{"id":7181643,"date":"2015-02-17T21:18:00","date_gmt":"2015-02-17T20:18:00","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2015\/02\/17\/hegyescsoru_mint_a_pinty_491"},"modified":"2021-04-08T12:22:53","modified_gmt":"2021-04-08T12:22:53","slug":"hegyescsoru_mint_a_pinty_491","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=7181643","title":{"rendered":"Hegyescs\u0151r\u0171, mint a pinty &#8211; 2."},"content":{"rendered":"<p><img class=\"imgright alignleft\" src=\"http:\/\/m.cdn.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2015\/02\/darwin_s_finches_by_gould.jpg\" alt=\"darwin_s_finches_by_gould.jpg\" width=\"450\" \/>Szinte napra pontosan Darwin <a href=\"http:\/\/darwinday.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">k\u00f6zelm\u00faltbeli sz\u00fclinapj\u00e1ra<\/a> tette fel honlapj\u00e1ra a\u00a0<em>Nature<\/em> azt a cikket, amit az egykori term\u00e9szettud\u00f3s minden bizonnyal nagy \u00e9lvezettel olvasott volna, hiszen egyik kedvenc \u00e1llatcsoportj\u00e1r\u00f3l, a galapagosi pintyekr\u0151l van benne sz\u00f3.<\/p>\n<p>Pontosabban a cikk t\u00e1rgya 120 (igen, sz\u00e1zh\u00fasz), a legk\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151bb fajokhoz tartoz\u00f3 egyed genomszekvenci\u00e1j\u00e1nak meghat\u00e1roz\u00e1sa \u00e9s azok \u00f6sszevet\u00e9se.<\/p>\n<p>Ez gig\u00e1szi mennyis\u00e9g\u0171 adat \u00e9s b\u0151ven lehet benne\u00a0\u00e9rdekes dolgokra lelni, mind arra vonatkoz\u00f3an, hogy mik\u00e9nt zajlott ezeknek a fajoknak a speci\u00e1ci\u00f3ja, mind arr\u00f3l, hogy az ikonikus cs\u0151rform\u00e1k v\u00e1ltoz\u00e1sa milyen DNS-szint\u0171 v\u00e1ltoz\u00e1sokra vezethet\u0151 vissza.<\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<p>Az egyik \u00e9rdekes eredm\u00e9ny az a klasszikus pinty-t\u00f6rzsfa r\u00e9szleges \u00e1trajzol\u00e1s\u00e1hoz vezetett, m\u00e9gpedig az\u00e9rt mert a hegyescs\u0151r\u0171 f\u00f6ldipinty (<em>Geospiza difficilis<\/em>) k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 popul\u00e1ci\u00f3ir\u00f3l\u00a0kider\u00fclt, hogy azok hasonl\u00f3 kin\u00e9zete nem annyira a k\u00f6zvetlen rokons\u00e1gnak, hanem sokkal ink\u00e1bb a konvergens evol\u00faci\u00f3nak k\u00f6sz\u00f6nhet\u0151k &#8211; magyar\u00e1n nem ugyanazon fajhoz tartoznak. Ezen k\u00edv\u00fcl gyakori a\u00a0hibridiz\u00e1ci\u00f3 is az egyes fajok k\u00f6z\u00f6tt &#8211; ami, b\u00e1r els\u0151re ellentmondani l\u00e1tszik a szigor\u00faan \u00e9rtelmezett biol\u00f3giai fajfogalomnak, amely szerint k\u00fcl\u00f6n fajok nem hozhatnak l\u00e9tre szaporod\u00f3k\u00e9pes ut\u00f3dokat, val\u00f3j\u00e1ban csak azt igazolja, hogy <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005793\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">a fajok kialakul\u00e1sa sor\u00e1n van egy &#8220;sz\u00fcrke z\u00f3na&#8221;<\/a>, ahol a k\u00e9t elk\u00fcl\u00f6n\u00fcl\u0151 popul\u00e1ci\u00f3 m\u00e1r sok jellegben k\u00fcl\u00f6nb\u00f6zik, de m\u00e9g id\u0151r\u0151l id\u0151re van k\u00f6zt\u00fck kapcsolat.<\/p>\n<p><img class=\"imgnotext open-in-modal aligncenter\" src=\"http:\/\/m.cdn.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2015\/02\/finch_phylo.png\" alt=\"finch_phylo.png\" \/>A tompa \u00e9s hegyes cs\u0151r\u0171 fajok genetikai diverzit\u00e1s\u00e1nak \u00f6sszevet\u00e9se arra ny\u00fajtott aprop\u00f3t, hogy olyan tipikus k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9geket keressenek, amelyek pintyfajok &#8220;c\u00e9g\u00e9r\u00e9nek&#8221; kialakul\u00e1s\u00e1t \u00e9s relat\u00edve gyors evol\u00faci\u00f3s v\u00e1ltoz\u00e1s\u00e1t magyar\u00e1zhatj\u00e1k. Kor\u00e1bbi vizsg\u00e1latok m\u00e1r fellebbentett\u00e9k a f\u00e1tylat arr\u00f3l, hogy egyr\u00e9szt a <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005456\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">calmodulin (CALM) nev\u0171 k\u00e1lcium-szenzor feh\u00e9rje<\/a>, valamint <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005292\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">a BMP-jel\u00e1tviteli \u00fatvonal is<\/a> felel\u0151ssek ennek a fenot\u00edpusnak az alakul\u00e1s\u00e1\u00e9rt, de val\u00f3sz\u00edn\u0171s\u00edthet\u0151 volt, hogy ez m\u00e9g nem a teljes k\u00e9p.<\/p>\n<p>A teljes genom \u00f6sszvet\u00e9sek egyr\u00e9szt visszaigazolt\u00e1k, hogy a CALM-t k\u00f3dol\u00f3 g\u00e9n\u00a0k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 all\u00e9ljai lehetnek jelen a tompa illetve hegyes cs\u0151r\u0171 pintyekben, ugyanakkor a kor\u00e1bban h\u00edrbe-hozott\u00a0<em>BMP4\u00a0<\/em>g\u00e9n eset\u00e9ben nem leltek olyan, szelekci\u00f3s nyom\u00e1s alatt lev\u0151 genetikai elt\u00e9r\u00e9st, ami relev\u00e1nsnak t\u00fcnn\u00e9nek, \u00edgy val\u00f3sz\u00edn\u0171bb, hogy a\u00a0<em>BMP4<\/em> expresszi\u00f3j\u00e1t befoly\u00e1sol\u00f3 transzkripci\u00f3s faktorok k\u00f6z\u00f6tt vannak all\u00e9likus k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9gek a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 cs\u0151r\u0171 madarak k\u00f6z\u00f6tt.<\/p>\n<p>Aprop\u00f3 transzkripci\u00f3s faktorok: a genom-\u00f6sszevet\u00e9sek egyik fontos eredm\u00e9nye, hogy kider\u00fclt, a k\u00e9t cs\u0151rt\u00edpus k\u00f6zti k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9gek jelent\u0151s r\u00e9sze az <i>ALX1<\/i> g\u00e9nhez kapcsolhat\u00f3. Az ALX1 egy homeobox transzkripci\u00f3s faktor, amely a gerinces arc fejl\u0151d\u00e9s\u00e9ben fontos szerepet j\u00e1tszik \u00e9s amelynek a hum\u00e1n mut\u00e1ci\u00f3i arc-deform\u00e1ci\u00f3hoz vezetnek.<\/p>\n<p><img class=\"imgnotext aligncenter\" src=\"http:\/\/m.cdn.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2015\/02\/finch_alx1_1.png\" alt=\"finch_alx1_1.png\" \/><\/p>\n<p>A tanulm\u00e1ny sor\u00e1n siker\u00fclt egy tompa (blunt &#8211; <em>B<\/em>) \u00e9s egy hegyes (pointed &#8211; <em>P<\/em>) cs\u0151r\u00e9rt felel\u0151s \u00fan. <em>ALX1\u00a0<\/em>haplot\u00edpust azonos\u00edtani, aminek seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel nagyon nagy bizonyoss\u00e1ggal lehet j\u00f3solni, puszt\u00e1n DNS alapj\u00e1n, hogy annak a gazd\u00e1ja milyen cs\u0151rrel rendelkezett.<\/p>\n<p><img class=\"imgleft alignleft\" src=\"http:\/\/m.cdn.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2015\/02\/finch_alx1_2.png\" alt=\"finch_alx1_2.png\" \/>S\u0151t, a homozig\u00f3ta\u00a0<em>BB<\/em>, illetve\u00a0<em>PP<\/em>, valamint a heterozig\u00f3ta\u00a0<em>BP<\/em> haplot\u00edpusok nem csak fajok k\u00f6z\u00f6tt rendelkeztek nagy predikt\u00edv er\u0151vel, hanem egy konkr\u00e9t fajon bel\u00fcl is t\u00fckr\u00f6zt\u00e9k, hogy a hordoz\u00f3juk milyen cs\u0151rrel rendelkezik.<\/p>\n<p>A sz\u00f3banforg\u00f3 faj ez esetben a\u00a0<em>Geospiza<\/em><em> fortis<\/em>, amely eset\u00e9ben a galapagosi pintyek k\u00e9t legh\u00edresebb megfigyel\u0151je, Peter \u00e9s Rosemary Grant <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005441\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">p\u00e1r \u00e9vvel ezel\u0151tt le\u00edrta<\/a>, hogy viszonylag gyors \u00e9ghajlatv\u00e1ltoz\u00e1sokhoz is gyorsan tudtak alkalmazkodni.<\/p>\n<p>Ezt, a mostani adatok szerint, az tette lehet\u0151v\u00e9, hogy a\u00a0<em>G. fortis<\/em> pont azon kev\u00e9s fajok egyike, ahol a tompa \u00e9s hegyes cs\u0151r\u00e9rt felel\u0151s <em>ALX1<\/em>\u00a0<em>B\u00a0<\/em>\u00e9s a\u00a0<em>P<\/em> haplot\u00edpus egyszerre jelen van a popul\u00e1ci\u00f3kban &#8211; vagyis nagyszer\u0171 genetikai &#8220;alapanyaga&#8221; volt a term\u00e9szetes szelekci\u00f3nak.<\/p>\n<p>(via <a href=\"http:\/\/www.nature.com\/news\/darwin-s-iconic-finches-join-genome-club-1.16896\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em>Nature News<\/em><\/a>)<\/p>\n<hr \/>\n<p><small> <b>Lamichhaney S, Berglund J, Alm\u00e9n MS, Maqbool K, Grabherr M, et al.<\/b> (2015) Evolution of Darwin\/&#8217;s finches and their beaks revealed by genome sequencing. <i>Nature<\/i> <a href=\"http:\/\/www.nature.com\/articles\/nature14181.epdf?referrer_access_token=jmezcKLeYX8zCPO3o_ZOstRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0ODgXsWp-F9_NgFK0K5_VFduWOcoE95gW47PZ9W1CYL1k5OWte2bcdyGLly8BgolG3K8ux92x7c_KY_opHIcz67\">http:\/\/dx.doi.org\/10.1038\/nature14181<\/a> <\/small><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Szinte napra pontosan Darwin k\u00f6zelm\u00faltbeli sz\u00fclinapj\u00e1ra tette fel honlapj\u00e1ra a\u00a0Nature azt a cikket, amit az egykori term\u00e9szettud\u00f3s minden bizonnyal nagy \u00e9lvezettel olvasott volna, hiszen egyik kedvenc \u00e1llatcsoportj\u00e1r\u00f3l, a galapagosi pintyekr\u0151l van benne sz\u00f3. Pontosabban a cikk t\u00e1rgya 120 (igen, sz\u00e1zh\u00fasz), &hellip; <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=7181643\">Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz&#8230;. <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[3],"tags":[331,5,66],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/7181643"}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=7181643"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/7181643\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":16324834,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/7181643\/revisions\/16324834"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=7181643"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=7181643"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=7181643"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}