{"id":5005845,"date":"2009-09-16T17:54:29","date_gmt":"2009-09-16T15:54:29","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2009\/09\/16\/lement_a_zomanc"},"modified":"2009-09-16T17:54:29","modified_gmt":"2009-09-16T15:54:29","slug":"lement_a_zomanc","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005845","title":{"rendered":"Lement a zom\u00e1nc"},"content":{"rendered":"

\nPszeudog\u00e9nekr\u0151l, vagyis olyan szekvenci\u00e1kr\u00f3l, amelyek egykor akt\u00edv g\u00e9neket k\u00f3doltak, de m\u00e1ra elvesztett\u00e9k funkci\u00f3jukat, m\u00e1r t\u00f6bbsz\u00f6r<\/a> ejtett\u00fcnk<\/a> sz\u00f3t a blogban, term\u00e9szetesen nem v\u00e9letlen\u00fcl. Mint azt m\u00e1r kor\u00e1bban is hangs\u00falyoztam, kev\u00e9s jobb bizony\u00edt\u00e9ka l\u00e9tezik az evol\u00faci\u00f3nak: ezek a g\u00e9nek olyan szervek kialak\u00edt\u00e1s\u00e1ban vettek r\u00e9szt, amelyek ugyan jelen voltak adott \u00e1llat \u0151seiben, de ma m\u00e1r hi\u00e1nyoznak, \u00edgy a g\u00e9nek is f\u00f6l\u00f6slegess\u00e9 v\u00e1ltak, s ennek megfelel\u0151en \u00e1ltal\u00e1ban degener\u00e1l\u00f3dtak.\n<\/p>\n

\nJ\u00f3 p\u00e9lda erre a fogzom\u00e1nc kialak\u00edt\u00e1s\u00e1ban r\u00e9sztvev\u0151 egyik feh\u00e9rj\u00e9t k\u00f3dol\u00f3 g\u00e9n, az ENAM<\/i>, ami – \u00e9s ezt m\u00e1r lehetett tudni kor\u00e1bban is<\/a> – a foggal nem rendelkez\u0151 szil\u00e1scetek eset\u00e9ben pszeudog\u00e9nesedett. Egy \u00faj tanulm\u00e1ny ugyanezt a g\u00e9nt piszk\u00e1lja meg a t\u00f6bbi olyan m\u00e9hlep\u00e9nyes eml\u0151s fajban, ahol evol\u00faci\u00f3san vagy a fogzom\u00e1nc, vagy maguk a fogak elvesz\u0151dtek. Pl. a t\u00e1pl\u00e1lkoz\u00e1sukban a nyelv\u00fckre "t\u00e1maszkod\u00f3" hangy\u00e1szokban (l\u00e1sd fenti koponya).\n<\/p>\n

\nAz eredm\u00e9nyeket az al\u00e1bbi \u00e1bra \u00f6sszes\u00edti: azokban a fajokban ahol nincs fog, vagy van, de zom\u00e1nca nincs (a faj n\u00e9v el\u0151tti kis ikonokat kell bogar\u00e1szni) az ENAM<\/i> g\u00e9nben minden esetben vagy egy korai STOP-kodon<\/a> lelhet\u0151 fel egyszer\u0171 pontmut\u00e1ci\u00f3k miatt (b\u00e1lna fajok), vagy \u00fan. frame-shift mut\u00e1ci\u00f3k<\/a> (gyakorlatilag h\u00e1rommal nem oszthat\u00f3 sz\u00e1m\u00fa b\u00e1zisp\u00e1r t\u00f6rl\u0151d\u00e9se, vagy besz\u00far\u00f3d\u00e1sa) miatt a g\u00e9n leolvas\u00e1si kerete elromlott, \u00e9rtelmetlenn\u00e9 v\u00e1lt \u00e9s sz\u00e1mos STOP kodont tartalmaz – ezt f\u00fcgg\u0151leges fekete vonalak jel\u00f6lik (a fajn\u00e9v ut\u00e1n, kis csillag el\u0151tt lev\u0151 sz\u00e1mok az \u00edgy l\u00e9trej\u00f6v\u0151 STOP kodonoknak a sz\u00e1m\u00e1t mutatj\u00e1k, az ut\u00e1na k\u00f6vetkez\u0151 sz\u00e1m pedig a homol\u00f3g szekvencia teljes hossz\u00e1t).\u00a0 \u00a0\n<\/p>\n


\n
\n<\/center><\/p>\n

\nA tudom\u00e1ny sz\u00e9ps\u00e9ge persze az, hogy nemcsak megmagyar\u00e1z megfigyel\u00e9seket, hanem seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel tesztelhet\u0151 predikci\u00f3kat is k\u00e9sz\u00edthet\u00fcnk. Jelen esetben felhaszn\u00e1lhatjuk a pszeudog\u00e9nek azon tulajdons\u00e1g\u00e1t, hogy m\u00e1r nem v\u00e9di \u0151ket a szelekci\u00f3 (nincs mi\u00e9rt v\u00e9denie, mert term\u00e9k\u00fcknek soha nem lesz semmilyen szerepe az \u00e1llat \u00e9let\u00e9ben), \u00edgy a mut\u00e1ci\u00f3k szabadon terjedhetnek el rajtuk. Mivel a "mut\u00e1l\u00f3d\u00e1s" \u00fcteme kv\u00e1zi \u00e1lland\u00f3, a mut\u00e1ci\u00f3k sz\u00e1ma \u00e9s term\u00e9szete alapj\u00e1n megj\u00f3solhatjuk, hogy kb. mikor \u00e9lhetett az adott csoport fogzom\u00e1nccal rendelkez\u0151 \u0151se. S mivel a zom\u00e1nc a legellen\u00e1ll\u00f3bb anyagok egyike, j\u00f3 es\u00e9llyel kell tal\u00e1lni a megfelel\u0151 r\u00e9tegekben olyan fossz\u00edli\u00e1kat, amelyek megfelelnek ennek a predikci\u00f3nak. A Tiktaalik<\/span> eset\u00e9ben<\/a> m\u00e1r bej\u00f6tt a hasonl\u00f3 logika, \u00edgy most a paleontol\u00f3gusokon a sor, hogy meglelj\u00e9k a sz\u00f3banforg\u00f3 \u00e1tmeneteket. \u00a0 \n<\/p>\n

\n


\nMeredith RW, Gatesy J, Murphy WJ, Ryder OA, Springer MS<\/strong> (2009) Molecular Decay of the Tooth Gene Enamelin (ENAM<\/i>) Mirrors the Loss of Enamel in the Fossil Record of Placental Mammals. PLoS Genet<\/span> 5(9)<\/span>:
\ne1000634. doi: 10.1371\/journal.pgen.1000634<\/a>.
\n<\/font><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Pszeudog\u00e9nekr\u0151l, vagyis olyan szekvenci\u00e1kr\u00f3l, amelyek egykor akt\u00edv g\u00e9neket k\u00f3doltak, de m\u00e1ra elvesztett\u00e9k funkci\u00f3jukat, m\u00e1r t\u00f6bbsz\u00f6r ejtett\u00fcnk sz\u00f3t a blogban, term\u00e9szetesen nem v\u00e9letlen\u00fcl. Mint azt m\u00e1r kor\u00e1bban is hangs\u00falyoztam, kev\u00e9s jobb bizony\u00edt\u00e9ka l\u00e9tezik az evol\u00faci\u00f3nak: ezek a g\u00e9nek olyan szervek kialak\u00edt\u00e1s\u00e1ban … Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz…. →<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-5005845","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-uncategorized"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005845","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5005845"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005845\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5005845"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=5005845"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=5005845"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}