{"id":7272853,"date":"2015-03-15T22:09:24","date_gmt":"2015-03-15T21:09:24","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2015\/03\/15\/bakterialis_genjeink"},"modified":"2021-03-27T08:28:26","modified_gmt":"2021-03-27T08:28:26","slug":"bakterialis_genjeink","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=7272853","title":{"rendered":"Bakteri\u00e1lis g\u00e9njeink"},"content":{"rendered":"<p><img decoding=\"async\" class=\"imgleft alignleft\" src=\"http:\/\/m.cdn.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2015\/03\/young_frankenstein1.jpeg\" alt=\"young_frankenstein1.jpeg\" \/>A taxonokon \u00e1t\u00edvel\u0151 g\u00e9ntranszfer a k\u00f6zbesz\u00e9dben rendre mint valami elk\u00e9pzelhetetlen\u00fcl borzaszt\u00f3, term\u00e9szetellenes dolog t\u0171nik fel \u00e9s amely a mag\u00e1t t\u00e1j\u00e9kozottnak tart\u00f3 publikum jelent\u0151s r\u00e9sz\u00e9ben\u00a0k\u00f6r\u00fclbel\u00fcl\u00a0Frankenstein \u00e9s Moreau dokik legperverzebb k\u00eds\u00e9rleteivel \u00e9rhetne csak fel.<\/p>\n<p>A val\u00f3s\u00e1gban persze nem az, el\u00e9g csak a k\u00f6z\u00e9piskolai tananyag t\u00e1rgy\u00e1t k\u00e9pez\u0151 <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2010\/12\/21\/az_endoszimbionta_gentranszfer\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">endoszimbionta g\u00e9ntranszferre gondolunk<\/a>, de az ut\u00f3bbi \u00e9vek sor\u00e1n a t\u00f6rzsfa t\u00e1voli r\u00e9szei k\u00f6zt bek\u00f6vetkez\u0151 g\u00e9ntranszfer sz\u00e1mos tov\u00e1bbi p\u00e9ld\u00e1j\u00e1val is tal\u00e1lkoztunk: <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5837739\">h\u00fcll\u0151kb\u0151l kullancsokba<\/a>, <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=6153712\">moh\u00e1kb\u00f3l p\u00e1fr\u00e1nyokba<\/a>, vagy <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005911\">gomb\u00e1kb\u00f3l lev\u00e9ltetvekbe<\/a>.<\/p>\n<p>\u00cdgy igaz\u00e1b\u00f3l nem is meglep\u0151, hogy az egyre n\u00f6vekv\u0151 genomi adatb\u00e1zisokat kihaszn\u00e1lva p\u00e1ran most <a href=\"http:\/\/genomebiology.com\/2015\/16\/1\/50\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">szisztematikusabban is neki\u00e1lltak<\/a> olyan g\u00e9neket keresni, amelyek horizont\u00e1lis g\u00e9ntranszfer r\u00e9v\u00e9n ker\u00fclhettek az ecetmuslica, fon\u00e1lf\u00e9reg, illetve f\u0151eml\u0151s genomba.<\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<p>Ezek k\u00f6z\u00fcl tal\u00e1n az el\u0151bbi a legkev\u00e9sb\u00e9 meglep\u0151, hiszen kor\u00e1bban <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005976\">mi is \u00edrtunk arr\u00f3l<\/a>, hogy pl. a\u00a0<em>Wolbachia<\/em> nev\u0171 parazit\u00e1jukb\u00f3l folyamatosan nagy genomszakaszok ker\u00fclhettek be a\u00a0<em>Drosophila<\/em> genomba. Most ezt a jelens\u00e9get sz\u00e1mszer\u0171s\u00edtett\u00e9k, felhaszn\u00e1lva a rendelkez\u00e9sre \u00e1ll\u00f3 g\u00e9nexpresszi\u00f3s (\u00fan. transzkript\u00f3ma) adatokat. (A met\u00f3dus, durva egyszer\u0171s\u00edt\u00e9sben valami olyasmi, hogy olyan transzkriptumokat kerestek, amelyek m\u00e1s t\u00f6bbsejt\u0171 genomban nem tal\u00e1lhat\u00f3k meg, csak egysejt\u0171 \u00e9s prokari\u00f3ta genomokban. Az esetleges szennyez\u0151d\u00e9sek mell\u00e9kterm\u00e9keit \u00fagy sz\u0171rt\u00e9k ki, hogy adott g\u00e9nexpresszi\u00f3s szekvenci\u00e1nak, t\u00f6bb k\u00fcl\u00f6n k\u00eds\u00e9rletben, ugyanarra a genomi poz\u00edci\u00f3ba kellett t\u00e9rk\u00e9pez\u0151dnie.)<\/p>\n<p>Ezek alapj\u00e1n a fonalf\u00e9reg\u00a0<em>C. elegans<\/em>-ban 173 olyan g\u00e9n van, ami potenci\u00e1lisan horizont\u00e1lis g\u00e9ntranszfer (HGT) eredet\u0171, ezekb\u0151l 68 nagyon-nagyon nagy bizonyoss\u00e1ggal az, az ecetmuslic\u00e1ban ezek a sz\u00e1mok 40, illetve n\u00e9gy (megj.: a\u00a0<em>Wolbachia<\/em> g\u00e9ntranszferek p\u00e9ld\u00e1ul m\u00e9g nem fix\u00e1l\u00f3dtak fajszinten, ez\u00e9rt ez a meglehet\u0151sen szer\u00e9ny sz\u00e1m), f\u0151eml\u0151s\u00f6kben pedig 109 \u00e9s 32.<\/p>\n<p>Ebb\u0151l a t\u00f6bb tucat g\u00e9nb\u0151l tal\u00e1n a leg\u00e9rdekesebb az <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/ABO_(gene)\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em>ABO<\/em> g\u00e9n<\/a> esete, amely az alapja a mindenki \u00e1ltal ismert <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/ABO_blood_group_system\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">ABO v\u00e9rcsoportoknak<\/a> is. Az\u00a0ABO feh\u00e9rje egy olyan enzim, aminek glikoziltranszfer\u00e1z aktivit\u00e1sa van \u00e9s\u00a0a v\u00f6r\u00f6sv\u00e9retestek sejtfelsz\u00edn\u00e9n lev\u0151 glikoproteinek cukoroldall\u00e1ncait m\u00f3dos\u00edtja. Ez a feh\u00e9rje gerincesekben l\u00e9tezik csak \u00e9s sem gerinctelen \u00e1llatokban, sem n\u00f6v\u00e9nyekben, sem gomb\u00e1kban nincs homol\u00f3gja, csak bakt\u00e9riumokban \u00e9s n\u00e9h\u00e1ny egysejt\u0171 eukari\u00f3t\u00e1ban.<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\"imgnotext aligncenter\" src=\"http:\/\/m.cdn.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2015\/03\/abo-humanhgt.png\" alt=\"abo-humanhgt.png\" \/><\/p>\n<p>Ez\u00e9rt is utaltak r\u00e1 <a href=\"http:\/\/www.jbc.org\/content\/285\/48\/37121.full\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">m\u00e1r kor\u00e1bban is m\u00e1sok<\/a>\u00a0hogy itt valamif\u00e9le HGT-vel \u00e1llhatunk szemben, de mivel a mostani\u00a0szisztematikus vizsg\u00e1lat is kiadta, most m\u00e1r m\u00e9g nagyobb bizonyoss\u00e1ggal mondhatjuk ezt.<\/p>\n<p>Vagyis, azok ut\u00e1n, hogy f\u00e9ny der\u00fclt, hogy a m\u00e9hlep\u00e9ny <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2015\/03\/03\/onzo_genek_onzetlen_ajandeka_a_mehlepeny\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">transzpozonok<\/a> \u00e9s <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/22877784\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">retrov\u00edrusok<\/a> domesztik\u00e1ci\u00f3ja sor\u00e1n alakult ki, \u00e9s az adapt\u00edv immunrendszer\u00fcnk is <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC2823946\/#!po=30.5556\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">\u00f6nz\u0151 g\u00e9nek m\u0171k\u00f6d\u00e9s\u00e9b\u0151l ered<\/a>, most m\u00e1r az is szinte biztosnak t\u0171nik, hogy a v\u00e9rcsoportjaink sem lenn\u00e9nek olyanok, amilyenek, ha az \u00e1llati genomok ne lenn\u00e9nek dinamikusak, \u00e9s ne integ\u00e1rln\u00e1nak magukba \u00f6r\u00f6mmel mindenf\u00e9le \u00faj szekvenci\u00e1t. A HGT hogyanj\u00e1r\u00f3l persze keveset tudunk (nem is biztos, hogy teljesen valaha rekonstru\u00e1lni lehet, mi is t\u00f6rt\u00e9nt), mindenesetre a szekvenci\u00e1k alapj\u00e1n, a klasszikusokat id\u00e9zve csak annyit mondhatunk, &#8222;nature finds a way&#8221;&#8230;<\/p>\n<hr \/>\n<p><span style=\"font-size: xx-small;\"> <b>Brew K, Tumbale P, Acharya KR<\/b> (2010) Family 6 glycosyltransferases in vertebrates and bacteria: inactivation and horizontal gene transfer may enhance mutualism between vertebrates and bacteria. <i>J Biol Chem<\/i> <b>285(48)<\/b>: 37121-7.<br \/>\n<b>Crisp A, Boschettil C, Perrz M, Tunnacliffel A, Micklem G<\/b> (2015) Expression of multiple horizontally acquired genes is a hallmark of both vertebrate and invertebrate genomes. <i>Genome Biology<\/i> <b>16<\/b>:50 doi:10.1186\/s13059-015-0607-3 <\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>A taxonokon \u00e1t\u00edvel\u0151 g\u00e9ntranszfer a k\u00f6zbesz\u00e9dben rendre mint valami elk\u00e9pzelhetetlen\u00fcl borzaszt\u00f3, term\u00e9szetellenes dolog t\u0171nik fel \u00e9s amely a mag\u00e1t t\u00e1j\u00e9kozottnak tart\u00f3 publikum jelent\u0151s r\u00e9sz\u00e9ben\u00a0k\u00f6r\u00fclbel\u00fcl\u00a0Frankenstein \u00e9s Moreau dokik legperverzebb k\u00eds\u00e9rleteivel \u00e9rhetne csak fel. A val\u00f3s\u00e1gban persze nem az, el\u00e9g csak a &hellip; <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=7272853\">Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz&#8230;. <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[3,4],"tags":[305,43,9],"class_list":["post-7272853","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-evolucio","category-gmo_vita","tag-abo-vercsoport","tag-hgt","tag-human"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/7272853","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=7272853"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/7272853\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":16324692,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/7272853\/revisions\/16324692"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=7272853"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=7272853"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=7272853"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}