{"id":5005840,"date":"2009-08-20T10:54:02","date_gmt":"2009-08-20T08:54:02","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2009\/08\/20\/hiv_szerkezet_es_eredet"},"modified":"2009-08-20T10:54:02","modified_gmt":"2009-08-20T08:54:02","slug":"hiv_szerkezet_es_eredet","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005840","title":{"rendered":"HIV szerkezet \u00e9s eredet"},"content":{"rendered":"<p>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/HIV_virus.jpg\" align=\"right\" hspace=\"5\" vspace=\"5\" \/>A &quot;9173 b\u00e1zisp\u00e1r a hal\u00e1l&quot; fel\u00fct\u00e9ssel ind\u00edtott poszt tal\u00e1n kell\u0151en semmitmond\u00f3 \u00e9s fel\u00fcletes, hogy sokan r\u00e1kattintsanak, ugyanakkor m\u00e9gsem teljesen pontatlan: figyelembe v\u00e9ve, hogy az<br \/>\n<a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/\">AIDS mekkora puszt\u00edt\u00e1st<\/a> v\u00e9gez a HIV fert\u0151z\u00f6ttek k\u00f6r\u00e9ben, nem t\u00falz\u00e1s azt mondani, hogy ma a vil\u00e1g nagyobb r\u00e9sz\u00e9n a fert\u0151z\u00e9s el\u00e9g gyors \u00e9s bizonyos utat jelent a hal\u00e1lba.\n<\/p>\n<p>\nA napokban\/hetekben a HIV kutat\u00e1s k\u00e9t igen fontos felfedez\u00e9st k\u00f6nyvelhetett el: egyr\u00e9szt megfejtett\u00e9k a v\u00edrus RNS genomj\u00e1nak m\u00e1sodlagos szerkezet\u00e9t, m\u00e1sr\u00e9szt bebizonyosodott, hogy a r\u00e9gi dogma, miszerint a rokon SIV v\u00edrussal fert\u0151z\u00f6tt csimp\u00e1nzok nem betegek, val\u00f3j\u00e1ban nem t\u00f6bb mint v\u00e1rosi legenda.\n<\/p>\n<p>\nA <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Human_Immunodeficiency_Virus\">HIV<\/a> egy tipikus <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Retrovirus\">retrov\u00edrus<\/a>, azaz genomja RNS alap\u00fa (a v\u00edrus r\u00e9szecsk\u00e9ben a genomi RNS l\u00e1nc k\u00e9t p\u00e9ld\u00e1nyban van jelen), \u00e9s csak a fert\u0151z\u00e9s ut\u00e1n, imm\u00e1r a sejten bel\u00fcl, \u00edr\u00f3dik \u00e1t DNS-\u00e9 (a v\u00edrus \u00e1ltal biztos\u00edtott reverz transzkript\u00e1z &#8211; RT &#8211; enzim seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel), ill. integr\u00e1l\u00f3dik a sejt saj\u00e1t genomj\u00e1ba (szint\u00e9n egy vir\u00e1lis enzim, az integr\u00e1z &#8211; IN &#8211; akt\u00edv k\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u00e9s\u00e9vel).<\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<p>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/HIV_virus.jpg\" align=\"right\" hspace=\"5\" vspace=\"5\" \/>A &quot;9173 b\u00e1zisp\u00e1r a hal\u00e1l&quot; fel\u00fct\u00e9ssel ind\u00edtott poszt tal\u00e1n kell\u0151en semmitmond\u00f3 \u00e9s fel\u00fcletes, hogy sokan r\u00e1kattintsanak, ugyanakkor m\u00e9gsem teljesen pontatlan: figyelembe v\u00e9ve, hogy az<br \/>\n<a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/\">AIDS mekkora puszt\u00edt\u00e1st<\/a> v\u00e9gez a HIV fert\u0151z\u00f6ttek k\u00f6r\u00e9ben, nem t\u00falz\u00e1s azt mondani, hogy ma a vil\u00e1g nagyobb r\u00e9sz\u00e9n a fert\u0151z\u00e9s el\u00e9g gyors \u00e9s bizonyos utat jelent a hal\u00e1lba.\n<\/p>\n<p>\nA napokban\/hetekben a HIV kutat\u00e1s k\u00e9t igen fontos felfedez\u00e9st k\u00f6nyvelhetett el: egyr\u00e9szt megfejtett\u00e9k a v\u00edrus RNS genomj\u00e1nak m\u00e1sodlagos szerkezet\u00e9t, m\u00e1sr\u00e9szt bebizonyosodott, hogy a r\u00e9gi dogma, miszerint a rokon SIV v\u00edrussal fert\u0151z\u00f6tt csimp\u00e1nzok nem betegek, val\u00f3j\u00e1ban nem t\u00f6bb mint v\u00e1rosi legenda.\n<\/p>\n<p>\nA <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Human_Immunodeficiency_Virus\">HIV<\/a> egy tipikus <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Retrovirus\">retrov\u00edrus<\/a>, azaz genomja RNS alap\u00fa (a v\u00edrus r\u00e9szecsk\u00e9ben a genomi RNS l\u00e1nc k\u00e9t p\u00e9ld\u00e1nyban van jelen), \u00e9s csak a fert\u0151z\u00e9s ut\u00e1n, imm\u00e1r a sejten bel\u00fcl, \u00edr\u00f3dik \u00e1t DNS-\u00e9 (a v\u00edrus \u00e1ltal biztos\u00edtott reverz transzkript\u00e1z &#8211; RT &#8211; enzim seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel), ill. integr\u00e1l\u00f3dik a sejt saj\u00e1t genomj\u00e1ba (szint\u00e9n egy vir\u00e1lis enzim, az integr\u00e1z &#8211; IN &#8211; akt\u00edv k\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u00e9s\u00e9vel).\n<\/p>\n<p>\nA teljes \u00e9letciklus\u00e1hoz, a v\u00edrus l\u00e9nyeg\u00e9ben 15 saj\u00e1t feh\u00e9rj\u00e9t haszn\u00e1l fel (a sz\u00e1mos gazda enzim mellett), amelyek r\u00e9szben az el\u0151bb eml\u00edtett integr\u00e1ci\u00f3t biztos\u00edt\u00f3 enzimeket k\u00f3dolj\u00e1k, r\u00e9szben azokat a feh\u00e9rj\u00e9ket (p17, p24), amelyek a viroid burk\u00e1t hozz\u00e1k l\u00e9tre a sejten k\u00edv\u00fcli \u00e9lethez, ill. ezen a burkon azokat a feh\u00e9rjel\u00e1ncokat (gp120, gp41), amelyek az \u00fajabb fert\u0151z\u00e9st majd lehet\u0151v\u00e9 teszik. \n<\/p>\n<p>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/HIV_Virus_structure.jpg\" align=\"left\" hspace=\"5\" vspace=\"5\" \/>K\u00fcl\u00f6n \u00e9rdekess\u00e9g, hogy a 15 feh\u00e9rj\u00e9t mind\u00f6ssze 9 leolvas\u00e1si keret (\u00fan. open reading frame &#8211; ORF) biztos\u00edtja, vagyis t\u00f6bb esetben is egy nagy polipeptid darabol\u00f3dik kisebbekre (gyakran m\u00e9g transzl\u00e1ci\u00f3 sor\u00e1n). Ilyen pl. a <i>gag<\/i> g\u00e9n k\u00f3dolta polipeptid, amelyb\u0151l a struktur\u00e1lis m\u00e1trix (MA), kapszid (CA), nukleokapszid (NC) \u00e9s p6 feh\u00e9rj\u00e9k alakulnak ki, az \u00fan. <i>gag-pol<\/i> g\u00e9n, amelynek term\u00e9k\u00e9b\u0151l RT \u00e9s IN mellett egy prote\u00e1z (PR) k\u00e9sz\u00fcl, valamint az <i>env<\/i> g\u00e9n, amely a gp120 \u00e9s gp41 el\u0151tt egy egy szign\u00e1l peptidet k\u00f3dol. Ut\u00f3bbinak az a feladata, hogy az \u00fan. szign\u00e1l felismer\u0151 r\u00e9szecsk\u00e9hez (signal recognition particle) kapcsol\u00f3djon, amely az eg\u00e9sz transzl\u00e1ci\u00f3s masin\u00e9ri\u00e1t, ribosz\u00f3m\u00e1st\u00f3l, mindenest\u0151l a durva endoplazmatikus retikulumba sz\u00e1ll\u00edtja, ahol azt\u00e1n sor ker\u00fcl a gp120 \u00e9s gp41 transzl\u00e1ci\u00f3j\u00e1ra. Ha pedig m\u00e1r <a href=\"http:\/\/www.mcld.co.uk\/hiv\/?q=gp120\">gp120<\/a>, akkor sz\u00f3t kell ejteni a molekula egyik jellegzetes tulajdons\u00e1g\u00e1r\u00f3l, arr\u00f3l, hogy t\u00f6bb igencsak v\u00e1ltoz\u00e9kony r\u00e9gi\u00f3val rendelkezik, ami egy\u00fattal lehet\u0151v\u00e9 is teszi, hogy az immunrendszert kij\u00e1tssza. A v\u00e1ltoz\u00e9konys\u00e1g RNS szinten van k\u00f3dolva, ugyanis a megfelel\u0151 k\u00f3dol\u00f3 r\u00e9gi\u00f3k a HIV genom legv\u00e1ltoz\u00e9konyabb r\u00e9szei k\u00f6z\u00e9 tartoz\u00f3 \u00fan. hipervari\u00e1bils r\u00e9gi\u00f3k (V1-5).\u00a0\n<\/p>\n<p><center><br \/>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/hiv1-prot_structure.jpg\" vspace=\"3\" \/><br \/>\n<\/center><\/p>\n<p>\nA m\u00e1sodlagos szerkezetet egy viszonylag \u00faj m\u00f3dszerrel, a SHAPE reaktivit\u00e1ssal hat\u00e1rozt\u00e1k meg. Megker\u00fclve a technikai r\u00e9szleteket a l\u00e9nyeg az az alacsony reaktivit\u00e1s viszonylag bonyolult m\u00e1sodlagos RNS strukt\u00fara jelenl\u00e9t\u00e9t jel\u00f6li, a magas reaktivit\u00e1s pedig ennek ellentettj\u00e9t.\n<\/p>\n<p><center><br \/>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/hiv1-rna_structure.jpg\" vspace=\"3\" \/>\u00a0<br \/>\n<\/center><\/p>\n<p>\nA szerkezet bonyolult\u00e1s\u00e1g\u00e1ban m\u00e1r m\u00e1r a <a href=\"http:\/\/www.unomaha.edu\/biology\/tapprich.html\">riboszom\u00e1lis RNS-ek\u00e9vel<\/a> vetekszik \u00e9s k\u00e9t fontos dolgot lehet rajta megfigyelni: a vari\u00e1nilis r\u00e9gi\u00f3k \u00e1ltal\u00e1ban pont n\u00e9lk\u00fcl\u00f6zik a komplex elemeket, ill. azokon a helyeken ahol a polipeptidekben k\u00f3dolt feh\u00e9rj\u00e9k hat\u00e1rai tal\u00e1lhat\u00f3k, ill. \u00f6sszetettebb feh\u00e9rj\u00e9k (pl. RT) bels\u0151 dom\u00e9njeinek a hat\u00e1rai, egy-egy helyre kis hurok t\u0171nik fel. Ezeknek minden val\u00f3sz\u00edn\u0171s\u00e9g szerint fontos szerep\u00fck van: mivel okunk van felt\u00e9telezni, hogy az RNS genom m\u00e1sodlagos szerkezete j\u00f3l t\u00fckr\u00f6zi, hogy az integr\u00e1l\u00f3dott HIV v\u00edrusr\u00f3l \u00e1t\u00edr\u00f3d\u00f3 mRNS molekul\u00e1k szerkezet milyen, ezek a hurkok megtal\u00e1lhat\u00f3ak a feh\u00e9rjeszint\u00e9zis sor\u00e1n felhszn\u00e1lt RNS-ekben is. Az ilyen struktur\u00e1lis elemek pedig megakasztj\u00e1k (ha csak r\u00f6vid id\u0151re is) a transzl\u00e1ci\u00f3t, ami az\u00e9rt l\u00e9nyeges, mert a m\u00e1r megszintetiz\u00e1lt feh\u00e9rjel\u00e1ncoknak \u00edgy van el\u00e9g idej\u00fck felvenni a helyes feh\u00e9rje konform\u00e1ci\u00f3jukat \u00e9s nem szomsz\u00e9dos dom\u00e9neket k\u00f3dol\u00f3 szekvenci\u00e1k \u00e1llnak \u00f6ssze valami zagyva egyvelegg\u00e9.\n<\/p>\n<p>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/siv_mortality.jpg\" align=\"right\" hspace=\"5\" vspace=\"5\" \/>\u00c9s akkor ugr\u00e1s a csimp\u00e1nzokhoz. Mint m\u00e1r kor\u00e1bban eml\u00edtettem, hossz\u00fa, hossz\u00fa ideig az volt az uralkod\u00f3 n\u00e9zet, hogy a majmoknak ugyan megvannak a maga lentiv\u00edrusai, k\u00f6zt\u00fck a SIV is, de <a href=\"http:\/\/blogs.discovermagazine.com\/loom\/2009\/07\/22\/aids-and-the-virtues-of-slow-cooked-science\/\">hi\u00e1ba sz\u00e1rmaztathatjuk<\/a> ezekb\u0151l az emberi HIV-t, ezek a k\u00f3rokoz\u00f3k nem okoznak az emberi AIDS-hez hasonl\u00f3 megbeteged\u00e9st emberszab\u00e1s\u00fa rokonainkban. A dolog egyetlen sz\u00e9ps\u00e9ghib\u00e1ja, hogy egyetlen szisztematikus tanulm\u00e1ny sem t\u00e1masztotta ezt al\u00e1 (igaz, nem is c\u00e1folta meg). Most kutat\u00f3k egy csoportja visszament a Gombe Nemzeti Parkba, a Jane Goodall \u00e1ltal is tanulm\u00e1nyozott csimp\u00e1nzcsoportot vette jobban szem\u00fcgyre. Az eredm\u00e9ny pedig el\u00e9g egy\u00e9rtelm\u0171en c\u00e1folja napjaink konszenzus\u00e1t. A SIV-el fert\u0151z\u00f6tt csimp\u00e1nzok kevesebb ideig \u00e9lnek, mint eg\u00e9szs\u00e9ges t\u00e1rsaik, valamint l\u00e9nyegesen kevesebb ut\u00f3dot is nemzenek. Nem mell\u00e9kesen a v\u00edrus fert\u0151z\u00e9s horizont\u00e1lis (szexu\u00e1lis \u00faton t\u00f6rt\u00e9n\u0151) \u00e1tad\u00e1sa mellett az \u00fan. vertik\u00e1lis (terhes any\u00e1b\u00f3l magzatj\u00e1ra) fert\u0151z\u0151d\u00e9st is feljegyeztek, vagyis a k\u00f3r terjed\u00e9si param\u00e9terei k\u00eds\u00e9rtetiesen hasonl\u00edtanak az emberi fert\u0151z\u00e9s\u00e9re.\n<\/p>\n<p>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200908\/SIV-CD4_count.jpg\" align=\"left\" hspace=\"5\" vspace=\"5\" \/>V\u00e9g\u00fcl, de nem utols\u00f3 sorban arra is f\u00e9ny der\u00fclt, hogy a v\u00edrus okozta fiziol\u00f3gi\u00e1s v\u00e1ltoz\u00e1sok sokba eml\u00e9keztetnek az emberi AIDS-re. A v\u00e9rk\u00e9pre jellemz\u0151 a CD4<sup>+<\/sup> T feh\u00e9rv\u00e9rsejtek sz\u00e1m\u00e1nak <a href=\"http:\/\/www.aids.org\/factSheets\/124-T-Cell-Tests.html\">dr\u00e1mai lecs\u00f6kken\u00e9se<\/a> (a baloldali \u00e1br\u00e1n a fekete oszlopok az eg\u00e9szs\u00e9ges egyedek CD4 sz\u00e1m\u00e1t jel\u00f6lik, a pirosak pedig a betegek\u00e9t), ami az immunv\u00e1lasz megrend\u00fcl\u00e9s\u00e9hez vezet \u00e9s lehet\u0151v\u00e9 teszi, hogy az eg\u00e9szs\u00e9ges emberek sz\u00e1m\u00e1ra k\u00f6nnyen t\u00fal\u00e9lhet\u0151 kisebb betegs\u00e9gek a HIV fert\u0151z\u00f6tt \u00e9let\u00e9be ker\u00fcljenek.\n<\/p>\n<p>\nA felfedez\u00e9s \u00f6nmag\u00e1ban persze nem jelenti az AIDS azonnali gy\u00f3gy\u00edt\u00e1s\u00e1t, ugyanakkor m\u00e9gsem jelent\u00e9ktelen. Mivel a v\u00edrus m\u00e1r hossz\u00fa ideje &quot;egy\u00fctt \u00e9l&quot; a csimp\u00e1nzokkal, j\u00f3 es\u00e9ly\u00fcnk van arra, hogy t\u00f6bb popul\u00e1ci\u00f3t tanulm\u00e1nyozva term\u00e9szetes rezisztenci\u00e1t (vagy legal\u00e1bb r\u00e9szleges v\u00e9detts\u00e9get) okoz\u00f3 mut\u00e1ci\u00f3kat fedez\u00fcnk fel amelyek viszont m\u00e1r t\u00e9nyleg k\u00f6zelebb vihetnek egy emberi gy\u00f3gym\u00f3d kifejleszt\u00e9s\u00e9hez. \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \n<\/p>\n<p>\n<i>(Felhaszn\u00e1lt k\u00e9pek forr\u00e1sai: <a href=\"http:\/\/humanities.uchicago.edu\/orgs\/institute\/bigproblems\/bp-aids-resources.html\">UChicago<\/a> ill. <a href=\"http:\/\/www.helpcure.com\/hiv\/hiv-virus.htm\">helpcure.com<\/a>.)<\/i>\n<\/p>\n<hr \/>\n<p><font size=\"1\"><br \/>\n<strong>Watts JM, Dang KK, Gorelick RJ, Leonard CW, Bess JW Jr, et al.<\/strong> (2009) Architecture and secondary structure of an entire HIV-1 RNA genome. <i>Nature<\/i> <strong>460<\/strong>: 711-716.<br \/>\n<strong>Keele BF, Jones JH, Terio KA, Estes JD, Rudicell RS, et al.<\/strong> (2009) Increased mortality and AIDS-like immunopathology in wild chimpanzees infected with SIVcpz. <i>Nature<\/i> <strong>460<\/strong>: 515-519.<br \/>\n<\/font><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>A &quot;9173 b\u00e1zisp\u00e1r a hal\u00e1l&quot; fel\u00fct\u00e9ssel ind\u00edtott poszt tal\u00e1n kell\u0151en semmitmond\u00f3 \u00e9s fel\u00fcletes, hogy sokan r\u00e1kattintsanak, ugyanakkor m\u00e9gsem teljesen pontatlan: figyelembe v\u00e9ve, hogy az AIDS mekkora puszt\u00edt\u00e1st v\u00e9gez a HIV fert\u0151z\u00f6ttek k\u00f6r\u00e9ben, nem t\u00falz\u00e1s azt mondani, hogy ma a vil\u00e1g &hellip; <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005840\">Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz&#8230;. <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[1],"tags":[159,111],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005840"}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5005840"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005840\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5005840"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=5005840"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=5005840"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}