{"id":5006108,"date":"2012-05-25T19:11:48","date_gmt":"2012-05-25T17:11:48","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2012\/05\/25\/melyik_mutacio_elonyosebb"},"modified":"2012-05-25T19:11:48","modified_gmt":"2012-05-25T17:11:48","slug":"melyik_mutacio_elonyosebb","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5006108","title":{"rendered":"Melyik mut\u00e1ci\u00f3 el\u0151ny\u00f6sebb?"},"content":{"rendered":"<p><!-- \t\t@page { margin: 2cm } \t\tP { margin-bottom: 0.21cm } \t\tA:link { so-language: zxx } --><\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"blossom-image-align-left\" src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/szalicin01.jpg\" alt=\"\" width=\"419\" height=\"255\" \/>Mut\u00e1ci\u00f3kr\u00f3l m\u00e1r volt sz\u00f3 <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/\">kor\u00e1bban<\/a> is, a mai cikkben azonban azt vizsg\u00e1lt\u00e1k, hogy hogyan viszonyulnak egym\u00e1shoz a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 t\u00edpus\u00fa mut\u00e1ci\u00f3k. Arr\u00f3l m\u00e1r sz\u00e1mos adat ismert, hogy ha egy er\u0151s a kompet\u00edci\u00f3, akkor azok a bakt\u00e9riumsejtek ker\u00fclnek el\u0151nybe, amelyekben t\u00f6bb <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/\">mut\u00e1ci\u00f3 t\u00f6rt\u00e9nik<\/a>, azonban a ma boncolgatott cikkben Feh\u00e9r Tam\u00e1s \u00e9s munkat\u00e1rsai azt vizsg\u00e1lt\u00e1k meg, hogyan kompet\u00e1l egym\u00e1ssal k\u00e9t bakt\u00e9riumt\u00f6rzs, amelyekben k\u00e9t k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 t\u00edpus\u00fa mut\u00e1ci\u00f3 t\u00f6rt\u00e9nik nagy gyakoris\u00e1ggal.<\/p>\n<p><!--more--><!-- \t\t@page { margin: 2cm } \t\tP { margin-bottom: 0.21cm } \t\tA:link { so-language: zxx } --><\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"blossom-image-align-left\" src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/szalicin01.jpg\" alt=\"\" width=\"419\" height=\"255\" \/>Mut\u00e1ci\u00f3kr\u00f3l m\u00e1r volt sz\u00f3 <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/\">kor\u00e1bban<\/a> is, a mai cikkben azonban azt vizsg\u00e1lt\u00e1k, hogy hogyan viszonyulnak egym\u00e1shoz a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 t\u00edpus\u00fa mut\u00e1ci\u00f3k. Arr\u00f3l m\u00e1r sz\u00e1mos adat ismert, hogy ha egy er\u0151s a kompet\u00edci\u00f3, akkor azok a bakt\u00e9riumsejtek ker\u00fclnek el\u0151nybe, amelyekben t\u00f6bb <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/\">mut\u00e1ci\u00f3 t\u00f6rt\u00e9nik<\/a>, azonban a ma boncolgatott cikkben Feh\u00e9r Tam\u00e1s \u00e9s munkat\u00e1rsai azt vizsg\u00e1lt\u00e1k meg, hogyan kompet\u00e1l egym\u00e1ssal k\u00e9t bakt\u00e9riumt\u00f6rzs, amelyekben k\u00e9t k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 t\u00edpus\u00fa mut\u00e1ci\u00f3 t\u00f6rt\u00e9nik nagy gyakoris\u00e1ggal.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Hogy ezt a k\u00e9rd\u00e9st egy\u00e1ltal\u00e1n megk\u00f6zel\u00edthess\u00e9k, felhaszn\u00e1lt\u00e1k a P\u00f3sfai Gy\u00f6rgy laborj\u00e1ban el\u0151\u00e1ll\u00edtott MDS42 <em>Escherichia coli<\/em> bakt\u00e9riumt\u00f6rzset, amelynek a genomj\u00e1b\u00f3l elt\u00e1vol\u00edtottak sz\u00e1mos nem-l\u00e9tfontoss\u00e1g\u00fa g\u00e9nt. Ez sz\u00e1mokban kifejezve annyit jelent, hogy a vad t\u00edpus\u00fa <em>E. coli<\/em> t\u00f6rzs 4434 g\u00e9nj\u00e9b\u0151l elt\u00e1vol\u00edtottak 743 -t, ami a genom valamivel t\u00f6bb, mint tizen\u00f6t sz\u00e1zal\u00e9k\u00e1t jelenti. Ezek mellett elt\u00e1vol\u00edtott\u00e1k a genomb\u00f3l az \u00f6sszes ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elemet is, \u00edgy ezek mut\u00e1ci\u00f3kat sem okoznak ebben a t\u00f6rzsben.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">A k\u00eds\u00e9rletek sor\u00e1n a bakt\u00e9riumokat minim\u00e1l t\u00e1ptalajon tartott\u00e1k, egyetlen sz\u00e9nforr\u00e1sk\u00e9nt szalicint adva hozz\u00e1. Az <em>E. coli<\/em> ugyanis alapesetben k\u00e9ptelen felhaszn\u00e1lni a szalicint, b\u00e1r megvannak a genomj\u00e1ban az ehhez sz\u00fcks\u00e9ges enzimeket k\u00f3dol\u00f3 g\u00e9nek, \u00e1m ez a <em>bgl<\/em> operon nem fejez\u0151dik ki \u00e9s nem is induk\u00e1lhat\u00f3. \u00cdgy a szalicintartalm\u00fa minim\u00e1lt\u00e1ptalajra sz\u00e9lesztett <em>E. coli<\/em> sejtek t\u00falnyom\u00f3 t\u00f6bbs\u00e9ge \u00e9hen hal, egyed\u00fcl a ritka, \u00fajonnan megjelen\u0151, szalicint felhaszn\u00e1lni k\u00e9pes mut\u00e1nsok maradnak meg. Ezek l\u00e1that\u00f3ak az els\u0151 \u00e1br\u00e1n. Alapesetben a <em>bgl<\/em> operon kifejez\u0151d\u00e9s\u00e9t egy AT gazdag represszorszekvencia g\u00e1tolja \u00e9s ha m\u00e9gis elindulna a transzkripci\u00f3, a T1 \u00e9s a T2 termin\u00e1tor szakaszok le is \u00e1ll\u00edtj\u00e1k. Ha egy ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elem \u00e9p\u00fcl be a represszorszekvencia mell\u00e9 (B \u00e1bra), a <em>bglG<\/em> g\u00e9n \u00e1t\u00edr\u00f3dik, az \u00e1ltala k\u00f3dolt feh\u00e9rje szalicin jelenl\u00e9t\u00e9ben k\u00e9pes megg\u00e1tolni a k\u00e9t termin\u00e1torszakasz m\u0171k\u00f6d\u00e9s\u00e9t, \u00edgy \u00e1t\u00edr\u00f3dik az operon, a sejt fel tudja haszn\u00e1lni a szalicint. E mellett sz\u00e1mos pontmut\u00e1ci\u00f3 k\u00e9pes aktiv\u00e1lni a <em>bgl<\/em> operont, hiszen mut\u00e1ci\u00f3k nyom\u00e1n m\u0171k\u00f6d\u00e9sk\u00e9ptelenn\u00e9 v\u00e1lhat a represszorszekvencia \u00e9s a k\u00e9t transzkripci\u00f3s termin\u00e1torszekvencia is. Ebben a rendszerben a <em>bgl<\/em> operont aktiv\u00e1l\u00f3 mut\u00e1ci\u00f3k egy\u00e9rtelm\u0171en el\u0151ny\u00f6sek, amelyik bakt\u00e9riumsejtben megt\u00f6rt\u00e9nnek, az nem \u00e9hezik tov\u00e1bb, \u00edgy k\u00f6nnyen t\u00faln\u00f6vi azokat, amelyekben nem k\u00e9pesek felhaszn\u00e1lni a szalicint.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"blossom-image-align-right\" src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/szalicin02.jpg\" alt=\"\" width=\"292\" height=\"254\" \/>A k\u00eds\u00e9rlet m\u00e1sik eleme az egyes bakt\u00e9riumt\u00f6rzsek felismer\u00e9se, hiszen ahhoz, hogy tudjuk, melyik t\u00f6rzs n\u0151tte t\u00fal a m\u00e1sikat, valahogyan el kell k\u00fcl\u00f6n\u00edteni egym\u00e1st\u00f3l a k\u00e9t t\u00f6rzset. Az egyes t\u00f6rzsek genomj\u00e1ba \u00e9ppen ez\u00e9rt bejuttattak egy k\u00e9ken fluoreszk\u00e1l\u00f3 feh\u00e9rj\u00e9t (CFP) k\u00f3dol\u00f3 g\u00e9nt vagy egy s\u00e1rg\u00e1n fluoreszk\u00e1l\u00f3 feh\u00e9rj\u00e9t (YFP) k\u00f3dol\u00f3 g\u00e9nt, \u00edgy egyszer\u0171en iboly\u00e1nt\u00fali f\u00e9nyben megk\u00fcl\u00f6nb\u00f6ztethet\u0151 egym\u00e1st\u00f3l a k\u00e9ken \u00e9s a s\u00e1rg\u00e1n vil\u00e1g\u00edt\u00f3 k\u00e9t t\u00f6rzs.  \u00cdgy egy kevert kult\u00far\u00e1ban meg\u00e1llap\u00edthat\u00f3 az egyik illetve a m\u00e1sik t\u00f6rzsb\u0151l sz\u00e1rmaz\u00f3 sejtek pontos ar\u00e1nya. Ez l\u00e1that\u00f3 a m\u00e1sodik \u00e1br\u00e1n. R\u00e1ad\u00e1sul a sejtek nem folyamatosan fejezt\u00e9k ki ezeket a g\u00e9neket, a leolvas\u00e1s el\u0151tt anhidotetraciklinnel induk\u00e1lt\u00e1k a CFP \u00e9s YFP feh\u00e9rj\u00e9k kifejez\u0151d\u00e9s\u00e9t, \u00edgy azok nem zavarhatt\u00e1k meg a sejtek n\u00f6veked\u00e9s\u00e9t. \u00cdgy \u00f6sszesen n\u00e9gy bakt\u00e9riumt\u00f6rzzsel dolgoztak az MDS42 t\u00f6rzsh\u00f6z viszony\u00edtott\u00e1k a t\u00f6bbit, az MDS40-IS1 -t, amely egyetlen p\u00e9ld\u00e1nyt tartalmaz az IS1 ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elemb\u0151l, az MDS42-\u0394<em>mutS<\/em> -t, amely egy mut\u00e1tor t\u00f6rzs, sokkal gyakrabban t\u00f6rt\u00e9nnek benne pontmut\u00e1ci\u00f3k, mint az MDS42 -ben \u00e9s az MDS42-IS1-\u0394<em>mutS<\/em> -t, amelyben a pontmut\u00e1ci\u00f3k is gyakoribbak \u00e9s egy ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elemet is tartalmaz.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Az els\u0151 k\u00eds\u00e9rletben MDS42 \u00e9s MDS42-IS1 t\u00f6rzseket kevertek \u00f6ssze egyenl\u0151 ar\u00e1nyban, majd egy h\u00e9tig hagyt\u00e1k \u0151ket evolv\u00e1lni, azt\u00e1n megm\u00e9rt\u00e9k, hogy a szalicint em\u00e9szteni k\u00e9pes sejtek milyen ar\u00e1nyban sz\u00e1rmaznak az egyik illetve a m\u00e1sik t\u00f6rzsb\u0151l. Azt tapasztalt\u00e1k, hogy kilencszer t\u00f6bb szalicint em\u00e9szteni k\u00e9pes egyed sz\u00e1rmazik az MDS42-IS1 t\u00f6rzsb\u0151l, az egyetlen ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elem jelenl\u00e9t\u00e9t a <em>bgl<\/em> operonban a szalicinem\u00e9szt\u0151 t\u00f6rzsek kilenctized\u00e9b\u0151l ki is tudt\u00e1k mutatni. Ezek ut\u00e1n ugyanebben a rendszerben megvizsg\u00e1lt\u00e1k az MDS42-<span style=\"font-family: Times New Roman,serif;\">\u0394<\/span><em>mutS<\/em> t\u00f6rzset, amelyben az MDS42 -h\u00f6z k\u00e9pest sz\u00e1zszor t\u00f6bb pontmut\u00e1ci\u00f3 t\u00f6rt\u00e9nik. Azt tapasztalt\u00e1k, hogy ilyen k\u00f6r\u00fclm\u00e9nyek k\u00f6z\u00f6tt az egy h\u00e9tig evolv\u00e1lni hagyott sejtek k\u00f6z\u00f6tt minden hatsz\u00e1znyolcvanhatodik mut\u00e1tor t\u00f6rzsb\u00f3l sz\u00e1rmaz\u00f3ra jutott csak egy MDS42 t\u00f6rzsb\u0151l sz\u00e1rmaz\u00f3, meg\u00e1llap\u00edtott\u00e1k, hogy a mut\u00e1tor t\u00f6rzs el\u00e9g nagy el\u0151nyt \u00e9lvez ezekben a k\u00eds\u00e9rletekben. Ezek ut\u00e1n megpr\u00f3b\u00e1lt\u00e1k az MDS42-IS1 t\u00f6rzset a MDS42-<span style=\"font-family: Times New Roman,serif;\">\u0394<\/span><em>mutS<\/em> t\u00f6rzzsel evolv\u00e1ltatni \u00e9s azt tapasztalt\u00e1k, hogy a k\u00eds\u00e9rlet v\u00e9g\u00e9re a szalicinem\u00e9szt\u0151 sejtek 1:2,4 ar\u00e1nyban sz\u00e1rmaztak az MDS42-IS1 \u00e9s a MDS42-<span style=\"font-family: Times New Roman,serif;\">\u0394<\/span><em>mutS<\/em> t\u00f6rzsb\u0151l, ebb\u0151l \u00fagy t\u0171nik, hogy a pontmut\u00e1ci\u00f3k el\u0151ny\u00f6sebbek, mint az ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elemek be\u00e9p\u00fcl\u00e9sei. Ezek ut\u00e1n k\u00e9zenfekv\u0151 a k\u00e9rd\u00e9s, hogy ha az ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elem jelenl\u00e9te  is el\u0151ny\u00f6s \u00e9s a mut\u00e1tor fenot\u00edpus is el\u0151ny\u00f6s, mi t\u00f6rt\u00e9nik, ha egy sejt mut\u00e1tor fenot\u00edpust is mutat \u00e9s egy ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elemet is tartalmaz? Ezt a k\u00eds\u00e9rletet is elv\u00e9gezt\u00e9k, az MDS42-IS1-\u0394mutS t\u00f6rzs sikeresen kompet\u00e1l az MDS42-IS1 \u00e9s a MDS42-<span style=\"font-family: Times New Roman,serif;\">\u0394<\/span><em>mutS<\/em> t\u00f6rzzsel is. Ezen eredm\u00e9nyek l\u00e1that\u00f3ak a harmadik \u00e1br\u00e1n.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"blossom-image-align-block\" src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/201205\/szalicin03.jpg\" alt=\"\" width=\"467\" height=\"259\" \/><\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">No most, milyen k\u00f6vetkeztet\u00e9seket lehet levonni ezekb\u0151l a k\u00eds\u00e9rletekb\u0151l? Ha egy \u00e9l\u0151l\u00e9nynek \u00faj k\u00f6rnyezethez kell alkalmazkodnia, a magasabb mut\u00e1ci\u00f3s r\u00e1ta egy\u00e9rtelm\u0171en el\u0151ny\u00f6s, de \u00fagy t\u0171nik nem mindegy, milyen mut\u00e1ci\u00f3k t\u00f6rt\u00e9nnek: Ebben a rendszerben a pontmut\u00e1ci\u00f3k egy\u00e9rtelm\u0171en el\u0151ny\u00f6sebbek mint egy ugr\u00e1l\u00f3 genetikai elem mozg\u00e1sa.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">\u00a0<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Feh\u00e9r T, Bogos B, M\u00e9hi O, Fekete G, Cs\u00f6rgo B, Kov\u00e1cs K, P\u00f3sfai G, Papp B, Hurst LD, P\u00e1l C. (2012): Competition between Transposable Elements and Mutator Genes in Bacteria. Molecular Biology and Evolution [Epub ahead of print]<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">P\u00f3sfai G, Plunkett G 3rd, Feh\u00e9r T, Frisch D, Keil GM, Umenhoffer K, Kolisnychenko V, Stahl B, Sharma SS, de Arruda M, Burland V, Harcum SW, Blattner FR. (2006): Emergent properties of reduced-genome Escherichia coli. Science. 312(5776):1044-6.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Mut\u00e1ci\u00f3kr\u00f3l m\u00e1r volt sz\u00f3 kor\u00e1bban is, a mai cikkben azonban azt vizsg\u00e1lt\u00e1k, hogy hogyan viszonyulnak egym\u00e1shoz a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 t\u00edpus\u00fa mut\u00e1ci\u00f3k. Arr\u00f3l m\u00e1r sz\u00e1mos adat ismert, hogy ha egy er\u0151s a kompet\u00edci\u00f3, akkor azok a bakt\u00e9riumsejtek ker\u00fclnek el\u0151nybe, amelyekben t\u00f6bb mut\u00e1ci\u00f3 &hellip; <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5006108\">Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz&#8230;. <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-5006108","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-uncategorized"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5006108","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5006108"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5006108\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5006108"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=5006108"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=5006108"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}