{"id":15713572,"date":"2020-05-25T14:19:35","date_gmt":"2020-05-25T12:19:35","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2020\/05\/25\/hogyan_mutathatunk_ki_meg_virusokat"},"modified":"2020-05-25T14:19:35","modified_gmt":"2020-05-25T12:19:35","slug":"hogyan_mutathatunk_ki_meg_virusokat","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=15713572","title":{"rendered":"Hogyan mutathatunk ki m\u00e9g v\u00edrusokat?"},"content":{"rendered":"<p><span><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2020\/05\/sherlock_broadinstitute.jpg\" alt=\"sherlock_broadinstitute.jpg\" class=\"imgnotext\" \/><\/span><\/p>\n<p><span>Most, hogy a t\u00f6bbs\u00e9g m\u00e1r (tal\u00e1n) megbar\u00e1tkozott a PCR-alap\u00fa v\u00edrosdiagnosztika mibenl\u00e9t\u00e9vel, ideje szem\u00fcgyre vegy\u00fck, mit tartogat a j\u00f6v\u0151.<\/span><\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<p><span>A nagyobb j\u00e1rv\u00e1nyok kirobban\u00e1s\u00e1ban szerepet j\u00e1tsz\u00f3 patog\u00e9nek mindig nagy figyelmet kapnak a biol\u00f3giai kutat\u00e1sok ter\u00e9n is, mivel ez igen k\u00f6zvetlen\u00fcl \u00e9rinti a t\u00e1rsadalmunkat. A molekul\u00e1ris diagnosztikai technik\u00e1k fejl\u0151d\u00e9s\u00e9vel az ut\u00f3bbi \u00e9vtizedek folyam\u00e1n a fert\u0151z\u0151 betegs\u00e9gek diagnosztiz\u00e1l\u00e1sa, k\u00fcl\u00f6n\u00f6sen a v\u00edrusdiagnosztika, rendk\u00edv\u00fcli gyorsas\u00e1ggal fejl\u0151d\u00e9snek indult. A v\u00edrustesztek leg\u00fajabb gener\u00e1ci\u00f3ja az \u00fan. CRISPR-rendszeren alapul &#8211; ezeknek a m\u0171k\u00f6d\u00e9si elv\u00e9t igyekszik a poszt al\u00e1bb \u00f6sszefoglalni, kit\u00e9rve arra, hogy ezt hogyan lehet specifikusan a SARS-CoV-2 v\u00edrus detekt\u00e1l\u00e1s\u00e1ra haszn\u00e1lni. (Ugyanakkor, fontos hozz\u00e1 tenni, hogy ellent\u00e9tben a hossz\u00fa ideje \u00e9s sz\u00e9les k\u00f6rben haszn\u00e1lt, PCR-alap\u00fa diagnosztik\u00e1val, az ilyen, CRISPR-alap\u00fa rendszerek csak <a href=\"https:\/\/sherlock.bio\/sherlock-biosciences-receives-fda-emergency-use-authorization-for-crispr-sars-cov-2-rapid-diagnostic\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">nemr\u00e9g kaptak<\/a> el\u0151sz\u00f6r enged\u00e9lyt klinikai felhaszn\u00e1l\u00e1sra.)<\/span><\/p>\n<h2><span>A CRISPR rendszer<\/span><\/h2>\n<p><span>Napjainkban a legprec\u00edzebbnek kiki\u00e1ltott g\u00e9ntechnol\u00f3giai m\u00f3dszer a CRISPR-alap\u00fa genomszerkeszt\u00e9s, mely lehet\u0151v\u00e9 teszi az \u00f6r\u00f6k\u00edt\u0151anyag szekvencia-specifikus megv\u00e1ltoztat\u00e1s\u00e1t. Ez m\u00e1r \u00f6nmag\u00e1ban is figyelemrem\u00e9lt\u00f3 lenne, de az ut\u00f3bbi \u00e9vekben egyre-m\u00e1sra jelentek meg ennek a sokr\u00e9t\u0171 molekul\u00e1ris rendszerek, amelyek k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 term\u00e9szetes CRISPR rendszereket igyekeznek egy\u00e9b c\u00e9lokra, p\u00e9ld\u00e1ul v\u00edrusdiagnosztik\u00e1ra is haszn\u00e1lni.<\/span><\/p>\n<p><span> A <a href=\"https:\/\/hu.wikipedia.org\/wiki\/CRISPR\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">CRISPR alapelve<\/a> a sejtek idegen DNS (v\u00edrus vagy plazmid) ellen kialak\u00edtott v\u00e9delmi rendszer\u00e9n alapszik. A legt\u00f6bbet emlegetett \u00e9s haszn\u00e1lt CRISPR rendszert a <em>Streptococcus pyogenes<\/em> nev\u0171 bakt\u00e9riumb\u00f3l sz\u00e1rmazik \u00e9s l\u00e9nyeg\u00e9ben a sejt egyfajta \u00f6nv\u00e9delmi mechanizmusak\u00e9nt m\u0171k\u00f6dik, ahol egyes Cas (<strong>C<\/strong>RISPR <strong>as<\/strong>sociated genes) feh\u00e9rj\u00e9k felismerik \u00e9s feldarabolj\u00e1k az idegen DNS-t (ami pl. a bakt\u00e9riumot megt\u00e1mad\u00f3 f\u00e1gb\u00f3l sz\u00e1rmazhat), majd egy fajra jellemz\u0151 &#8220;kit\u00f6lt\u0151&#8221; (spacer) szekvencia m\u00f6g\u00e9 \u00e9p\u00edtik be a genomi DNS-be. Ahogy ez a jelens\u00e9g ism\u00e9tl\u0151dik fokozatosan kialakul egy olyan r\u00e9sz a genomban, ahol az ism\u00e9tl\u0151d\u0151 &#8220;kit\u00f6lt\u0151&#8221; szekvenci\u00e1k k\u00f6zt a kor\u00e1bbi f\u00e1g-t\u00e1mad\u00e1sok &#8220;szekvencia-eml\u00e9knyoma&#8221; lelehet\u0151 fel. Az \u00edgy keletkez\u0151 szekvenci\u00e1t h\u00edvj\u00e1k CRISPR-nek (<em>clustered <\/em><\/span><em>regularly interspaced short palindromic repeats<\/em><span>). Ezen szekvencia alapj\u00e1n keletkeznek a sejtben azok a r\u00f6vid, ir\u00e1ny\u00edt\u00f3 gRNS (guide RNS) molekul\u00e1k, amelyek seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel a sejt felismeri, ha \u00fajb\u00f3l ugyanannak a f\u00e1gt\u00e1mad\u00e1snak az alany\u00e1v\u00e1 v\u00e1lik. A gRNS szekvenci\u00e1ja ugyanis megfeleltethet\u0151 lesz a f\u00e1g DNS-\u00e9nek, \u00e9s ezt felhaszn\u00e1lva a DNS has\u00edt\u00f3 (endonukle\u00e1z) aktivit\u00e1ssal rendelkez\u0151 tov\u00e1bbi Cas feh\u00e9rj\u00e9k (a\u00a0<em>S. pyogenes\u00a0<\/em>eset\u00e9ben a Cas9)\u00a0elhas\u00edtja az idegen DNS-t,\u00a0 ezzel is g\u00e1tolva a fert\u0151z\u00e9st. (Josiane E. et al 2010) <\/span><\/p>\n<p><span>A modern g\u00e9ntechonol\u00f3gia ezt a rendszert haszn\u00e1lja ki, pontosabban az, hogy az endonukle\u00e1z aktivit\u00e1ssal rendelkez\u0151 Cas feh\u00e9rj\u00e9k a megfelel\u0151 gRNS-ek seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel b\u00e1rmelyik fajban (\u00e9s nem csak bakt\u00e9riumokban, hanem eukari\u00f3t\u00e1kban is), elvileg tetsz\u0151leges DNS-t szekvenciaspecifikusan tudnak has\u00edtani. Ez a rendszer egyszer\u0171bb, k\u00f6nnyebben \u00e9s pontosabban megtervezhet\u0151, az eddig haszn\u00e1lt genomszerkeszt\u00e9si m\u00f3dszerekn\u00e9l , ez\u00e9rt is tudott gyorsan elterjedni (Haifeng W. et al, 2016).<\/span><\/p>\n<p><center><iframe loading=\"lazy\" width=\"560\" height=\"315\" src=\"https:\/\/www.youtube.com\/embed\/Yv5BjGHPFL4\" frameborder=\"0\" allow=\"accelerometer; autoplay; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture\" allowfullscreen=\"\"><\/iframe><\/center><\/p>\n<h2><span><\/span><\/h2>\n<h2><span>CRISPR-Cas rendszer felhaszn\u00e1l\u00e1sa a v\u00edrusdiagnosztik\u00e1ban.<\/span><\/h2>\n<p><span>A\u00a0<em>S. pyogenes<\/em>\u00a0Cas9-alap\u00fa\u00a0 CRISPR-rendszer\u00e9re \u00e9p\u00fcl\u0151 rendszerek azonban csak egy szelet\u00e9t jelentik azoknak az \u00faj kezel\u00e9si elj\u00e1r\u00e1soknak, amelyek a k\u00f6zelj\u00f6v\u0151ben mindennapjaink r\u00e9szeiv\u00e9 v\u00e1lhatnak. Mivel ez a rendszer DNS has\u00edt\u00e1sra &#8220;szakosodott&#8221;, klinikai alkalmaz\u00e1s\u00e1n\u00e1l is els\u0151sorban olyan retrov\u00edrusok (pl. HIV) j\u00f6hetnek c\u00e9lba, amelyek a saj\u00e1t genetikai anyagukat a sejtek genomj\u00e1ba m\u00e1solj\u00e1k bele. Ilyenkor a Cas9 feh\u00e9rj\u00e9t a v\u00edrus DNS-\u00e9t c\u00e9lz\u00f3 gRNS-ekkel juttatj\u00e1k be a fert\u0151z\u00f6tt sejtekbe, ami el\u0151seg\u00edt a v\u00edrus inaktiv\u00e1l\u00e1s\u00e1t (Haifeng W. et al, 2016). <\/span><\/p>\n<p><span>Azonban tov\u00e1bbi, egy\u00e9b bakt\u00e9riumokban le\u00edrt CRISPR-rendszerek (\u00e9s az azokhoz tartoz\u00f3 Cas feh\u00e9rj\u00e9k) bevon\u00e1s\u00e1val olyan v\u00edrusdetekt\u00e1l\u00e1sra alkalmas gyorsteszteket is l\u00e9trehoztak, amelyek gy\u00f6keresen \u00e1talak\u00edthatj\u00e1k az epidemiol\u00f3giai megfigyel\u00e9si rendszereket (Kostyusheva, A., et al, 2020). A legink\u00e1bb bev\u00e1lt technik\u00e1k, a <strong>SHERLOCKv2 (specific high sensitivity enzymatic reporter unlocking version 2)\u00a0<\/strong>\u00e9s <strong>DETECTR (DNA endonuclease targeted CRISPR\u00a0<i>trans<\/i>\u00a0reporter)<\/strong> fant\u00e1zian\u00e9vre hallgat\u00f3k, amelyek lehet\u0151v\u00e9 teszik a patog\u00e9n nukleinsavak gyors kimutat\u00e1s\u00e1t rendk\u00edv\u00fcl kis mennyis\u00e9g\u00e9ben is (Kocak&amp;Gersbach, 2018). El\u0151bbi a Cas13, ut\u00f3bbi pedig a Cas12 endonukle\u00e1zok aktivit\u00e1s\u00e1nak kihaszn\u00e1l\u00e1s\u00e1n alapul.\u00a0<\/span><\/p>\n<h3><span>A DETECTR rendszer<\/span><\/h3>\n<p><span><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2020\/05\/detectr.jpg\" alt=\"detectr.jpg\" class=\"imgnotext open-in-modal\" \/><\/span><\/p>\n<p><span>A CRISPR-Cas csal\u00e1don bel\u00fcl a Cas12 egy RNS-vez\u00e9relt DN\u00e1z, amelyben a c\u00e9l-felismer\u00e9s ut\u00e1n egy aspecifikus egysz\u00e1l\u00fa DNS (ssDNS) has\u00edt\u00f3 k\u00e9pess\u00e9g jelenik meg. Ezt kihaszn\u00e1lva tervezhet\u0151k olyan ssDNS-riporterek, amelyek (aspecikus) has\u00edt\u00e1sa vagy egy \u00e9rz\u00e9keny detektor seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel \u00e9szlelhet\u0151 (pl. fluoreszcencia megjelen\u00e9se) vagy l\u00e1that\u00f3 jelet hoz l\u00e9tre egy pap\u00edrszalagon a later\u00e1lis \u00e1raml\u00e1sos (lateral-flow) m\u00f3dszer haszn\u00e1lat\u00e1val (hasonl\u00f3an a m\u00e1r ismertebb ellenanyag gyorstesztekhez) (Chen \u00e9s mtsai., 2018). <\/span><\/p>\n<p><span>Az eddigi tesztel\u00e9sek sor\u00e1n a CRISPR-Cas12 alap\u00fa kimutat\u00e1si elj\u00e1r\u00e1st egy olyan LOD (limit of detection) \u00e9rt\u00e9k jellemzi, amely alacsonyabb, mint ami v\u00edrus jelenlegi klinikai mint\u00e1kban t\u00f6rt\u00e9n\u0151 kimutat\u00e1s\u00e1hoz sz\u00fcks\u00e9ges minim\u00e1lis szint. A CRISPR-diagnosztikai m\u00f3dszer itt bemutatott f\u0151 el\u0151nye a hordozhat\u00f3s\u00e1g \u00e9s az alacsony k\u00f6lts\u00e9gek (1-2 USD \/ reakci\u00f3).\u00a0<\/span><\/p>\n<h3><span>A SHERLOCK rendszer<\/span><\/h3>\n<p><span><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2020\/05\/sherlock.jpg\" alt=\"sherlock.jpg\" class=\"imgnotext open-in-modal\" \/><\/span><\/p>\n<p><span>A SHERLOCK t\u00f6bb CRISPR-rendszerhez is adopt\u00e1lhat\u00f3 (\u00edgy a Cas12-h\u00f6z is), de el\u0151sz\u00f6r a Cas13 kapcs\u00e1n \u00edrt\u00e1k le (Gootenberg \u00e9s mtsai., 2017). Ut\u00f3bbi egy RNS-t felismer\u0151 Cas nukle\u00e1z, amelyn\u00e9l a c\u00e9l megk\u00f6t\u00e9se szint\u00e9n induk\u00e1l egy aspecikfikus (kollater\u00e1lis) nukle\u00e1z aktivit\u00e1st, aminek &#8211; ebben az esetben &#8211; a k\u00f6rnyez\u0151 RNS-ek l\u00e1tj\u00e1k k\u00e1r\u00e1t. Ennek megfelel\u0151en &#8211; ebben a rendszerben &#8211; a riporter a DETECTR-hoz hasonl\u00f3 logik\u00e1j\u00fa, de RNS-alap\u00fa molekula kell legyen. <\/span><\/p>\n<p><span>B\u00e1r l\u00e1tsz\u00f3lag a klasszikus SHERLOCK-rendszer el\u0151nye lehetne az RNS v\u00edrusok (p\u00e9ld\u00e1ul koronav\u00edrusok) eset\u00e9ben, hogy k\u00f6zvetlen\u00fcl az RNS-t k\u00e9pes kimutatni, a val\u00f3s\u00e1gban az \u00e9rz\u00e9kenys\u00e9g megn\u00f6vel\u00e9se miatt sz\u00fcks\u00e9g van a mint\u00e1kban lev\u0151 nukleinsavak sokszoros\u00edt\u00e1s\u00e1ra, ami \u00e1ltal\u00e1ban DNS-alap\u00fa folyamat. \u00cdgy, a Cas13-alap\u00fa SHERLOCK eset\u00e9ben sz\u00fcks\u00e9g van egy k\u00f6ztes l\u00e9p\u00e9sre, amikor a felsokszorozott DNS-t vissza\u00edrj\u00e1k RNS-\u00e9 (IVT &#8211; in vitro transzkripci\u00f3). Ez pedig kicsit f\u00f6l\u00f6sleges l\u00e9p\u00e9s, ez\u00e9rt is t\u00e9rtek \u00e1t a m\u00f3dszer kifejleszt\u0151i szint\u00e9n a Cas12-alap\u00fa detekt\u00e1l\u00e1sra (Gootenberg \u00e9s mtsai., 2018).\u00a0<\/span>\u00a0<\/p>\n<h2><span>Koronav\u00edrus detekt\u00e1l\u00e1sa CRISPR haszn\u00e1lat\u00e1val <\/span><\/h2>\n<p><span>A SARS-CoV-2-n\u00e9l tapasztalt rendk\u00edv\u00fcl gyors vil\u00e1gszint\u0171 terjed\u00e9s sebess\u00e9g\u00e9nek cs\u00f6kkent\u00e9s\u00e9re, a v\u00edrus elleni hat\u00e9kony v\u00e9dekez\u00e9s \u00e9rdek\u00e9ben fontos, hogy a fert\u0151z\u00e9st min\u00e9l gyorsabban, lehet\u0151leg minden fert\u0151z\u00f6tt eset\u00e9ben \u00e9s min\u00e9l koraibb f\u00e1zisban ki tudjuk mutatni. A CRISPR-Cas rendszerek a szekvenciaspecifit\u00e1suk k\u00f6vetkezt\u00e9ben megfelel\u0151ek lehetnek ilyen diagnosztikai c\u00e9lokra, r\u00e1ad\u00e1sul k\u00e9t fontos el\u0151ny\u00fck van a jelenlegi detekt\u00e1l\u00e1si rendszerekkel szemben: gyorsabbak \u00e9s l\u00e9nyegesen olcs\u00f3bbak (ugyanakkor, ahogy m\u00e1r eml\u00edt\u00e9sre ker\u00fclt, <a href=\"https:\/\/sherlock.bio\/sherlock-biosciences-receives-fda-emergency-use-authorization-for-crispr-sars-cov-2-rapid-diagnostic\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">egyel\u0151re egyetlen teszt-kit kapta meg<\/a> a megfelel\u0151 klinikai min\u0151s\u00edt\u00e9st).\u00a0\u00a0<\/span><\/p>\n<p><span><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2020\/05\/comparison_corona_detection_protocols.png\" alt=\"comparison_corona_detection_protocols.png\" class=\"imgnotext open-in-modal\" \/><\/span><\/p>\n<p>\u00a0<\/p>\n<p><span>A kor\u00e1bbiak alapj\u00e1n nem volt k\u00e9ts\u00e9ges, hogy mind a DETECTR, mind a Cas12-alap\u00fa SHERLOCK rendszerek alkalmasak lehetne a SARS-CoV-2 detekt\u00e1l\u00e1s\u00e1ra, \u00edgy m\u00e1r febru\u00e1rban megindult a tesztek fejleszt\u00e9se \u00e9s az\u00f3ta is folyamatos. Hogy min\u00e9l gyorsabb \u00e9s olcs\u00f3bb legyen a detekt\u00e1l\u00e1s a legt\u00f6bb aktu\u00e1lisan fejlesztett teszt nem fluoreszcens-alap\u00fa, hanem a klasszikusabb later\u00e1lis \u00e1raml\u00e1s technol\u00f3gi\u00e1t haszn\u00e1lja \u00e9s az eredm\u00e9nyeket egy egyszer\u0171 sz\u00ednreakci\u00f3 jelzi ki.<\/span><\/p>\n<p><span>Az \u00e9rz\u00e9kenys\u00e9g n\u00f6vel\u00e9se miatt (hiszen van, amikor csak n\u00e9h\u00e1ny v\u00edrus partikulum lesz az orrgarat-mint\u00e1kban), a mintael\u0151k\u00e9sz\u00edt\u00e9s a v\u00edrusgenom sokszoros\u00edt\u00e1s\u00e1val kell induljon. Ehhez el\u0151sz\u00f6r a vir\u00e1lis RNS genomb\u00f3l reverz transzkripci\u00f3 r\u00e9v\u00e9n DNS-t k\u00e9sz\u00edtenek \u00e9s ezt k\u00f6veti a sokszoros\u00edt\u00f3 l\u00e1ncreakci\u00f3 egy k\u00fcl\u00f6nleges form\u00e1ja, ami a h\u0151m\u00e9rs\u00e9klet folyamatos v\u00e1ltoztat\u00e1sa n\u00e9lk\u00fcl is m\u0171k\u00f6dik, az \u00fan. hurok-medi\u00e1lt isoterm\u00e1lis amplifik\u00e1ci\u00f3 (loop-mediated isothermal amplification &#8211; LAMP). Ez a reakci\u00f3 \u00e1lland\u00f3 (60\u201365 \u00b0C) h\u0151m\u00e9rs\u00e9kleten lezajlik, speci\u00e1lis DNS-polimer\u00e1z seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel, \u00edgy nincs sz\u00fcks\u00e9g a hagyom\u00e1nyos PCR-g\u00e9pre, csak egy egyszer\u0171 v\u00edzf\u00fcrd\u0151re, vagy szobai meleg\u00edt\u0151re (Notomi, et al., 2000). <\/span><\/p>\n<p><span>Amennyiben a levett mint\u00e1ban jelen volt a v\u00edrus, a koronav\u00edrus szekvenci\u00e1jra tervezett gRNS seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel a Cas12 \u00e9szleli az egyez\u00e9st \u00e9s elhas\u00edt egy egyszer\u0171 szerkezet\u0171 ssDNS riporter molekul\u00e1t, ezzel jelezve a fert\u0151z\u00e9st (<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41587-020-0513-4\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Broughton et al., 2020<\/a>; <a href=\"https:\/\/www.biorxiv.org\/content\/10.1101\/2020.02.29.971127v1\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Curti, et al., 2020<\/a>).\u00a0<\/span>\u00a0<\/p>\n<p><span><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2020\/05\/sars-cov-2-detectr.png\" alt=\"sars-cov-2-detectr.png\" class=\"imgnotext open-in-modal\" \/><\/span><\/p>\n<p><span>A lateral-flow m\u00f3dszer ennek az ssDNS-nek a detekt\u00e1l\u00e1s\u00e1ra haszn\u00e1lhat\u00f3. A reakci\u00f3elegybe bel\u00f3gatott sz\u0171r\u0151pap\u00edr-jelleg\u0171 szalag a kapill\u00e1ris hat\u00e1s seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel elkezdi mag\u00e1ba sz\u00edvni a folyad\u00e9kot \u00e9s vele az ssDNS-riportert is. Az ssDNS egyik oldal\u00e1ra egy nagym\u00e9ret\u0171 biotin molekul\u00e1t kapcsolnak, a m\u00e1sik v\u00e9g\u00e9re pedig egy FITC nev\u0171 molekul\u00e1t &#8211; a l\u00e9nyeg, hogy mindegyiket nagyon specifikusan meg tudjuk k\u00f6ti. A biotint p\u00e9ld\u00e1ul sztreptavidinnal, ami a lateral-flow cs\u00edkok alj\u00e1hoz k\u00f6zel tal\u00e1lhat\u00f3, ez\u00e9rt a biotin \u00e9s vele kapcsolatban lev\u0151 r\u00e9szek csak eddig fognak v\u00e1ndorolni. Ha nem t\u00f6rt\u00e9nt has\u00edt\u00e1s a Cas12 \u00e1ltal, akkor a FITC is, k\u00fcl\u00f6nben az tov\u00e1bb tud haladni a szalag mikrokapill\u00e1risaiban.<\/span><\/p>\n<p><span>A detekt\u00e1l\u00e1s sor\u00e1n megjelen\u0151 cs\u00edkokat a bel\u00f3gat\u00e1s ut\u00e1n 2-3 perccel a FITC-et felismer\u0151, arany nanor\u00e9szecsk\u00e9k hozz\u00e1k majd l\u00e9tre a hozz\u00e1juk kapcsolt ellenanyagok seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel. Ha nem volt Cas12-has\u00edt\u00e1s (vagyis nem volt jelen a v\u00edrus), a szalag alj\u00e1hoz k\u00f6zel, ha pedig jelen volt a v\u00edrus, att\u00f3l t\u00e1volabb jelennek meg elsz\u00ednez\u0151d\u00e9sek.\u00a0<\/span><span><\/span><\/p>\n<p><span><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2020\/05\/sars-cov-2-detectr-2.png\" alt=\"sars-cov-2-detectr-2.png\" class=\"imgnotext open-in-modal\" \/><\/span><\/p>\n<p><span>Ha az amerikai gy\u00f3gyszerhat\u00f3s\u00e1g \u00e1ltal j\u00f3v\u00e1hagyott SHERLOCK-rendszer bev\u00e1ltja a hozz\u00e1 f\u0171z\u00f6tt rem\u00e9nyeket, akkor sz\u00e1m\u00edthatunk r\u00e1, hogy a k\u00f6zelj\u00f6v\u0151ben hasonl\u00f3 rendszerek igen gyorsan elterjedhetnek &#8211; b\u00e1r val\u00f3sz\u00edn\u0171s\u00edthet\u0151, hogy egyel\u0151re ink\u00e1bb csak a klasszikusabb, PCR-alap\u00fa v\u00edrusdiagnosztika kieg\u00e9sz\u00edt\u0151jek\u00e9nt, mintsem helyettes\u00edt\u0151jek\u00e9nt.\u00a0<\/span><\/p>\n<p>(<em>A poszt Kasz\u00e1s Di\u00e1na essz\u00e9je alapj\u00e1n k\u00e9sz\u00fclt. A bor\u00edt\u00f3k\u00e9p a <a href=\"https:\/\/www.broadinstitute.org\/news\/sherlock-team-advances-its-crispr-based-diagnostic-tool\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Broad Institute oldal\u00e1r\u00f3l<\/a> sz\u00e1rmazik, a lateral-flow m\u0171k\u00f6d\u00e9si mechanizmus\u00e1t bemutat\u00f3 pedig <a href=\"https:\/\/www.milenia-biotec.com\/en\/crispr-tools-techniques\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">a MileniaBiotec oldalr\u00f3l<\/a>.)<\/em><\/p>\n<hr \/>\n<p><span size=\"1\" style=\"font-size: xx-small;\">Broughton JP, Deng X, Yu G, Fasching CF, Singh J et al., <strong>2020,\u00a0<\/strong><span><strong>CRISPR\u2013Cas12-based detection of SARS-CoV-2.<\/strong>\u00a0<\/span>Nat Biotechnol<span>\u00a0\u00a0https:\/\/doi.org\/10.1038\/s41587-020-0513-4<\/span><br \/> Curti L, Pereyra-Bonnet F, Gimenez CA, <strong>2020, An ultrasensitive, rapid, and portable coronavirus SARS-CoV-2 sequence detection method based on CRISPR-Cas12<\/strong>, bioRxiv<\/span><span size=\"1\" style=\"font-size: xx-small;\"><br \/> Gootenberg JS, Abudayyeh OO, Lee JW, Essletzbichler P, Dy AJ, et al.,\u00a0<b>2017, Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a\/C2c2.<\/b> Science 356, 438\u2013442<br \/> Gootenberg JS, Abudayyeh OO, Kellner MJ, Joung J, Collins JJ and Zheng F,\u00a0<b> 2018, Multiplexed and portable nucleic acid detection platform with Cas13, Cas12a, and Csm6<\/b> Science 360, 439-444<br \/> Wang H,Russa ML,\u00a0Qi LS,<strong> 2016, CRISPR\/Cas9 in Genome Editing and Beyond, <\/strong>Annual Review of Biochemistry, 85:227-264<br \/>Chen JS, Ma E, Harrington LB, Da Costa M, Tian X, et al., <strong>2018, CRISPR-Cas12a target binding unleashes indiscriminate single-stranded DNase activity<\/strong>, Science 360, 436-439<br \/> Garneau JE, Dupuis M-\u00c8, Villion M, Romero DA, Barrangou R, et al., <strong>2010, The CRISPR\/Cas bacterial immune system cleaves bacteriophage and plasmid DNA, <\/strong>Nature, 468, 67\u201371<br \/> Kocak DD, Gersbach CA <b>2018,From CRISPR scissors to virus sensors<\/b> Nature 557, 168-169<br \/> Kostyusheva, A.; Brezgin, S.; Babin, Y.; Vasil&#8217;eva, I.; Kostyushev, D.; Chulanov, V., <strong>2020<\/strong>, <strong>CRISPR-Cas Systems for Diagnosing Infectious Diseases<\/strong>. Preprints <br \/> M.A. Marra, S.J. Jones, C.R. Astell, R.A. Holt, A. Brooks-Wilson, Y.S. Butterfield, et al., <strong>2003, The Genome sequence of the SARS-associated coronavirus,<\/strong> Science, 300 (2003), pp. 1399-1404<br \/> Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., et al., <strong>2000, Loop-mediated isothermal amplification of DNA<\/strong>. Nucleic Acids Res., 2000, 28(12), e63<br \/>Wan Beom Park, Nak-Jung Kwon, Su-Jin Choi, Chang Kyung Kang, Pyoeng Gyun Choe, Jin Yong Kim, Jiyoung Yun, Gir-Won Lee, Moon-Woo Seong, Nam Joong Kim, Jeong-Sun Seo, and Myoung-don Oh,<strong> 2020 Virus Isolation from the First Patient with SARS-CoV-2 in Korea, <\/strong>The Korean Academy of Medical Sciences.<br \/> World Health Organization (WHO), <strong>2003, Summary table of SARS cases by country, 1 November 2002\u20137 August 2003, <\/strong>Wkly. Epidemiol. Rec., 78 (2003), pp. 310-311<\/p>\n<p> <\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Most, hogy a t\u00f6bbs\u00e9g m\u00e1r (tal\u00e1n) megbar\u00e1tkozott a PCR-alap\u00fa v\u00edrosdiagnosztika mibenl\u00e9t\u00e9vel, ideje szem\u00fcgyre vegy\u00fck, mit tartogat a j\u00f6v\u0151.<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[1],"tags":[32,191,152],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/15713572"}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=15713572"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/15713572\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=15713572"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=15713572"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=15713572"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}