{"id":5005469,"date":"2006-09-05T11:43:39","date_gmt":"2006-09-05T09:43:39","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2006\/09\/05\/a_i_tetrahymena_i_genom"},"modified":"2006-09-05T11:43:39","modified_gmt":"2006-09-05T09:43:39","slug":"a_i_tetrahymena_i_genom","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005469","title":{"rendered":"A <i>Tetrahymena<\/i> genom"},"content":{"rendered":"<p>\n<img src=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200609\/tetrahymena.jpg\" align=\"left\" hspace=\"5\" vspace=\"5\" \/>Minden \u00e9l\u0151l\u00e9ny genomja \u00f6nmag\u00e1ban is izgalmas, hiszen bizonyos szempontb\u00f3l k\u00f3dolja az illet\u0151 faj eg\u00e9sz t\u00f6rt\u00e9net\u00e9t &#8211; b\u00e1r k\u00e9ts\u00e9gtelen, hogy ennek a t\u00f6rt\u00e9netnek a dek\u00f3dol\u00e1s\u00e1hoz \u00e9s meg\u00e9rt\u00e9s\u00e9hez sok m\u00e1s genomot is ismern\u00fcnk kell. Az egysejt\u0171 eukari\u00f3t\u00e1k genetikai anyaga arr\u00f3l is mes\u00e9l, hogy milyen lehetett az \u0151si eukari\u00f3t\u00e1k genomja, m\u00e9g a <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200609\/\">t\u00f6bbsejt\u0171s\u00e9g kialakul\u00e1sa<\/a> el\u0151tt.\n<\/p>\n<p>\nMost \u00e9pp a <em>Tetrahymena thermophila<\/em> nev\u0171 csill\u00f3s egysejt\u0171 genomja ker\u00fclt sorra, \u00e9s ez is tartogatott n\u00e9h\u00e1ny meglepet\u00e9st.\n<\/p>\n<p>\nA <em>T. thermophila<\/em> abban k\u00fcl\u00f6nleges (a t\u00f6bbsejt\u0171 eukari\u00f3t\u00e1khoz hasonl\u00edtva mindenk\u00e9ppen), hogy egyszerre k\u00e9t sejtmagja is van: az egyik az \u00fan. micronucleus, amiben a DNS feltekert \u00e1llapotban van (\u00f6t kromoszom\u00e1t hoz l\u00e9tre) &#8211; ez j\u00e1tszik majd szerepet a szaporod\u00e1s sor\u00e1n. A m\u00e1sik pedig a macronucleus, amiben a DNS sokkal laz\u00e1bb konform\u00e1ci\u00f3ban van, ugyanis itt zajlanak a sejt szempontj\u00e1b\u00f3l l\u00e9tfontoss\u00e1g\u00fa RNS transzkripci\u00f3s folyamatok. A macronucleus k\u00f6zel 200 (!) kromosz\u00f3m\u00e1t tartalmaz, amelyek a micronucleus \u00f6t kromosz\u00f3m\u00e1j\u00e1b\u00f3l j\u00f6nnek l\u00e9tre, \u00fagy, hogy azok feldarabol\u00f3dnak \u00e9s a darabok pedig lem\u00e1solj\u00e1k magukat.\n<\/p>\n<p>\nA k\u00fcl\u00f6nleges szerkezet\u0171 genomhoz k\u00f3dol\u00e1sbeli csemeg\u00e9k is tartoznak, hiszen a <em>Tetrahymena<\/em> a jelek szerint a h\u00e1rom STOP kodonj\u00e1b\u00f3l (m\u00e1s fajokban a g\u00e9n k\u00f3dol\u00f3 r\u00e9sz\u00e9nek v\u00e9g\u00e9t jelz\u0151 DNS tripletb\u0151l) kett\u0151 glutamint k\u00f3dol, a harmadik pedig id\u0151nk\u00e9nt szelenociszteint (ez\u00e1ltal ez az els\u0151 olyan ismert faj, ahol mind a 64 triplet kombin\u00e1ci\u00f3 k\u00e9pes aminosavat k\u00f3dolni). Emellett a micronucleus-macronucleus \u00e1tmenet a jelek szerint nem kedvez a repetit\u00edv DNS elterjed\u00e9s\u00e9nek, hiszen a genom mind\u00f6ssze 2%-a \u00e1ll ilyesmib\u0151l (szemben az emberi genom t\u00f6bb mint fel\u00e9vel).\n<\/p>\n<p>\nA leg\u00e9rdekesebb azonban k\u00e9ts\u00e9gtelen a k\u00f3dolt g\u00e9nek sz\u00e1ma: ezt 27.000-re teszik, azaz alig kevesebbre, mint amit a hum\u00e1n genomra j\u00f3solnak (kb 33.000). Ez pedig tov\u00e1bbi s\u00falyt ad annak a n\u00e9zetnek, amely a <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200609\/\">csal\u00e1noz\u00f3k<\/a> \u00e9s <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/media\/image\/200609\/\">tengeri f\u00e9rgek genomj\u00e1nak<\/a> szekven\u00e1l\u00e1sakor m\u00e1r felmer\u00fclt, miszerint az eukari\u00f3t\u00e1k egysejt\u0171 \u0151se m\u00e1r egy meglehet\u0151sen sok g\u00e9nt k\u00f3dol\u00f3 genommal rendelkezett \u00e9s az evol\u00faci\u00f3 sor\u00e1n legink\u00e1bb ezen g\u00e9nek szab\u00e1lyoz\u00e1sa v\u00e1lt egyre \u00f6sszetettebb\u00e9.\n<\/p>\n<p>\n(A h\u00edrre <strong>Nyenyec<\/strong> kart\u00e1cs h\u00edvta fel a figyelmemet, k\u00f6sz\u00f6net \u00e9rte.)\u00a0\n<\/p>\n<hr \/>\n<p><font size=\"1\"><br \/>\n<strong>Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, et al.<\/strong> (2006) Macronuclear Genome Sequence of the Ciliate <em>Tetrahymena thermophila<\/em>, a Model Eukaryote. <em>PLoS Biol<\/em> <strong>4(9)<\/strong>: e286.<br \/>\n<\/font><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Minden \u00e9l\u0151l\u00e9ny genomja \u00f6nmag\u00e1ban is izgalmas, hiszen bizonyos szempontb\u00f3l k\u00f3dolja az illet\u0151 faj eg\u00e9sz t\u00f6rt\u00e9net\u00e9t &#8211; b\u00e1r k\u00e9ts\u00e9gtelen, hogy ennek a t\u00f6rt\u00e9netnek a dek\u00f3dol\u00e1s\u00e1hoz \u00e9s meg\u00e9rt\u00e9s\u00e9hez sok m\u00e1s genomot is ismern\u00fcnk kell. Az egysejt\u0171 eukari\u00f3t\u00e1k genetikai anyaga arr\u00f3l is mes\u00e9l, &hellip; <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=5005469\">Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz&#8230;. <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_mi_skip_tracking":false},"categories":[1],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005469"}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5005469"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5005469\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5005469"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=5005469"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=5005469"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}