{"id":8554528,"date":"2016-04-03T21:31:25","date_gmt":"2016-04-03T19:31:25","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2016\/04\/03\/denever_es_eger_651"},"modified":"2021-03-13T15:55:25","modified_gmt":"2021-03-13T15:55:25","slug":"denever_es_eger_651","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=8554528","title":{"rendered":"Denev\u00e9r \u00e9s eg\u00e9r &#8211; 2."},"content":{"rendered":"<p><img decoding=\"async\" class=\"imgleft alignleft\" src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2016\/04\/journal_pgen_1005738_g003.PNG\" alt=\"journal_pgen_1005738_g003.PNG\" \/>Az evol\u00faci\u00f3 \u00e1ltal kataliz\u00e1lt morfol\u00f3giai v\u00e1ltoz\u00e1soknak mindig fejl\u0151d\u00e9stani okai vannak, ugyanis a meglev\u0151 fejl\u0151d\u00e9si program megv\u00e1ltoztat\u00e1sa\/\u00e1t\u00edr\u00e1sa lesz az els\u0151dleges oka a kifejlett \u00e1llatban megjelen\u0151 jelleg megjelen\u00e9s\u00e9nek.<\/p>\n<p>A denev\u00e9rek sz\u00e1rny\u00e1nak kialakul\u00e1s\u00e1val m\u00e1r t\u00f6bbsz\u00f6r is foglalkoztunk itt a blogban, de m\u00edg az eddigi tanulm\u00e1nyok legink\u00e1bb kor\u00e1bbi fejl\u0151d\u00e9stani ismereteink alapj\u00e1n kerest\u00e9k azokat a g\u00e9neket, amelyeknek fontos szerepe lehet a sz\u00e1rny l\u00e9trej\u00f6tt\u00e9ben, addig a napokban megjelent tanulm\u00e1ny-p\u00e1ros, az \u00fajgener\u00e1ci\u00f3s szekven\u00e1l\u00e1si technik\u00e1knak k\u00f6sz\u00f6nhet\u0151en egy kicsit &#8222;elfogulatlanabb&#8221;, el\u0151felt\u00e9telez\u00e9seket n\u00e9lk\u00fcl\u00f6z\u0151 megk\u00f6zel\u00edt\u00e9st alkalmazott.<\/p>\n<p>Kor\u00e1bban m\u00e1r f\u00e9ny der\u00fclt arra, hogy az \u00fagynevezett <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005484\">BMP-jel\u00e1tviteli \u00fatvonal k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 tagjai<\/a> mik\u00e9nt j\u00e1rulnak hozz\u00e1 a k\u00e9z csontjainak megny\u00fal\u00e1s\u00e1hoz, illetve hogyan biztos\u00edtj\u00e1k az ujjpercek k\u00f6zti b\u0151rred fennmarad\u00e1s\u00e1t.<\/p>\n<p>Most, a\u00a0<a href=\"http:\/\/www.nature.com\/ng\/journal\/vaop\/ncurrent\/full\/ng.3537.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em>Nature Genetics<\/em>-ben megjelent cikk <\/a>egyr\u00e9szt a denev\u00e9r genom fehaszn\u00e1l\u00e1s\u00e1val \u00f6sszeveti a mells\u0151 \u00e9s h\u00e1ts\u00f3 v\u00e9gtag fejl\u0151d\u00e9se sor\u00e1n felfedezhet\u0151 g\u00e9nexpresszi\u00f3s, ill. epigenetikai k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9geket, m\u00e1sr\u00e9szt beazanos\u00edt olyan genomi r\u00e9gi\u00f3kat, amelyek a denev\u00e9rek evol\u00faci\u00f3ja sor\u00e1n k\u00fcl\u00f6n\u00f6sen gyorsan v\u00e1ltoztak &#8211; s \u00edgy feltehet\u0151, hogy k\u00f6z\u00fck lehet a csoport jellegzetes morfol\u00f3giai \u00faj\u00edt\u00e1s\u00e1nak, a sz\u00e1rnynak a kialak\u00edt\u00e1s\u00e1ban. Ezek az \u00fan. Bat Accelerated Regions (BAR) szekvenci\u00e1k jelentik azt\u00e1n egy <a href=\"http:\/\/journals.plos.org\/plosgenetics\/article?id=10.1371\/journal.pgen.1005738\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em>PLOS Genetics<\/em> cikk<\/a> alapanyag\u00e1t, \u00e9s ezekkel fogunk mi is jobban foglalkozni.<\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<p>A BAR szekvenci\u00e1kat ugyanis viszonylag egyszer\u0171en kl\u00f3nozni, majd egy k\u00f6nnyen detekt\u00e1lhat\u00f3 riporterg\u00e9nhez csapva, eg\u00e9rembri\u00f3kban megn\u00e9zni, hogy van-e valamilyen enhanszer-funkci\u00f3juk (annak idej\u00e9n ezt a megk\u00f6zel\u00edt\u00e9st haszn\u00e1lt\u00e1k <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005740\">ersz\u00e9nyes farkas &#8222;g\u00e9nek felt\u00e1maszt\u00e1s\u00e1hoz&#8221;<\/a> is).<\/p>\n<p>A kutat\u00f3k \u00f6sszesen 166\u00a0BAR\u00a0szekvenci\u00e1t azonos\u00edtottak, amelyek t\u00f6bbs\u00e9ge &gt;20 kb t\u00e1vols\u00e1gban volt a legk\u00f6zelebbi transzkripci\u00f3s starthelyt\u0151l. Harmincnyolc eset\u00e9ben olyan transzkripci\u00f3s faktorok vannak a k\u00f6zelben, amelyeknek a v\u00e9gtagfejl\u0151d\u00e9sben le\u00edrt szerepe m\u00e1r j\u00f3 ideje ismert, r\u00e1ad\u00e1sul a BAR-ok el\u0151szeretettel (\u00e9rtsd v\u00e9letlenn\u00e9l gyakoribban) helyezkednek el egym\u00e1s k\u00f6zels\u00e9g\u00e9ben.<\/p>\n<p>K\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 megfontol\u00e1sok alaj\u00e1n \u00f6t BAR szekvenci\u00e1t v\u00e1lasztottak ki a tov\u00e1bbi vizsg\u00e1latokhoz \u00e9s mint azt az al\u00e1bbi \u00e1bra j\u00f3l mutatja, ezek mindannyian v\u00e9gtagokban fejtenek ki g\u00e9nexpresszi\u00f3t (az \u00e1br\u00e1n a denev\u00e9r BAR-ok \u00e9s a megfelel\u0151 eg\u00e9rszekvenci\u00e1k enhanszer-aktivit\u00e1sa k\u00f6zti k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9get l\u00e1tjuk).<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\"imgnotext open-in-modal aligncenter\" src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2016\/04\/journal_pgen_1005738_g004.PNG\" alt=\"journal_pgen_1005738_g004.PNG\" \/><\/p>\n<p>A vizsg\u00e1ltakb\u00f3l k\u00fcl\u00f6n\u00f6sen \u00e9rdekesnek bizonyult a BAR116, ami a <i>HoxD<\/i> g\u00e9nklaszter melletti g\u00e9nsivatagban tal\u00e1lhat\u00f3. Mivel a <em>HoxD<\/em> g\u00e9nek v\u00e9gtagfejl\u0151d\u00e9sben bet\u00f6lt\u00f6tt szerepe <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005421\">r\u00e9g\u00f3ta ismert<\/a>, r\u00e1ad\u00e1sul a BAR116 enhanszerk\u00e9nt t\u00e9nyleg dr\u00e1mai v\u00e1ltoz\u00e1st okozott, k\u00fcl\u00f6n\u00f6sen a mells\u0151 v\u00e9gtagban, a riporterg\u00e9n expresszi\u00f3j\u00e1ban, j\u00f3 okkal lehetett fel\u00e9ttelezni, hogy \u00e9rdemes megturk\u00e1lni a denev\u00e9rembri\u00f3k\u00a0<em>HoxD\u00a0<\/em>expresszi\u00f3j\u00e1t, mert ott is elt\u00e9r\u00e9sek lesznek l\u00e1that\u00f3k, az eg\u00e9rben tapasztalhattok k\u00e9pest.<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\"imgnotext open-in-modal aligncenter\" src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2016\/04\/journal_pgen_1005738_g006.PNG\" alt=\"journal_pgen_1005738_g006.PNG\" \/><\/p>\n<p>\u00c9s val\u00f3ban ezt tapasztalt\u00e1k, a v\u00e9gtagfejl\u0151d\u00e9sben fontos\u00a0<em>HoxD<\/em> g\u00e9nek, a megfelel\u0151 fejl\u0151d\u00e9si st\u00e1diumban, \u00e1ltal\u00e1ban intenz\u00edvebb expresszi\u00f3t mutattak denev\u00e9rekben, mint eg\u00e9r megfelel\u0151ik egerekben.<\/p>\n<p>Hogy persze ez konkr\u00e9tabban mit jelent az egy nyitott k\u00e9rd\u00e9s. Minden felhajt\u00e1s ellen\u00e9re siralmasan keveset tudunk a\u00a0HoxD faktorok target-g\u00e9njeir\u0151l, \u00edgy nem tudjuk megn\u00e9zni, hogy mit jelent ez a megv\u00e1ltozott HoxD expresszi\u00f3 r\u00e1juk vonatkoztatva. Ahogy jelenleg m\u00e9g nem tudjuk azt sem megvizsg\u00e1lni, hogy mi lenne, ha mondjuk a BAR116-t ki\u00fctn\u00e9nk denev\u00e9rembri\u00f3kban. A technol\u00f3gia (a CRISPR-k r\u00e9v\u00e9n) ezt lassan lehet\u0151v\u00e9 teheti, de az\u00e9rt m\u00e9g val\u00f3sz\u00edn\u0171leg j\u00f3-p\u00e1r \u00e9vet kell v\u00e1rni.<\/p>\n<hr \/>\n<p><span style=\"font-size: xx-small;\"> <b>Booker BM, Friedrich T, Mason MK, VanderMeer JE, Zhao J, et al.<\/b> (2016) Bat Accelerated Regions Identify a Bat Forelimb Specific Enhancer in the <i>HoxD<\/i> Locus. <i>PLoS Genet<\/i> <b>12(3)<\/b>:e1005738<br \/>\n<b>Eckalbar WL, Schlebusch SA, Mason MK, Gill Z, Parker AV, et al.<\/b> (2016) Transcriptomic and epigenomic characterization of the developing bat wing. <i>Nat Genet<\/i> doi: 10.1038\/ng.3537. <\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Az evol\u00faci\u00f3 \u00e1ltal kataliz\u00e1lt morfol\u00f3giai v\u00e1ltoz\u00e1soknak mindig fejl\u0151d\u00e9stani okai vannak, ugyanis a meglev\u0151 fejl\u0151d\u00e9si program megv\u00e1ltoztat\u00e1sa\/\u00e1t\u00edr\u00e1sa lesz az els\u0151dleges oka a kifejlett \u00e1llatban megjelen\u0151 jelleg megjelen\u00e9s\u00e9nek. A denev\u00e9rek sz\u00e1rny\u00e1nak kialakul\u00e1s\u00e1val m\u00e1r t\u00f6bbsz\u00f6r is foglalkoztunk itt a blogban, de m\u00edg az &hellip; <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=8554528\">Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz&#8230;. <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":16324553,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[3],"tags":[92,5,12],"class_list":["post-8554528","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-evolucio","tag-denever","tag-evodevo","tag-hox"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/8554528","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=8554528"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/8554528\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":16324558,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/8554528\/revisions\/16324558"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/16324553"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=8554528"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=8554528"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=8554528"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}