{"id":11828435,"date":"2016-10-22T09:12:33","date_gmt":"2016-10-22T07:12:33","guid":{"rendered":"https:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2016\/10\/22\/kigyolab_d_evolucio"},"modified":"2016-10-22T09:12:33","modified_gmt":"2016-10-22T07:12:33","slug":"kigyolab_d_evolucio","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=11828435","title":{"rendered":"K\u00edgy\u00f3l\u00e1b (d)evol\u00faci\u00f3"},"content":{"rendered":"<p><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2016\/10\/zrs_snake_3.jpeg\" alt=\"zrs_snake_3.jpeg\" class=\"imgnotext\" \/><\/p>\n<p>Ha van olyan t\u00e9ma, ami igaz\u00e1n k\u00f6zel \u00e1ll a sz\u00edvemhez, a v\u00e9gtagok evol\u00faci\u00f3ja biztos az. M\u00e1r a blog <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2005\/10\/31\/kigyonak_labso_csokeveny_szervek_1\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">legeslegels\u0151 posztja<\/a> is ezzel a t\u00e9m\u00e1val foglalkozott, n\u00e9vszerint mik\u00e9ppen veszt(h)ett\u00e9k el a k\u00edgy\u00f3k a v\u00e9gtagjaikat az evol\u00faci\u00f3 sor\u00e1n, de val\u00f3sz\u00edn\u0171leg egyik legt\u00f6bbet (\u00f6n)hivatkozott posztom is kapcsol\u00f3d\u00f3, m\u00e9gpedig <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2006\/07\/31\/kezunk_labunk_fejlodese\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">a v\u00e9gtagok fejl\u0151d\u00e9sbiol\u00f3gi\u00e1j\u00e1val foglalkoz\u00f3<\/a>. Sz\u00f3val tulajdonk\u00e9ppen t\u00f6rv\u00e9ynszer\u0171en\u00a0visszakanyarodunk itt a t\u00e9m\u00e1hoz \u00e9s a mai poszt tal\u00e1n csak az\u00e9rt k\u00fcl\u00f6nleges, mert annak az omin\u00f3zus els\u0151 posztnak lesz egy fantasztikusan \u00e9rdekes folytat\u00e1sa.<\/p>\n<p><!--more-->Ahogy anno, abban az <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2005\/10\/31\/kigyonak_labso_csokeveny_szervek_1\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">omin\u00f3zus els\u0151 posztban<\/a> \u00edrtam, a k\u00edgy\u00f3k h\u00e1ts\u00f3 v\u00e9gtagjainak elveszt\u00e9se m\u00f6g\u00f6tt legink\u00e1bb az gyan\u00edthat\u00f3, hogy a v\u00e9gtagfejl\u0151d\u00e9sben <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2006\/07\/31\/kezunk_labunk_fejlodese\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">oly fontos<\/a> <em>Sonic hedgehog<\/em> (<em>Shh<\/em>) g\u00e9n ZRS nev\u0171, v\u00e9gtag-specifikus enhancere k\u00edgy\u00f3kban (illetve l\u00e1batlan gy\u00edkokban) \u00fagy t\u0171nik, elt\u0171nt. Ezt akkor m\u00e9g nem direkt genomszekvencia adatok alapj\u00e1n lehetett kijelenteni, hanem kiss\u00e9 indirekt m\u00f3don szekvenciahasonl\u00f3s\u00e1got m\u00e9r\u0151 metodol\u00f3gia alapj\u00e1n (l\u00e1sd\u00a0<a href=\"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Southern_blot\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Southern blot<\/a>), de az\u00e9rt logikusnak t\u0171nt, f\u0151leg, hogy a ZRS kit\u00f6rl\u00e9se egerekben is roppant satnya v\u00e9gtagokat eredm\u00e9nyezett.<\/p>\n<p>M\u00e1ra azonban v\u00e1ltozott a helyzet, rengeteg gerinces faj, k\u00f6zt\u00fck sz\u00e1mos k\u00edgy\u00f3 genomj\u00e1t t\u00f6bb-kevesebb pontoss\u00e1ggal ismerj\u00fck \u00e9s ami &#8211; mint mindj\u00e1rt l\u00e1tni fogjuk &#8211; legal\u00e1bb ennyire fontos, m\u00e9g gyorsabban \u00e9s pontosabban tudunk a genomba &#8220;bele\u00edrni&#8221;.<\/p>\n<p>A n\u00e9gyl\u00e1b\u00faak csoportj\u00e1ba (Tetrapoda) tartoz\u00f3 gerincesek genomj\u00e1t\u00a0\u00f6sszevetve, ma m\u00e1r j\u00f3l l\u00e1that\u00f3, hogy ugyan a k\u00edgy\u00f3k eset\u00e9ben is fellelhet\u0151 a ZRS helye, de annak bizonyos, m\u00e1s fajokban konzerv\u00e1lt szekvencia-elemei hi\u00e1nyoznak. M\u00e1rpedig ezek hi\u00e1ny\u00e1ban a k\u00edgy\u00f3-ZRS k\u00e9ptelen elv\u00e9gezni a funkci\u00f3j\u00e1t. Hogy ezt mi\u00e9rt merem ekkora bizonyoss\u00e1ggal kijelenteni? Mert megn\u00e9zt\u00e9k: az \u00faj CRISPR-alap\u00fa genomszerkeszt\u00e9si technol\u00f3gi\u00e1t alkalmazva most nem egyszer\u0171en ki\u00fct\u00f6tt\u00e9k az eg\u00e9r ZRS-t, hanem <em>helyettes\u00edtett\u00e9k\u00a0<\/em>sz\u00e1mos m\u00e1s Tetrapoda ZRS-el.\u00a0<\/p>\n<p>Ez alapj\u00e1n pedig l\u00e1that\u00f3, hogy az eml\u0151s ZRS-ek (nem csak ember, de lajh\u00e1r, vagy delfin is) t\u00f6k\u00e9letesen ugyanazt a m\u0171k\u00f6d\u00e9st v\u00e1ltott\u00e1k ki, mint eg\u00e9r megfelel\u0151j\u00fck: a <em>Shh\u00a0<\/em>a fejl\u0151d\u0151 v\u00e9gtagbimb\u00f3 h\u00e1ts\u00f3, \u00fan. ZPA r\u00e9gi\u00f3j\u00e1ban (ha nem vil\u00e1gos, hogy az mi, akkor <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2006\/07\/31\/kezunk_labunk_fejlodese\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">itt lehet elolvasni<\/a>)\u00a0fejez\u0151dik ki, \u00e9s kifog\u00e1stalan v\u00e9gtagot hoz l\u00e9tre. De m\u00e9g olyan t\u00e1voli rokon Tetrapoda fajok ZRS-e eset\u00e9ben is m\u0171k\u00f6dik a tr\u00fckk, mint egy bojtos\u00fasz\u00f3s hal! Csak k\u00edgy\u00f3 ZRS-ek eset\u00e9ben nem megy: &#8220;modernebb&#8221; k\u00edgy\u00f3k, mint a kobr\u00e1k ZRS-\u00e9vel egy\u00e1ltal\u00e1n nem, a fenot\u00edpus pont olyan lesz, mintha ki\u00fct\u00f6tt\u00fck volna a ZRS-t, evol\u00faci\u00f3san &#8220;\u0151sibb&#8221; k\u00edgy\u00f3fajok (pl. bo\u00e1k) eset\u00e9ben pedig egy eg\u00e9sz kicsit. (R\u00e9szben valszleg ezzel is magyar\u00e1zhat\u00f3, hogy a bo\u00e1k \u00e9s pitonok eset\u00e9ben egy eg\u00e9sz minim\u00e1lis h\u00e1ts\u00f3 f\u00fcggeszt\u0151\u00f6v, egy tot\u00e1lisan elcs\u00f6kev\u00e9nyesedett, de beazonos\u00edthat\u00f3 h\u00e1ts\u00f3 v\u00e9gtagmaradv\u00e1nnyal az\u00e9rt kialakul a fejl\u0151d\u00e9s sor\u00e1n.) \u00a0<\/p>\n<p><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2016\/10\/zrs_snake_3a.jpg\" alt=\"zrs_snake_3a.jpg\" class=\"imgnotext open-in-modal\" \/><\/p>\n<p>Mi\u00e9rt van ez? A jelek szerint mert egy 17 b\u00e1zisp\u00e1r (bp)\u00a0hossz\u00fas\u00e1g\u00fa del\u00e9ci\u00f3 jelent meg a ZRS k\u00f6zep\u00e9ben a k\u00edgy\u00f3kban (illetve bizonyos fajokban enn\u00e9l is hosszabb szakasz hi\u00e1nyzik). Hogy mennyire ez az ok, azt j\u00f3l mutatja, hogy a piton szekvenci\u00e1ba (ami term\u00e9szetesen az\u00e9rt a kb 800 bp hossz\u00fas\u00e1g\u00fa ZRS egy\u00e9b\u00a0pontjain is k\u00fcl\u00f6n\u00f6zik az eg\u00e9r ZRS-t\u0151l) elegend\u0151 ezt a 17 bp-t besz\u00farni es egyb\u0151l funkcion\u00e1lis lesz: mind a <i>Shh<\/i> expresszi\u00f3t a megfelel\u0151 m\u00f3don fogja vez\u00e9relni, mind a v\u00e9gtagfejl\u0151d\u00e9s hiba n\u00e9lk\u00fcl lezajlik.<\/p>\n<p><img src=\"https:\/\/m.blog.hu\/cr\/criticalbiomass\/post-image\/2016\/10\/zrs_snake_4.jpeg\" alt=\"zrs_snake_4.jpeg\" class=\"imgnotext open-in-modal\" \/><\/p>\n<p>Vagyis egy hihetetlen\u00fcl eleg\u00e1ns bizony\u00edt\u00e9k\u00e1t t\u00e1lalt\u00e1k a szerz\u0151k a kor\u00e1bban csak a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 eredm\u00e9nyek korrel\u00e1ci\u00f3ja alapj\u00e1n fel\u00e1ll\u00edtott hipot\u00e9zisnek, miszerint egy szab\u00e1lyoz\u00f3 szekvencia degrad\u00e1ci\u00f3ja\/elvesz\u0151d\u00e9se okozta az <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2015\/07\/25\/kilog_a_kigyolab_499\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">evol\u00faci\u00f3 sor\u00e1n<\/a> a h\u00e1ts\u00f3 v\u00e9gtag elveszt\u00e9s\u00e9t a h\u00fcll\u0151k ezen csoportj\u00e1ban. (Tegy\u00fck hozz\u00e1, hogy ha a CRISPR csak olyan evodevos k\u00eds\u00e9rletekhez, mint ez, vagy a <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2015\/12\/13\/hox_genek_es_izelt_labak\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">m\u00faltkori \u00edzeltl\u00e1b\u00fa Hox-os sztori <\/a>lenne j\u00f3, akkor is meg\u00e9rdemeln\u00e9 a hype-ot, de persze messze nem ez a helyzet.)\u00a0<\/p>\n<p>R\u00e1ad\u00e1sul ez egyfajta k\u00f6zvetett magyar\u00e1zatot is ad arra, hogy mik\u00e9pp j\u00f6hetnek l\u00e9tre a bizarr <a href=\"http:\/\/criticalbiomass.blog.hu\/2009\/12\/12\/kilog_a_kigyolab_1\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">k\u00edgy\u00f3l\u00e1b atavizmusok<\/a>. Elegend\u0151 ha a ZRS-ben olyan spont\u00e1n mut\u00e1ci\u00f3k jelennek meg, amelyek\u00a0valamelyest kompenz\u00e1lnak a hi\u00e1nyz\u00f3 17 b\u00e1zisp\u00e1r\u00e9rt \u00e9s a fejl\u0151d\u00e9si program t\u00f6bbi eleme m\u00e1r aktiv\u00e1lhat\u00f3 is lesz.\u00a0<\/p>\n<hr \/>\n<p><span size=\"1\" style=\"font-size: xx-small;\"> <b>Kvon EZ, Kamneva OK, Melo1 US, Barozzi I, Osterwalder M, et al.<\/b> (2016) Progressive Loss of Function in a Limb Enhancer during Snake Evolution. <i>Cell<\/i> <b>167(3)<\/b>: 633\u2013642.e11. <\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Ha van olyan t\u00e9ma, ami igaz\u00e1n k\u00f6zel \u00e1ll a sz\u00edvemhez, a v\u00e9gtagok evol\u00faci\u00f3ja biztos az. M\u00e1r a blog legeslegels\u0151 posztja is ezzel a t\u00e9m\u00e1val foglalkozott, n\u00e9vszerint mik\u00e9ppen veszt(h)ett\u00e9k el a k\u00edgy\u00f3k a v\u00e9gtagjaikat az evol\u00faci\u00f3 sor\u00e1n, de val\u00f3sz\u00edn\u0171leg egyik legt\u00f6bbet &hellip; <a href=\"https:\/\/criticalbiomass.hu\/?p=11828435\">Egy kattint\u00e1s ide a folytat\u00e1shoz&#8230;. <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[3,1],"tags":[32,5],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/11828435"}],"collection":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=11828435"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/11828435\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=11828435"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=11828435"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/criticalbiomass.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=11828435"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}