában gyakran ír az ún. AIDS-tagadókról, azokról akik szerint nem a HIV vírus okozza a megbetegedést, és az antiretrovirális szerek valójában csak a gonosz gyógyszeripar pénzszerző machinációinak tekinthetők, hatásuk pedig amúgy sincs, csak mellékhatásuk. Az első kiadásból hiányzik az erre vonatkozó fejezet, mint a napokban kiderült azon okból, hogy tavaly még perben állt az AIDS-tagadók egyik emblematikus alakjával, Matthias Rath-al. Mára azonban a per véget ért, pont időben, hogy az extra fejezet bekerülhessen a második kiadásba; aki pedig az elsőt már megvette, az letöltheti a plusz oldalakat. (Akinek pedig még nem volt szerencséje a könyvhöz, ízelítőt kaphat belőle.) 

Rath munkásságában nemcsak az a szürreálisan borzasztó, hogy emberek millióinak az életét teszi tönkre (Nádori Gergő részletesen is ír a fejezetről), hanem az is, hogy sok más szélhámostól eltérően neki valóban van tudományos végzettsége, így tisztában kell legyen azzal, hogy mit csinál. Szomorú módon az AIDS-bagatelizáló klubba még más fajsúlyos kutatók is bekerültek, pl. Peter Duesberg, akinek az egyik legjobb “tanítványa”, Christine Maggiore pár hete halt meg AIDS-ben. Három évvel élte túl hároméves kislányát, akit szintén ez a kór vitt el…

Biokémiai hasonlóságok

(Vendégmunkásunk, SexComb tollából.) Újabb ÉRTEM cikk kerül a
boncasztalra, ezúttal a molekuláris genetika tárgyköréből, Biokémiai
hasonlóságok címmel. Az eredeti itt található.

"A biokémiai taxonómia
egyik legfontosabb eljárása a fehérjén belüli aminosav-sorrend (szekvencia) meghatározása,
illetve a DNS-ben lévő bázishármasok (tripletek) sorrendjének megállapítása.

A kutatók DNS- és fehérje-szekvencia analizátorokat alkalmaznak
e sorrendek a meghatározásához."

A molekuláris biológia fejlődésével
lehetővé vált gyorsan, olcsón meghatározni rövidebb DNS szakaszok
bázissorrendjét, ugyanis a DNS szekvenálás gépesíthető, egyetlen
közepesen képzett munkatárs képes kiszolgálni egy szekvenáló-gépet,
így egyetlen reakció költsége öt-tíz euró körül mozog, amely
körülbelül ezer-ezerötszáz bázis leolvasását teszi lehetővé.
A fehérjék aminosavsorrendjének meghatározására is van lehetőség,
ám ezek az eljárások lassúak így meglehetősen költségigényesek,
ilyen célokra szinte sohasem használják őket. Az adatbázisokban
szereplő fehérjeszekvenciák túlnyomó többsége egyszerűen a DNS
bázissorrendje alapján "lefordított" fehérje. A DNS esetében
bázishármasokról csak a fehérjéket kódoló szakaszok esetében
beszélhetünk, mivel valóban három bázis határoz megy egy aminosavat,
ám a fehérjéket nem kódoló szakaszok esetében ez a szóhasználat
értelmezhetetlen, így innentől csak DNS bázissorrendről beszélnék,
a cikk szerzője is nyilván erre gondolt. A DNS bázissorrend vizsgálatának
óriási előnye, hogy matematikai módszerekkel is elemezhető, így
nem jelenik meg az a pontatlanság, amelyet az egyes külsődleges jellegek
értékelése szükségképpen tartalmaz, hiszen nem önkényesen kijelölt
jellegeket vizsgálunk. A cikk szerzőjének választása éppen a citokróm
c fehérjére esett, maradjunk hát ennél a példánál. A citokróm
c a mitokondriumban található, a sejt energiatermelési folyamatai
során egy elektront szállít. Éppen mivel ilyen alapvető folyamatban
vesz részt, kevéssé változékony fehérje, homológja könnyen azonosítható
az éppen vizsgált szervezetben, ráadásul a hossza kevéssé változékony,
így az egyes fehérjék könnyen összehasonlíthatóak, éppen ezért
alkalmas evolúciós vizsgálatokra.

Egy kattintás ide a folytatáshoz….

Bolygó idegek és az evolúció

A “bolygóideg” (nervus vagus) neve nem teljesen véletlen, hiszen az agytörzsből kiindulva testünk egészen távoli pontjait is eléri. Egy leágazása azonban egészen különleges és bizarr utat jár be: ez az ún. alsó gége ideg (angolul – a képaláírások végett – recurrent laryngeal nerve).

A jobboldalon ez a kulcscsont alatti verőeret, a baloldalon pedig az aorta-ívet megkerülve visszafut a nyakba, hogy végül a gége beidegzését elvégezze. A fölöslegesen befutott út látszólag teljesen értelmezhetetlen, hiszen a felső gége ideg (superior laryngeal nerve), minden különösebb lacafacázás nélkül, egyenesen fut ugyanahoz a szervhez. Nincs értelmes tervező, akinek ilyesmit képes lenne papírra vetni és ennek megfelelően kreacionista körökben inkább kerülik ezt a témát.

Pedig az alsó gége ideg nagyon is logikus utat jár be – ha figyelembe vesszük a fejlődéstani és evolúciós kötöttségeket. A sérv kapcsán már hangsúlyoztam, hogy az evolúció hozott anyagból dolgozik, és nem tervez előre. Vagyis ami ott és akkor hasznos az megmarad, hiába lesz évmilliókkal később félresikerült tuning-barkács hangulata egy-egy kései leszármazottnak.

Egy kattintás ide a folytatáshoz….

Evolution Megalab

A biológia eszméletlenül nagy ugrása az utóbbi száz évben azzal is járt, hogy teljes mértékben kilépett a passzióból is űzhető, hobbi szakmák sorából. Nem csak, pontosabban főleg nem azért mert az alaptudás elsajátítása intézményes keretekért kiált (egyébként nem feltétlenül), hanem mert a komolyabb kutatás olyan háttérfelszerelést igényel, amit önerőből finanszírozni közel lehetetlen.

Ráadásul még gyakran az egyszerű kísérletek is olyan nagy mintaszámokat igényelnek, hogy egy laikus egyszerűen nem rendelkezik annyi idővel (persze mostanság akár ez is változhat…). Így aztán azoknak, akik szeretnék úgy érezni, hogy kívülállóként hozzátesznek valamit a megismerés folyamatához olyan programok maradtak, mint a SETI@Home vagy a FoldIt. Ezek persze a maguk nemében hasznosak és érdekesek, de az igazi tudományos megismerés fílingjét aligha adják vissza.

Viszont szerencsére itt van a brit OpenUniversity Evolution Megalab nevű kezdeményezése, ami remélhetőleg elég sikeres lesz ahhoz, hogy egy sorozat nőjön ki belőle. Az ötlet zseniális: adva van egy egyszerű paradigma, a kerti csiga sávjainak a száma, ill házának a színe, amely összefügg élőhelyével. Északon a ház sötétebb, mint délen  (mert így könnyebben felmelegszik), és füves területen több csík van rajta, mert így jobban beleolvad a környezetbe. Pontosabban ezt figyelték meg egykoron. Namost, a kérdés az, hogy a klímaváltozás, illetve a csigával táplálkozó énekesmadarak megritkulása miatt, megváltozik-e ez a mintázat. (Ha igaz az eredeti elmélet, akkor igen, hiszen megváltoztatjuk a szelekciós nyomásokat.)

A válasz keresésébe egy egyszerű regisztráció után bárki becsatlakozhat (így remek taneszközzé is válhat a dolog). A szükséges adatok bepötyögésével pedig részeseivé válhatunk a pán-európai projectnek. Mivel a Magyarországra vonatkozó adatok finoman szólva is szegényesek (nameg az oldal fordítása is hagy némi kívánnivalót maga után), valószínűleg bőven elkel a magyar részvétel is. Így akinek van kedve, és amúgy is rendszeresen jár kirándulni (ha pedig nem, akkor itt a remek ürügy ;-)), az most könnyen összekötheti a kellemeset a hasznossal.    

Soká éljen a királynő (génkészlete)

Egy termesz kolónia "standard" növekedéstörténete valahogy így festene: a szabadban, a nászrepülés során egymásra találó királynő és király meghitt otthont keres, ahol nekilátnak a szaporodás ősi és fölöttébb hasznos elfoglaltságának. Első körben dolgozókat és katonákat nemzenek, amelyek felépítik, ill. rendben tartják a kolóniát. Ha a kolónia elér egy kritikus méretet, akkor potenciális királynőket és királyokat tartalmazó tojások kerülnek lerakásra – az ezekből kikelő termeszeknek, korábbi testvéreikkel ellentétben szárnya van, s ennek megfelelően ki is repülnek, hogy párt keressenek s új kolóniát alapítsanak.

Élete vége felé azonban a királynő különleges tojásokat rak, amelyekből ún. "másodlagos" királynők kelnek ki, akik az (anya)királynő halála után a királlyal pározva biztosítják a kolónia fennmaradását.

Ennek a furcsa szokásnak van egy (genetikailag) kellemetlen hozadéka a kolónia számára: mivel a másodlagos királnyők a király lányai is, értelemszerűen génkészletének felét is hordozzák. Vagyis lényegesen lecsökken a leendő utódok genetikai diverzitása, ami hosszú távon nem feltétlenül előnyös.

A közelmúltban azonban egy Japánban őshonos termeszfajról, a Reticuloteremes seoaratas-ról kiderült, hogy sajátos megoldást lelt a genetikai uniformizálódás elkerülésére. Kenji Matsuura csoportja arra jött rá, hogy ezekben a termeszekben a királynő kvázi klónozza magát az élete végén, mert a másodlagos királynőket aszexuális szaporodással hozza létre (vagyis "apai" hozzásegítés nélkül). Így aztán az incesztus genetikai tehertétele is megszűnik, mert a király nem a saját utódaival kell párosodjon, hanem egykori nejének (fiatal) másolataival.    



Matsuura K, Vargo EL, Kawatsu K, Labadie PE, Nakano H, et al. (2009) Queen Succession Through Asexual Reproduction in Termites. Science 323: 1687.

Re: Génpiszka-piszka – Szabó Rebeka (LMP)

(Ezúttal Szabó Rebeka, az LMP választmányi tagja válaszol korábban feltett (kör)kérdéseinkre.)

1.) Miután 2005-ben az FVM moratóriumot
hirdetett a MON810 GM kukoricamoly-rezisztens fajtacsoport szabadföldi
termesztésére, egy évvel később pedig az Országgyűlés ötpárti
egyetértésben elfogadott határozattal utasította a kormányt a GM
növények szigorú szabályozására és a moratórium fenntartására,
Magyarország benyújtotta a határozatot alátámasztó új kutatási
eredményeket az Európai Élelmiszerbiztonsági Hivatalhoz (EFSA),
hogy az szakmai értékelést és javaslatot készítsen az Európai
Bizottság számára a moratórium fenntartásáról vagy feloldásáról.
Az EFSA GMO Panele megalapozatlannak találta a magyar eredményeket,
így az Európai Bizottság a magyar moratórium feloldását javasolta.
Hazánk diplomáciai erőfeszítéseinek következtében azonban 2007
februárjában az EU Minisztereinek Tanácsa nagy többséggel a magyar
moratórium fenntartása mellett (tehát a Bizottság ellenében) döntött.
Ezt követően 2008. június 11-én szóbeli egyeztetésre, azaz a szóban
forgó tudományos eredmények bemutatására került sor a magyar kutatók
és az EFSA GMO panel tagjai között. Ezután adta ki az EFSA a kérdésben
is említett új, a magyar álláspontot megalapozatlannak tekintő
állásfoglalását, amire a magyarok részletes, tudományos eredményeken
alapuló viszontválaszt küldtek (ez ebben a dokumentumban olvasható). Idén az EU újfent
napirendre tűzte a moratórium feloldását, amit februárban a Minisztereinek
Tanácsa megint elutasított, tehát egyelőre marad a magyar MON810
tilalom.

Azt hiszem, hogy egyik párttól,
így az LMP-től sem várható el, hogy beszálljon az EFSA és a magyar
kutatók között zajló tudományos vitába, és konkrétan megerősítse,
vagy cáfolja a részletes szakmai érveket. Addig azonban, amíg a
tudományos vita nem dől el, és nem születnek a MON810 GM kukoricafajta
hosszú távú egészségi és környezeti hatásait megnyugtató módon
tisztázó kutatási eredmények, egy pártnak álláspontja kialakításakor
az elővigyázatosság elvét kell szem előtt tartani, tehát nem támogathatja
egy bizonytalan hatású új produktum széleskörű használatát (termesztését).
Számos közismert negatív tapasztalat (pl. DDT, freonok) kellőképpen
alátámasztja az elővigyázatosság elvének létjogosultságát (és
nem mellesleg összhangban van a GM élőlényekre vonatkozó 2001/18/EC
EU irányelvvel is). És anélkül, hogy a fent említett tudományos
vita részleteibe belemennék, megemlítek egy körülményt, ami mindenképp
a moratórium fenntartását támasztja alá: Magyarországon a kukoricamoly
ellen a gazdák nem védekeznek, mert a kártétele nem jelentős, tehát
eleve nem indokolt a MON 810-es fajta bevezetése.

Az LMP nem állítja, hogy
az EFSA elfogult lenne, és természetesen nincsenek erre vonatkozó
bizonyítékaink sem. Mindazonáltal megjegyezném, hogy a magyar fél
legutóbbi hivatalos válaszlevelében leírta, hogy az EFSA Panel 2008.
június 11-i egyeztetésen tanúsított hozzállása alapján megerősítettnek
érzi azt a más tagállamok képviselőitől előzetesen hallott informális
véleményt, hogy ez a találkozó csak egy formalitás lesz, amellyel
az EFSA csak a procedurális követelményeknek tesz eleget, és nem
is próbál meg érdemi párbeszédet kialakítani. A magyar fél sérelmezte,
hogy a kétórás ülésen nem alakult ki érdemi vita, a magyar eredmények
bemutatását követően az EFSA GMO Panel jelenlévő tagjai nem tettek
fel kérdéseket és nem fejezték ki kétségeiket, ezért kifejezetten
váratlan volt az újabb, teljesen elutasító álláspont. Továbbá
az is elgondolkodtató, hogy a többi, ugyancsak MON 810 kukoricára
vonatkozó moratóriumot fenntartó tagállam (Görögország, Franciaország,
Ausztria) tilalmáról szintén teljesen elmarasztaló állásfoglalást
adott ki az EFSA, holott az adott országok a magyarokétól eltérő,
saját kutatási eredméyeiket terjesztették be bizonyíték gyanánt
(ld például).

2.) Az első kérdésre adott válaszom alapján sejthető, hogy a genetikailag
módosított növények széleskörű termesztésbe vonásával kapcsolatban
számos kétely merülhet fel (amelyekre számos ökológiai vonatkozású
példát tudnék még hozni), és hogy a döntéshozásra hivatott intézmények
eljárása több ponton kifogásolható. Ezért az LMP általában a
GMO-engedélyezés átgondolása mellett érvel, már csak azért is,
mert az a tény, hogy az egyelőre tisztázatlan egészségügyi és
környezeti hatású MON810 kukoricafajtákat nálunk még nem termesztik,
csak komoly diplomáciai erőfeszítéseknek és az EU-s eljárásrend
határait súroló megoldásoknak köszönhető, amelyeket ráadásul
újra és újra le kell folytatni, mert évről évre megpróbálják
megsemmisíteni a hazai moratóriumot. A génmódosított növények
termesztését tehát nem ideológiai alapon utasítjuk el, hanem azok
hatásait pro vagy kontra egyértelműen bizonyító eredmények híján.
A génmódosítással, mint technológiával szemben nincsenek ab ovo
kifogásaink (feltéve, ha konkrét etikai, társadalmi, gazdasági
és környezeti kockázatok megfelelő intézményi háttérbe és szabályozásba
illeszkedő vizsgálatokkal kizárhatók), hiszen tudatában vagyunk
annak is, hogy egyéb GMO technológiával előállított szervezetek
jelenleg is alkalmazásban vannak (pl. gyógyászati célú GM baktériumok).
Mindemellett egy ökopolitikai pártnak azért azt a világnézeti kérdést
is fel kell vetnie, hogy vajon jó úton járunk-e, ha a produktivista
gazdasági/társadalmi berendezkedésünkből eredő egyre súlyosbodó
problémákat pusztán újabb és újabb erőforrás-igényes technológiai
fejlesztésekkel próbáljuk megoldani.

3.) Általánosságban, ha független
vizsgálatok bizonyítanák egy adott GM szervezet ártalmatlanságát,
és ki tudnánk védeni a GM eredetű élelmiszer termelés negatív
környezeti, társadalmi és gazdasági hatásait is (ugyanis az etikai
szempontokat is felvet, hogy „lenyomhatunk-e” egy adott, akár ártalmatlan
terméket a fogyasztók torkán, ha azzal ők alapvetően nem szimpatizálnak),
illetve találnánk arra megoldást, hogy a GM növény szabadföldi
termesztése ne jelentse a környék valamennyi hasonló terményének
GMO szennyezését, akkor nem zárkóznánk el az adott GM szervezet
használatától. Lényegesnek tartjuk azonban az elővigyázatosság
elvének alkalmazását, mielőtt új élőlényeket és új termesztési
technológiákat engedünk be amúgy is számos pontos sérült agrár-ökológiai
rendszereinkbe, továbbá hogy a döntések független szakértők által
elvégzett korrekt vizsgálatokon alapuljanak. Naivitás volna nem számolni
azzal, hogy a GM növények előállítása és termesztésbe vonása
hatalmas üzlet, és az ilyen esetekben a hosszabb távú társadalmi
és környezeti kockázatok mérlegelése gyakran alulmarad a rövitávú
profittal szemben.


Előzmények:

Re: Génpiszka-piszka – Hegyi Gyula (MSZP)

Génpiszka-piszka