{"id":5005994,"date":"2011-02-24T22:10:20","date_gmt":"2011-02-24T21:10:20","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2011\/02\/24\/az_embertol_kapta_el"},"modified":"2011-02-24T22:10:20","modified_gmt":"2011-02-24T21:10:20","slug":"az_embertol_kapta_el","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005994","title":{"rendered":"Az embert\u0151l kapta el"},"content":{"rendered":"

\"\"Ha ember, bakt\u00e9rium \u00e9s g\u00e9ntranszfer szerepel egy h\u00edrben, akkor szinte biztosak lehet\u00fcnk benne, hogy a genetikai anyag \u00e1raml\u00e1sa a prokari\u00f3ta fel\u0151l<\/em> t\u00f6rt\u00e9nt. De az\u00e9rt ennek a ter\u00fcletnek is megvannak a maga „ember harapott kuty\u00e1ba” t\u00f6rt\u00e9netei<\/a>, amikor nem a k\u00e9zenfekv\u0151nek t\u0171n\u0151 esem\u00e9ny k\u00f6vetkezik be.<\/p>\n

A trippert okoz\u00f3 Neisseria gonorrhoeae-<\/em>t\u0151l egy\u00e9bk\u00e9nt sem \u00e1ll messze a fert\u0151z\u00e9s, \u00e1m kiv\u00e9telesen most m\u00e9gis egy olyan esetr\u0151l \u00edrn\u00e9k, amikor kv\u00e1zi hum\u00e1n gazd\u00e1ja „fert\u0151zte” meg a k\u00f3rokoz\u00f3t. A „fert\u0151z\u00e9s” t\u00e1rgya ez emberi genomban rengeteg p\u00e9ld\u00e1nyban el\u0151fordul\u00f3 L1 transzpozon, ugyanis ennek egy darabj\u00e1nak jelenl\u00e9t\u00e9t siker\u00fclt kimutatni t\u00f6bb N. gonorrhoeae <\/em>izol\u00e1tumb\u00f3l.<\/p>\n

A LINE ugr\u00e1l\u00f3elemek<\/a> k\u00f6z\u00e9 tartoz\u00f3 L1 standard k\u00f6r\u00fclm\u00e9nyek k\u00f6z\u00f6tt csak eukari\u00f3ta genomokban gar\u00e1zd\u00e1lkodik, ahol j\u00f3 retrotranszpozonhoz ill\u0151en, \u00f6nmag\u00e1t sokszoros\u00edtja RNS k\u00f3pi\u00e1k \u00e9s azokat DNS-re vissza\u00edr\u00f3 reverz transzkript\u00e1z enzimek<\/a> seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel. Ennek megfelel\u0151en olyan DNS szakaszt tal\u00e1lni, ami egy\u00e9rtelm\u0171en L1 eredet\u0171, egy prokari\u00f3t\u00e1ban finoman sz\u00f3lva sem trivi\u00e1lis.<\/p>\n

<\/p>\n

\"\"Ha ember, bakt\u00e9rium \u00e9s g\u00e9ntranszfer szerepel egy h\u00edrben, akkor szinte biztosak lehet\u00fcnk benne, hogy a genetikai anyag \u00e1raml\u00e1sa a prokari\u00f3ta fel\u0151l<\/em> t\u00f6rt\u00e9nt. De az\u00e9rt ennek a ter\u00fcletnek is megvannak a maga „ember harapott kuty\u00e1ba” t\u00f6rt\u00e9netei<\/a>, amikor nem a k\u00e9zenfekv\u0151nek t\u0171n\u0151 esem\u00e9ny k\u00f6vetkezik be.<\/p>\n

A trippert okoz\u00f3 Neisseria gonorrhoeae-<\/em>t\u0151l egy\u00e9bk\u00e9nt sem \u00e1ll messze a fert\u0151z\u00e9s, \u00e1m kiv\u00e9telesen most m\u00e9gis egy olyan esetr\u0151l \u00edrn\u00e9k, amikor kv\u00e1zi hum\u00e1n gazd\u00e1ja „fert\u0151zte” meg a k\u00f3rokoz\u00f3t. A „fert\u0151z\u00e9s” t\u00e1rgya ez emberi genomban rengeteg p\u00e9ld\u00e1nyban el\u0151fordul\u00f3 L1 transzpozon, ugyanis ennek egy darabj\u00e1nak jelenl\u00e9t\u00e9t siker\u00fclt kimutatni t\u00f6bb N. gonorrhoeae <\/em>izol\u00e1tumb\u00f3l.<\/p>\n

A LINE ugr\u00e1l\u00f3elemek<\/a> k\u00f6z\u00e9 tartoz\u00f3 L1 standard k\u00f6r\u00fclm\u00e9nyek k\u00f6z\u00f6tt csak eukari\u00f3ta genomokban gar\u00e1zd\u00e1lkodik, ahol j\u00f3 retrotranszpozonhoz ill\u0151en, \u00f6nmag\u00e1t sokszoros\u00edtja RNS k\u00f3pi\u00e1k \u00e9s azokat DNS-re vissza\u00edr\u00f3 reverz transzkript\u00e1z enzimek<\/a> seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel. Ennek megfelel\u0151en olyan DNS szakaszt tal\u00e1lni, ami egy\u00e9rtelm\u0171en L1 eredet\u0171, egy prokari\u00f3t\u00e1ban finoman sz\u00f3lva sem trivi\u00e1lis.<\/p>\n

A le\u00edrt esetet az al\u00e1bbi \u00e1bra magyar\u00e1zgatja meg, ahol az (A) panelen egy L1 elem sematikus szerkezete l\u00e1that\u00f3, (B)-n a sz\u00f3banforg\u00f3, L1 eredet\u0171 szekvencia (erre nL1-k\u00e9nt utalnak a cikk szerz\u0151i), v\u00e9g\u00fcl a (C) panelen a Neisseria <\/em>genomj\u00e1nak azon poz\u00edci\u00f3ja, ahova az inszerci\u00f3 t\u00f6rt\u00e9nt.<\/p>\n

\"\"\u00c9rdekes a t\u00f6rt\u00e9netben, hogy igaz\u00e1b\u00f3l csak n\u00e9h\u00e1ny N.\u00a0gonorrhoeae<\/em> izol\u00e1tum hordozza az nL1-t, ami arra utal, hogy a DNS be\u00e9p\u00fcl\u00e9se a relat\u00edv k\u00f6zelm\u00faltban t\u00f6rt\u00e9nhetett.<\/p>\n

\"\"A mell\u00e9kelt PCR eredm\u00e9nye is mutatja, hogy, ha az nL1-et hat\u00e1rol\u00f3 szakaszok k\u00f6zti genomi r\u00e9gi\u00f3t akarjuk felszapor\u00edtani, akkor a legt\u00f6bb izol\u00e1tumban egy viszonylag r\u00f6vid DNS darab keletkezik (nL1–<\/sup>) \u00e9s csak h\u00e1rom esetben lelj\u00fck nyom\u00e1t egy kb 700 b\u00e1zisp\u00e1r hossz\u00fa inszerci\u00f3nak (nL1+<\/sup>). Hogy ut\u00f3bbi identit\u00e1sa se legyen k\u00e9rd\u00e9ses, L1 specifikus szekvenciak\u00e9nt azonos\u00edthat\u00f3, ezt mutatja a (B) panel, ahol a hum\u00e1n minta szolg\u00e1l pozit\u00edv kontrollk\u00e9nt.<\/p>\n

Hogyan jutott az L1 a bakt\u00e9riumba? A pontos mechanizmus nem vil\u00e1gos, de az szinte biztos, hogy nem reverz transzrkipci\u00f3val, hiszen akkor egy teljes L1 k\u00f3pia kellene jelen legyen. Ink\u00e1bb arr\u00f3l lehet sz\u00f3, hogy ezek bakt\u00e9riumok el\u0151szeretettel vesznek fel a k\u00f6rnyezet\u00fckb\u0151l DNS darabokat, hiszen ezzel sokkal gyorsabban lehet \u00faj, potenci\u00e1lisan hasznos szekvenci\u00e1khoz jutni, mint a f\u00e1radts\u00e1gos klasszikus mut\u00e1ci\u00f3kkal. Egy embert fert\u0151z\u0151 bakt\u00e9riumba pedig bejutott egy L1 darabka (pl. egy pusztul\u00f3 sejtnek a fragment\u00e1l\u00f3d\u00f3 DNS-\u00e9b\u0151l), ami sikeresen be\u00e9p\u00fclt.<\/p>\n

Az \u00e9rdekes k\u00e9rd\u00e9s persze, hogy mindez egy v\u00e9letlen \u00e9s csak id\u0151 k\u00e9rd\u00e9se, hogy az nL1 elvesszen, vagy esetleg jelenl\u00e9te valami el\u0151nyt biztos\u00edt hordoz\u00f3j\u00e1nak. Erre sajnos m\u00e9g nem der\u00fclt f\u00e9ny, de rem\u00e9lhet\u0151leg, ami k\u00e9sik, nem m\u00falik<\/p>\n

\n

Anderson MT, Seifert HS.<\/strong> (2011) Opportunity and means: horizontal gene transfer from the human host to a bacterial pathogen. MBio<\/em> 2(1)<\/strong> pii: e00005-11. doi: 10.1128\/mBio.00005-11. <\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Ha ember, bakt\u00e9rium \u00e9s g\u00e9ntranszfer szerepel egy h\u00edrben, akkor szinte biztosak lehet\u00fcnk benne, hogy a genetikai anyag \u00e1raml\u00e1sa a prokari\u00f3ta fel\u0151l t\u00f6rt\u00e9nt. De az\u00e9rt ennek a ter\u00fcletnek is megvannak a maga „ember harapott kuty\u00e1ba” t\u00f6rt\u00e9netei, amikor nem a k\u00e9zenfekv\u0151nek t\u0171n\u0151 … Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz…. →<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-5005994","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-uncategorized"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005994","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5005994"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005994\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5005994"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=5005994"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=5005994"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}